MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 plasmid pMDR-ZJ06

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017172	TGC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017172	ACC	2	6	78	83	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017172	GCA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145111
4	NC_017172	GGC	2	6	303	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145111
5	NC_017172	TTC	2	6	316	321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145111
6	NC_017172	GGT	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145111
7	NC_017172	ATC	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017172	AGC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
9	NC_017172	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145112
10	NC_017172	GCG	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145112
11	NC_017172	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
12	NC_017172	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145113
13	NC_017172	TGG	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145113
14	NC_017172	GTT	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
15	NC_017172	TGA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
16	NC_017172	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145113
17	NC_017172	GTT	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
18	NC_017172	ACG	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145113
19	NC_017172	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145113
20	NC_017172	ATG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
21	NC_017172	GAT	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017172	CAC	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017172	GAC	2	6	1956	1961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145114
24	NC_017172	TCA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
25	NC_017172	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
26	NC_017172	TTC	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145114
27	NC_017172	GTG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145114
28	NC_017172	CAT	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
29	NC_017172	CAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
30	NC_017172	AAC	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
31	NC_017172	ATG	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017172	GGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017172	ATC	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017172	CAT	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017172	ATA	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145115
36	NC_017172	TGG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145115
37	NC_017172	GTT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
38	NC_017172	TGA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
39	NC_017172	CTT	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145115
40	NC_017172	GTT	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
41	NC_017172	ACG	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145115
42	NC_017172	GGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145115
43	NC_017172	ATG	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
44	NC_017172	GAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
45	NC_017172	CAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145116
46	NC_017172	AGA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145116
47	NC_017172	ACA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
48	NC_017172	GTA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
49	NC_017172	ATT	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145116
50	NC_017172	AAC	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
51	NC_017172	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
52	NC_017172	CAG	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145116
53	NC_017172	TGC	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145116
54	NC_017172	ATC	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017172	CAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
56	NC_017172	TTG	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145118
57	NC_017172	GAT	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145118
58	NC_017172	TAC	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
59	NC_017172	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145119
60	NC_017172	AAC	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145119
61	NC_017172	TGA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
62	NC_017172	TGC	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
63	NC_017172	GCA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
64	NC_017172	GAA	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
65	NC_017172	CAG	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
66	NC_017172	GAC	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
67	NC_017172	CGC	2	6	5837	5842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
68	NC_017172	CTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
69	NC_017172	GAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
70	NC_017172	GCC	2	6	6067	6072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
71	NC_017172	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145120
72	NC_017172	AGC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
73	NC_017172	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145120
74	NC_017172	GCA	3	9	6423	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
75	NC_017172	GCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
76	NC_017172	GCC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
77	NC_017172	GAT	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
78	NC_017172	ACA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
79	NC_017172	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
80	NC_017172	ACT	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145121
81	NC_017172	CTC	2	6	7407	7412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017172	GAT	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017172	TTA	2	6	7430	7435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017172	AAT	2	6	7486	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017172	GCT	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145122
86	NC_017172	GAT	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145122
87	NC_017172	TCT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
88	NC_017172	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145122
89	NC_017172	CTT	2	6	8189	8194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
90	NC_017172	ATT	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145122
91	NC_017172	ACG	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
92	NC_017172	GCA	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
93	NC_017172	TTG	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145122
94	NC_017172	CAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145122
95	NC_017172	AAT	2	6	8618	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017172	TGA	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
97	NC_017172	ATA	2	6	8750	8755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145123
98	NC_017172	TCA	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
99	NC_017172	TGA	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
100	NC_017172	TAT	2	6	9169	9174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145123
101	NC_017172	TCA	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
102	NC_017172	TCT	2	6	9314	9319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145123
103	NC_017172	GTC	2	6	9402	9407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145123
104	NC_017172	CAG	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
105	NC_017172	TCA	3	9	9516	9524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
106	NC_017172	CTT	3	9	9555	9563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145123
107	NC_017172	ACC	2	6	9586	9591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145123
108	NC_017172	TTG	2	6	9775	9780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145123
109	NC_017172	GCA	2	6	9791	9796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
110	NC_017172	ACT	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
111	NC_017172	TCA	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
112	NC_017172	TAA	2	6	10110	10115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145123
113	NC_017172	GCA	2	6	10163	10168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017172	TCC	2	6	10208	10213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017172	ACA	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017172	CCA	2	6	10360	10365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017172	AAG	2	6	10474	10479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017172	ACC	2	6	10564	10569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145124
119	NC_017172	GTA	2	6	10574	10579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
120	NC_017172	CTG	2	6	10593	10598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
121	NC_017172	ATA	2	6	10599	10604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145124
122	NC_017172	AGT	2	6	10771	10776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
123	NC_017172	TCT	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
124	NC_017172	TTC	2	6	10863	10868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
125	NC_017172	CAA	2	6	10941	10946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145124
126	NC_017172	CTT	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
127	NC_017172	GCT	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
128	NC_017172	TCT	2	6	11305	11310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
129	NC_017172	GCG	2	6	11311	11316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145124
130	NC_017172	TCT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
131	NC_017172	ATC	2	6	11419	11424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145124
132	NC_017172	CAA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145124
133	NC_017172	GCA	2	6	11461	11466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145124
134	NC_017172	ATT	2	6	11499	11504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145124
135	NC_017172	GGT	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145125
136	NC_017172	ATT	2	6	11859	11864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145125
137	NC_017172	TTG	2	6	11951	11956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017172	GAA	2	6	12054	12059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017172	TGT	2	6	12170	12175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017172	TAA	3	9	12257	12265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017172	CAC	2	6	12352	12357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017172	TAC	2	6	12670	12675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145126
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147	NC_017172	AAT	2	6	13001	13006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145126
148	NC_017172	AAT	2	6	13068	13073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145126
149	NC_017172	TCT	2	6	13098	13103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145126
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151	NC_017172	CAA	2	6	13125	13130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145126
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153	NC_017172	AAC	2	6	13177	13182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145126
154	NC_017172	AAC	2	6	13309	13314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017172	AAG	2	6	13350	13355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017172	GTT	2	6	13470	13475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017172	TCA	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145127
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161	NC_017172	TTC	2	6	13821	13826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145127
162	NC_017172	CGT	2	6	13887	13892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145127
163	NC_017172	TCG	2	6	14009	14014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145127
164	NC_017172	AAC	2	6	14199	14204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145127
165	NC_017172	CGG	2	6	14307	14312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145127
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167	NC_017172	ACC	2	6	14381	14386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_017172	CTC	2	6	14393	14398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_017172	TAA	2	6	14482	14487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017172	GTC	2	6	14592	14597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145128
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195	NC_017172	CCG	2	6	16682	16687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145130
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212	NC_017172	ATA	2	6	17768	17773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_017172	ACG	2	6	18809	18814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145133
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239	NC_017172	CTT	2	6	19759	19764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145135
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241	NC_017172	TGA	2	6	19873	19878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145135
242	NC_017172	CAA	2	6	19990	19995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145135
243	NC_017172	CTT	2	6	19999	20004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145135
244	NC_017172	GCA	2	6	20013	20018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145135
245	NC_017172	TAC	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145135
246	NC_017172	AGC	2	6	20126	20131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145135
247	NC_017172	ATG	2	6	20175	20180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145135
248	NC_017172	CTG	2	6	20222	20227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145135
249	NC_017172	TGC	3	9	20239	20247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145135
250	NC_017172	TGC	2	6	20258	20263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.