MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 chromosome

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017171	TAAATT	2	12	6913	6924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017171	TAAATT	2	12	7090	7101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017171	AAATCA	2	12	7180	7191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017171	TTTAAA	2	12	26756	26767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017171	TTTAAA	2	12	26896	26907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017171	AAATTT	2	12	27105	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017171	AAAAAT	2	12	30979	30990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017171	GAAATC	2	12	43629	43640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017171	AGAAAA	2	12	58683	58694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017171	ATAAAA	2	12	60940	60951	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017171	AAAAAG	2	12	65433	65444	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017171	TATTTT	2	12	68568	68579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017171	TAATCT	2	12	78701	78712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017171	TAAGCA	2	12	78798	78809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017171	CACATC	2	12	79208	79219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017171	TTATGG	2	12	89004	89015	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017171	TTTTGT	2	12	93635	93646	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017171	TCCTGT	2	12	123466	123477	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017171	TCCTGT	2	12	124647	124658	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017171	TCCTGT	2	12	125552	125563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017171	AATTTA	2	12	131132	131143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017171	AATTTT	2	12	156687	156698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017171	ATTAAA	2	12	157756	157767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017171	TTTATG	2	12	157874	157885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017171	TAATTA	2	12	158319	158330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017171	ATAAAT	2	12	180048	180059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017171	TTCAAT	2	12	189009	189020	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017171	ATTGAC	2	12	197057	197068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017171	AATTTT	2	12	217956	217967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017171	GAAATC	2	12	222516	222527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017171	CAAGTT	2	12	227717	227728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017171	GATATT	2	12	292000	292011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017171	TCAGAA	2	12	391622	391633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017171	ATTTTT	2	12	400083	400094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017171	ACTCAA	2	12	428473	428484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017171	TATAAA	2	12	476970	476981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017171	ATTCAT	2	12	492189	492200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017171	GTTTTT	2	12	516683	516694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017171	AATTTT	2	12	528560	528571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017171	TCAAAA	2	12	553865	553876	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017171	TAAAAA	2	12	570611	570622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017171	TAAATA	2	12	649130	649141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017171	CAAGTG	2	12	684016	684027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017171	GAAAAA	2	12	684273	684284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017171	GAAATC	2	12	720740	720751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017171	TTTTTC	2	12	726550	726561	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017171	ATTGGT	2	12	758324	758335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017171	TAAAAT	2	12	791298	791309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017171	ATTCTT	2	12	798806	798817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017171	AATTTA	2	12	820455	820466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017171	AAAGAA	2	12	861227	861238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017171	AATTTA	2	12	900922	900933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017171	ACCTGT	2	12	908280	908291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017171	AACTAT	2	12	958374	958385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017171	ACTTTT	2	12	1008591	1008602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017171	TATAAT	2	12	1008637	1008648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017171	GTTACT	2	12	1066660	1066671	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017171	AACGTA	2	12	1066715	1066726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017171	TTGATA	2	12	1068374	1068385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017171	TAAATA	2	12	1114872	1114883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017171	ATATTT	2	12	1114890	1114901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017171	ATTCAA	2	12	1122292	1122303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017171	AGAATT	2	12	1179058	1179069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017171	TAAAAA	2	12	1188450	1188461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017171	TTTTAT	2	12	1188480	1188491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017171	TATTTT	2	12	1192988	1192999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017171	TTTTAA	2	12	1216616	1216627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017171	ATATTT	2	12	1216810	1216821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017171	TAAAAA	2	12	1241749	1241760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017171	CTTTTT	2	12	1241914	1241925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017171	CAATGT	2	12	1272411	1272422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017171	TTTTAA	2	12	1321477	1321488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017171	GAAATG	2	12	1332330	1332341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017171	AAATAT	2	12	1333345	1333356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017171	CATTAA	2	12	1357733	1357744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017171	GTGATT	2	12	1358000	1358011	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017171	TAAATA	2	12	1376870	1376881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017171	AAAGTG	2	12	1395837	1395848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017171	TAAAAA	2	12	1416075	1416086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017171	TAAAAA	2	12	1418595	1418606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017171	AAATTG	2	12	1421361	1421372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017171	CAATTA	2	12	1428006	1428017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017171	TAAAAA	2	12	1433010	1433021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017171	TAATCA	2	12	1465641	1465652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017171	ATTGAG	2	12	1465690	1465701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017171	CATTTG	2	12	1492062	1492073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017171	TTATTT	2	12	1507108	1507119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017171	AAATTT	2	12	1567276	1567287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017171	TAAAAA	2	12	1589463	1589474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017171	TGTTTT	2	12	1650055	1650066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017171	TAAAAT	2	12	1670275	1670286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017171	TAAGTG	2	12	1695331	1695342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017171	AGATAA	2	12	1700857	1700868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017171	TAAAAA	2	12	1702103	1702114	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017171	AAAAAT	2	12	1702259	1702270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017171	TAAAAA	2	12	1731661	1731672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017171	ATATAG	2	12	1753789	1753800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017171	AAATAA	2	12	1754014	1754025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017171	TAATCA	2	12	1763089	1763100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017171	TTATTT	2	12	1772497	1772508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017171	TTTAAT	2	12	1787133	1787144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017171	CTTGAG	2	12	1788416	1788427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017171	ATTTGT	2	12	1810609	1810620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017171	TAATAT	2	12	1883109	1883120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017171	ATTGTT	2	12	1893760	1893771	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017171	AAAAAT	2	12	1896712	1896723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017171	ATTATC	2	12	1911460	1911471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017171	GCTAGG	2	12	1926804	1926815	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017171	AATTTA	2	12	1928777	1928788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017171	AAAAAT	2	12	1962690	1962701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017171	TAAACG	2	12	2054827	2054838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017171	GTAAGC	2	12	2054901	2054912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017171	TAGAAC	2	12	2055052	2055063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017171	TACATC	2	12	2055221	2055232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017171	TCAATT	2	12	2061658	2061669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017171	AAGCAA	2	12	2082381	2082392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017171	GTTATA	2	12	2101717	2101728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017171	CTTATT	2	12	2104266	2104277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017171	ATACAT	2	12	2106327	2106338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017171	TTTTAA	2	12	2142484	2142495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017171	TCCTTT	2	12	2144140	2144151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017171	CATAGC	2	12	2296978	2296989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017171	AAAAAT	2	12	2311358	2311369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017171	ATTTAA	2	12	2337301	2337312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017171	AATTAA	2	12	2341074	2341085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017171	ATTAAT	2	12	2393347	2393358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017171	TAAAAA	2	12	2435845	2435856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017171	TAAAAA	2	12	2436176	2436187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017171	TTTTTA	2	12	2478572	2478583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017171	AATAAA	2	12	2503855	2503866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.