MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TA	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017177	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017177	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017177	AT	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017177	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017177	TA	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017177	AT	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017177	TA	3	6	4309	4314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017177	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017177	AT	3	6	6441	6446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017177	AT	3	6	7166	7171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017177	AT	3	6	7194	7199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017177	TA	3	6	7212	7217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017177	AT	3	6	9250	9255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16	NC_017177	AT	3	6	9335	9340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	TA	3	6	10608	10613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017177	AT	3	6	10658	10663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21	NC_017177	CT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017177	TA	3	6	13249	13254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017177	AT	4	8	13901	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017177	TA	3	6	13945	13950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017177	AT	3	6	13958	13963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017177	TA	3	6	14095	14100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017177	AT	3	6	16115	16120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017177	TA	3	6	16167	16172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017177	TA	3	6	16199	16204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017177	TA	3	6	16217	16222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33	NC_017177	AT	3	6	25968	25973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76	NC_017177	TA	3	6	49992	49997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.