MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 chromosome

Total Repeats: 1657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017171	TGTAGA	2	12	3608938	3608949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384144749
1502	NC_017171	CGTTTA	2	12	3610763	3610774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384144749
1503	NC_017171	ACCTCA	2	12	3613301	3613312	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384144753
1504	NC_017171	AGCCAT	2	12	3614225	3614236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017171	TTTAGT	2	12	3614952	3614963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384144755
1506	NC_017171	AATGCA	2	12	3617237	3617248	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1507	NC_017171	AACCTA	2	12	3618403	3618414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384144759
1508	NC_017171	ACGTAA	2	12	3618599	3618610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384144759
1509	NC_017171	ATTAAA	2	12	3625539	3625550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384144764
1510	NC_017171	CTTTAT	2	12	3627611	3627622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1511	NC_017171	AATTTA	2	12	3627837	3627848	50 %	50 %	0 %	0 %	384144767
1512	NC_017171	GTAAAG	2	12	3632275	3632286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384144772
1513	NC_017171	CTAAAG	2	12	3638013	3638024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384144776
1514	NC_017171	GCTGAA	2	12	3639180	3639191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384144779
1515	NC_017171	AAAATT	2	12	3639919	3639930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384144780
1516	NC_017171	CTAAAA	2	12	3641176	3641187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384144782
1517	NC_017171	TGCTTC	2	12	3643403	3643414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384144783
1518	NC_017171	CGCGTA	2	12	3643458	3643469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384144783
1519	NC_017171	TTTATA	2	12	3646000	3646011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017171	CAATCA	2	12	3646505	3646516	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384144787
1521	NC_017171	CTTCTG	2	12	3646959	3646970	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384144788
1522	NC_017171	AAAATA	2	12	3649022	3649033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017171	CAACAC	2	12	3650221	3650232	50 %	0 %	0 %	50 %	384144791
1524	NC_017171	TTTTAC	2	12	3660075	3660086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1525	NC_017171	ATTAAT	2	12	3669120	3669131	50 %	50 %	0 %	0 %	384144810
1526	NC_017171	ATATTC	2	12	3673361	3673372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384144815
1527	NC_017171	GCAATT	2	12	3676848	3676859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384144817
1528	NC_017171	TCAACC	2	12	3680718	3680729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384144818
1529	NC_017171	CATTTA	2	12	3684121	3684132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384144821
1530	NC_017171	TTGTGG	2	12	3684557	3684568	0 %	50 %	50 %	0 %	384144821
1531	NC_017171	TTTCTT	2	12	3686005	3686016	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384144823
1532	NC_017171	GTTAAA	2	12	3689102	3689113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384144826
1533	NC_017171	AATAAA	2	12	3690474	3690485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384144826
1534	NC_017171	ATACCG	2	12	3691886	3691897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384144829
1535	NC_017171	AGCTTG	2	12	3694391	3694402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384144831
1536	NC_017171	CACGGT	2	12	3694588	3694599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384144831
1537	NC_017171	ATTGGC	2	12	3697385	3697396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384144832
1538	NC_017171	TAAAGC	2	12	3698499	3698510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384144835
1539	NC_017171	AAATTG	2	12	3699357	3699368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384144836
1540	NC_017171	TTTATC	2	12	3699388	3699399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384144836
1541	NC_017171	GGCTAA	2	12	3699811	3699822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384144836
1542	NC_017171	ACTTTT	2	12	3700083	3700094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1543	NC_017171	TATTTT	2	12	3700106	3700117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017171	GAAAAT	2	12	3700463	3700474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384144837
1545	NC_017171	TACATA	2	12	3704421	3704432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384144841
1546	NC_017171	CCAGTT	2	12	3708388	3708399	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384144845
1547	NC_017171	CTGTTC	2	12	3709532	3709543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384144845
1548	NC_017171	GTAGGC	2	12	3713140	3713151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384144847
1549	NC_017171	GCAACA	2	12	3713938	3713949	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384144847
1550	NC_017171	ATCTTT	2	12	3714606	3714617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1551	NC_017171	AGCTTT	2	12	3714707	3714718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384144849
1552	NC_017171	TTATGG	2	12	3716806	3716817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384144855
1553	NC_017171	TAAAAA	2	12	3721298	3721309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017171	GCCCCT	2	12	3721329	3721340	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_017171	TTTGCT	2	12	3722580	3722591	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384144861
