MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 1261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
2	NC_017177	AT	4	8	189	196	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
3	NC_017177	AT	5	10	380	389	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
4	NC_017177	TA	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
5	NC_017177	TA	3	6	668	673	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
6	NC_017177	TA	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017177	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017177	AT	4	8	2125	2132	50 %	50 %	0 %	0 %	384359040
9	NC_017177	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
10	NC_017177	TA	4	8	2771	2778	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
11	NC_017177	GA	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	384359041
12	NC_017177	TA	4	8	3103	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
13	NC_017177	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017177	AT	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017177	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017177	TA	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	AT	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20	NC_017177	TC	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	384359042
21	NC_017177	TA	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	384359042
22	NC_017177	TA	3	6	4309	4314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017177	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017177	AT	3	6	5859	5864	50 %	50 %	0 %	0 %	384359044
25	NC_017177	TA	3	6	6046	6051	50 %	50 %	0 %	0 %	384359045
26	NC_017177	TA	3	6	6091	6096	50 %	50 %	0 %	0 %	384359045
27	NC_017177	CT	3	6	6164	6169	0 %	50 %	0 %	50 %	384359045
28	NC_017177	TA	3	6	6176	6181	50 %	50 %	0 %	0 %	384359045
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52	NC_017177	AT	3	6	12757	12762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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116	NC_017177	TA	3	6	28412	28417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_017177	TA	5	10	30219	30228	50 %	50 %	0 %	0 %	384359068
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129	NC_017177	AG	3	6	31673	31678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017177	AT	3	6	32926	32931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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