MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 1093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TTA	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017177	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017177	GAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017177	TCT	2	6	1153	1158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017177	TCT	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017177	CTC	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017177	CAT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017177	ATT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017177	TTC	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017177	TTA	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017177	AAG	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017177	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017177	TAT	2	6	1763	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017177	ATA	3	9	2338	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017177	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017177	TTA	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	TGA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017177	TAT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017177	ATT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017177	TAT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017177	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017177	ATA	2	6	4333	4338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017177	TAT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017177	TAA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017177	AAT	2	6	5423	5428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017177	TAA	2	6	5480	5485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017177	TAA	3	9	5488	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017177	GAG	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017177	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017177	ATC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017177	TAT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017177	ATA	2	6	6386	6391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017177	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017177	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017177	AGG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017177	TAT	2	6	9246	9251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017177	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017177	TAT	2	6	9274	9279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017177	ATT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017177	ATG	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017177	GAG	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017177	ATA	2	6	9870	9875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017177	TAT	2	6	9908	9913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017177	TAA	2	6	10581	10586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017177	AGG	2	6	10756	10761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017177	GGA	2	6	12711	12716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017177	TAT	2	6	13179	13184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017177	ACA	2	6	13228	13233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017177	TTA	2	6	13297	13302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017177	GGA	2	6	13348	13353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017177	ATT	2	6	13692	13697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017177	CTT	2	6	13704	13709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017177	ATC	2	6	13782	13787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017177	TAA	2	6	13888	13893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017177	ATA	2	6	13974	13979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017177	TAA	2	6	14028	14033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017177	AAT	2	6	14103	14108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017177	AGG	2	6	15142	15147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017177	ATT	3	9	15148	15156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017177	ACT	2	6	16151	16156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017177	TTA	2	6	16187	16192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017177	ATT	2	6	24668	24673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017177	AAT	2	6	24743	24748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017177	ATT	2	6	24817	24822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017177	TAG	2	6	24856	24861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017177	ATA	2	6	24865	24870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017177	CTT	2	6	25897	25902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017177	ATA	2	6	25978	25983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017177	CCT	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017177	ATT	2	6	27386	27391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017177	TAA	2	6	27445	27450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017177	ATT	2	6	28365	28370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017177	TAT	2	6	28371	28376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017177	TAA	2	6	28388	28393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017177	AAT	3	9	28418	28426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017177	AGG	2	6	28436	28441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017177	AGG	2	6	28935	28940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017177	ATA	2	6	28971	28976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017177	TTA	2	6	29035	29040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017177	GAA	2	6	29075	29080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017177	TAA	2	6	30553	30558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017177	TAA	2	6	30564	30569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017177	TTG	2	6	30571	30576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017177	TAT	2	6	30605	30610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017177	AGT	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017177	AGT	2	6	32442	32447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017177	TAA	2	6	32510	32515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017177	ATT	2	6	32889	32894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017177	AGG	2	6	32947	32952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017177	ATT	2	6	33278	33283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017177	TAA	2	6	36046	36051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017177	ATA	2	6	36074	36079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017177	TAT	2	6	36080	36085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017177	CAA	2	6	36147	36152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017177	ACA	2	6	36196	36201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017177	GTA	2	6	36626	36631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017177	ATT	2	6	36690	36695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017177	GAA	2	6	36797	36802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017177	TAA	2	6	36818	36823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017177	TAA	3	9	36838	36846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017177	AAT	2	6	36873	36878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017177	ATA	2	6	36882	36887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017177	ATT	3	9	36982	36990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017177	TAA	2	6	37017	37022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017177	TAA	2	6	37067	37072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017177	TAA	2	6	37126	37131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017177	TTA	2	6	37854	37859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017177	GTA	2	6	37883	37888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017177	ACC	2	6	37928	37933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017177	TGT	2	6	37936	37941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017177	CCA	2	6	37970	37975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017177	ATT	2	6	38475	38480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017177	TAA	2	6	38544	38549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017177	TCC	2	6	39095	39100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017177	ATT	2	6	39130	39135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017177	ATA	2	6	39218	39223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017177	TAT	2	6	40059	40064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017177	TTA	2	6	40074	40079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017177	ATT	2	6	40275	40280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017177	TTG	2	6	40419	40424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017177	TTA	2	6	40487	40492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017177	GGT	2	6	40579	40584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017177	TAT	2	6	40627	40632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017177	ATA	2	6	40687	40692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017177	TGG	2	6	40902	40907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017177	AGT	2	6	40923	40928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017177	CCA	2	6	40944	40949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017177	ATT	2	6	40974	40979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017177	AGA	2	6	41113	41118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017177	AAC	2	6	41123	41128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017177	TTA	2	6	41212	41217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017177	TAA	2	6	41257	41262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017177	CTA	2	6	41268	41273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017177	GAA	2	6	41508	41513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017177	CTT	2	6	41519	41524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017177	TAA	2	6	41540	41545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017177	TAA	2	6	41669	41674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017177	TAC	2	6	42241	42246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017177	AGG	2	6	42309	42314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017177	TAA	2	6	42859	42864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017177	ATT	2	6	42868	42873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_017177	GAT	2	6	43103	43108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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