MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017176	A	6	6	367	372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017176	A	7	7	1344	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017176	A	6	6	10891	10896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017176	A	7	7	17333	17339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017176	T	8	8	17818	17825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017176	T	6	6	17848	17853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017176	T	6	6	17863	17868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017176	A	7	7	17884	17890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017176	A	6	6	19876	19881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017176	A	7	7	20323	20329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017176	T	6	6	20489	20494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017176	T	7	7	20549	20555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017176	A	7	7	20586	20592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017176	A	6	6	21504	21509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017176	T	6	6	22712	22717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017176	T	6	6	22797	22802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017176	T	6	6	22817	22822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017176	A	8	8	22877	22884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017176	T	7	7	23402	23408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017176	T	7	7	23815	23821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017176	T	6	6	23855	23860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017176	A	7	7	23888	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017176	T	7	7	27464	27470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017176	A	6	6	27476	27481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017176	T	6	6	27558	27563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017176	T	6	6	28800	28805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017176	T	6	6	28873	28878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017176	A	6	6	28897	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017176	A	6	6	28984	28989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017176	T	6	6	29746	29751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017176	A	6	6	29796	29801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017176	A	6	6	30009	30014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017176	A	6	6	30145	30150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017176	A	7	7	30187	30193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017176	A	6	6	30671	30676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017176	A	6	6	30691	30696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017176	A	6	6	30698	30703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017176	A	6	6	34462	34467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017176	A	7	7	34537	34543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017176	A	7	7	34597	34603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017176	A	7	7	34681	34687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017176	A	6	6	37688	37693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017176	A	6	6	38507	38512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017176	A	6	6	38514	38519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017176	A	6	6	39099	39104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017176	A	6	6	39186	39191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017176	T	6	6	39217	39222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017176	A	7	7	41351	41357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017176	T	9	9	41401	41409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017176	A	6	6	41437	41442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017176	T	6	6	41446	41451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017176	A	7	7	41578	41584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.