MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017176	ATTA	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017176	GAAA	2	8	6191	6198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017176	TAAT	2	8	10860	10867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017176	AAGG	2	8	15820	15827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017176	CAAT	2	8	19485	19492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017176	AATC	2	8	19671	19678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017176	AAAT	2	8	19803	19810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017176	CATC	2	8	20055	20062	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017176	CTTT	2	8	20343	20350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017176	TAAA	3	12	20412	20423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017176	TTTA	2	8	20457	20464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017176	TAAA	2	8	20581	20588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017176	TATT	2	8	27488	27495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017176	AATT	2	8	28881	28888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017176	TAAA	2	8	28941	28948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017176	TTAT	2	8	28949	28956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017176	ATTA	2	8	29136	29143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017176	ATAA	2	8	29762	29769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017176	TACG	2	8	29909	29916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017176	AATC	2	8	30198	30205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017176	AATA	2	8	30230	30237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017176	ATGA	2	8	30742	30749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017176	TAAT	2	8	32660	32667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017176	AATT	2	8	32692	32699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017176	AATT	2	8	34637	34644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017176	ATTA	2	8	34769	34776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017176	TAAA	3	12	34802	34813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017176	TAAA	2	8	35224	35231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017176	TAAA	2	8	35241	35248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017176	ATGT	2	8	37281	37288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017176	AAAG	2	8	37306	37313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017176	ATGA	2	8	37711	37718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017176	TTTA	2	8	40567	40574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017176	AAAT	2	8	41067	41074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017176	TAAT	2	8	41333	41340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.