1556	NC_017171	CTAAAA	2	12	3722640	3722651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384144861
1557	NC_017171	TGCTTC	2	12	3726266	3726277	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384144862
1558	NC_017171	AGACCA	2	12	3727199	3727210	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017171	CGCGCT	2	12	3731566	3731577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384144865
1560	NC_017171	CTTTTT	2	12	3742166	3742177	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1561	NC_017171	TTGAAA	2	12	3744869	3744880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384144884
1562	NC_017171	AAAATT	2	12	3752986	3752997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384144893
1563	NC_017171	ATTTAA	2	12	3754141	3754152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017171	TGGCTT	2	12	3757761	3757772	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384144898
1565	NC_017171	CTTTTT	2	12	3759540	3759551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384144901
1566	NC_017171	TAATTT	2	12	3761272	3761283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384144903
1567	NC_017171	GTCATG	2	12	3761332	3761343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384144903
1568	NC_017171	TTCCTG	2	12	3763019	3763030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017171	TTTAAA	2	12	3763114	3763125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017171	TTTAAA	2	12	3764326	3764337	50 %	50 %	0 %	0 %	384144906
1571	NC_017171	ATTTTT	2	12	3766058	3766069	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017171	CGCCTT	2	12	3771396	3771407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384144913
1573	NC_017171	CACATG	2	12	3773567	3773578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384144914
1574	NC_017171	AATTTA	2	12	3780696	3780707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017171	TAGATG	2	12	3783229	3783240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384144925
1576	NC_017171	CAAGGT	2	12	3784596	3784607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384144926
1577	NC_017171	ATTGAT	2	12	3784638	3784649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384144926
1578	NC_017171	AAAAAG	2	12	3784668	3784679	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384144926
1579	NC_017171	TCAGGT	2	12	3786012	3786023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384144926
1580	NC_017171	ATCAAT	2	12	3789026	3789037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384144929
1581	NC_017171	ATACCC	2	12	3793973	3793984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384144931
1582	NC_017171	CTGAAC	2	12	3800776	3800787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384144935
1583	NC_017171	TTTATT	2	12	3803077	3803088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017171	CTTTTA	2	12	3809850	3809861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1585	NC_017171	GTTTTA	2	12	3810909	3810920	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384144945
1586	NC_017171	TGATAT	2	12	3811517	3811528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384144945
1587	NC_017171	TTAAAT	2	12	3812713	3812724	50 %	50 %	0 %	0 %	384144947
1588	NC_017171	TGCTTG	2	12	3814574	3814585	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384144948
1589	NC_017171	CTGCCG	2	12	3818065	3818076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384144953
1590	NC_017171	CTAAAT	2	12	3818683	3818694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384144953
1591	NC_017171	ACGTCC	2	12	3820140	3820151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384144955
1592	NC_017171	TGCATG	2	12	3821064	3821075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384144955
1593	NC_017171	CAAAAA	2	12	3821439	3821450	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1594	NC_017171	TTTCAT	2	12	3823764	3823775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384144958
1595	NC_017171	ATGCAA	2	12	3826398	3826409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384144959
1596	NC_017171	AGCTGG	2	12	3829402	3829413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384144962
1597	NC_017171	TCATCT	2	12	3835463	3835474	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384144967
1598	NC_017171	GCACCT	2	12	3836282	3836293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384144967
1599	NC_017171	ACCGCC	2	12	3836428	3836439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384144967
1600	NC_017171	AACTTA	2	12	3845540	3845551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384144975
1601	NC_017171	CTAAAG	2	12	3849177	3849188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384144979
1602	NC_017171	TTTGGC	2	12	3849809	3849820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384144980
1603	NC_017171	CCTAAA	2	12	3852806	3852817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384144982
1604	NC_017171	TTAAAG	2	12	3853206	3853217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384144982
1605	NC_017171	TTTGCC	2	12	3854520	3854531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384144984
1606	NC_017171	AATGGA	2	12	3859538	3859549	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384144990
1607	NC_017171	TCATGA	2	12	3862094	3862105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384144992
1608	NC_017171	TTGTGC	2	12	3872142	3872153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384145000
1609	NC_017171	TCATTG	2	12	3872638	3872649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384145000
1610	NC_017171	TTGCGC	2	12	3879861	3879872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145006
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1612	NC_017171	TATATT	2	12	3887114	3887125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.