MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis A1122 plasmid unnamed

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017169	GCAG	2	8	147	154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017169	TGCT	2	8	159	166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017169	CGAT	2	8	764	771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017169	GGCT	2	8	1101	1108	0 %	25 %	50 %	25 %	384141140
5	NC_017169	GAAG	2	8	1221	1228	50 %	0 %	50 %	0 %	384141140
6	NC_017169	CATC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	0 %	50 %	384141140
7	NC_017169	TAAG	2	8	1805	1812	50 %	25 %	25 %	0 %	384141141
8	NC_017169	GTCA	2	8	1999	2006	25 %	25 %	25 %	25 %	384141141
9	NC_017169	CCAT	2	8	2070	2077	25 %	25 %	0 %	50 %	384141141
10	NC_017169	GATG	2	8	2935	2942	25 %	25 %	50 %	0 %	384141141
11	NC_017169	ATGA	2	8	3046	3053	50 %	25 %	25 %	0 %	384141141
12	NC_017169	CGCC	2	8	3191	3198	0 %	0 %	25 %	75 %	384141141
13	NC_017169	TAGG	2	8	3319	3326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017169	ACTT	2	8	3328	3335	25 %	50 %	0 %	25 %	384141142
15	NC_017169	GTGC	2	8	3648	3655	0 %	25 %	50 %	25 %	384141142
16	NC_017169	CCGA	2	8	4935	4942	25 %	0 %	25 %	50 %	384141143
17	NC_017169	CGCA	2	8	5004	5011	25 %	0 %	25 %	50 %	384141143
18	NC_017169	TTTG	2	8	5675	5682	0 %	75 %	25 %	0 %	384141144
19	NC_017169	ACTC	2	8	5999	6006	25 %	25 %	0 %	50 %	384141145
20	NC_017169	CGGA	2	8	6108	6115	25 %	0 %	50 %	25 %	384141145
21	NC_017169	TGTC	2	8	6587	6594	0 %	50 %	25 %	25 %	384141145
22	NC_017169	GCGG	2	8	6966	6973	0 %	0 %	75 %	25 %	384141147
23	NC_017169	CAGC	2	8	7489	7496	25 %	0 %	25 %	50 %	384141148
24	NC_017169	GCAA	2	8	7572	7579	50 %	0 %	25 %	25 %	384141148
25	NC_017169	CCAG	2	8	7950	7957	25 %	0 %	25 %	50 %	384141148
26	NC_017169	CTCG	2	8	8325	8332	0 %	25 %	25 %	50 %	384141149
27	NC_017169	TACT	3	12	8859	8870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017169	CTCG	2	8	9345	9352	0 %	25 %	25 %	50 %	384141150
29	NC_017169	AATC	2	8	9387	9394	50 %	25 %	0 %	25 %	384141150
30	NC_017169	AATA	2	8	10352	10359	75 %	25 %	0 %	0 %	384141150
31	NC_017169	CATC	2	8	11002	11009	25 %	25 %	0 %	50 %	384141152
32	NC_017169	ATTT	2	8	11891	11898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017169	ATAA	3	12	12042	12053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017169	AGCA	2	8	12336	12343	50 %	0 %	25 %	25 %	384141154
35	NC_017169	CCAA	2	8	12599	12606	50 %	0 %	0 %	50 %	384141154
36	NC_017169	AATC	2	8	12609	12616	50 %	25 %	0 %	25 %	384141154
37	NC_017169	TAAT	2	8	12739	12746	50 %	50 %	0 %	0 %	384141154
38	NC_017169	AAAG	2	8	13661	13668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017169	GCCA	2	8	13698	13705	25 %	0 %	25 %	50 %	384141156
40	NC_017169	GGTG	2	8	14310	14317	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017169	TTAC	2	8	14861	14868	25 %	50 %	0 %	25 %	384141158
42	NC_017169	ACCT	2	8	15507	15514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017169	TTGC	2	8	15651	15658	0 %	50 %	25 %	25 %	384141159
44	NC_017169	CTTC	2	8	15710	15717	0 %	50 %	0 %	50 %	384141159
45	NC_017169	CACG	2	8	15786	15793	25 %	0 %	25 %	50 %	384141159
46	NC_017169	ATCA	2	8	16245	16252	50 %	25 %	0 %	25 %	384141160
47	NC_017169	GCGT	2	8	16467	16474	0 %	25 %	50 %	25 %	384141160
48	NC_017169	TGCG	2	8	16831	16838	0 %	25 %	50 %	25 %	384141160
49	NC_017169	CGAG	2	8	17824	17831	25 %	0 %	50 %	25 %	384141161
50	NC_017169	AGCG	2	8	17999	18006	25 %	0 %	50 %	25 %	384141161
51	NC_017169	GCCA	2	8	18043	18050	25 %	0 %	25 %	50 %	384141161
52	NC_017169	TGCG	2	8	18189	18196	0 %	25 %	50 %	25 %	384141161
53	NC_017169	AGCC	2	8	19384	19391	25 %	0 %	25 %	50 %	384141162
54	NC_017169	TAAG	2	8	20194	20201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017169	CCTG	2	8	20624	20631	0 %	25 %	25 %	50 %	384141164
56	NC_017169	GAAA	2	8	21092	21099	75 %	0 %	25 %	0 %	384141164
57	NC_017169	CAAG	2	8	21494	21501	50 %	0 %	25 %	25 %	384141164
58	NC_017169	TCGT	2	8	21737	21744	0 %	50 %	25 %	25 %	384141165
59	NC_017169	TGTT	2	8	22437	22444	0 %	75 %	25 %	0 %	384141166
60	NC_017169	GCGT	2	8	22501	22508	0 %	25 %	50 %	25 %	384141166
61	NC_017169	GTTT	2	8	22916	22923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017169	ACCA	2	8	23141	23148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017169	AATG	2	8	24465	24472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017169	TGAA	2	8	24730	24737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017169	TGGT	2	8	24885	24892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017169	CAAC	2	8	25110	25117	50 %	0 %	0 %	50 %	384141169
67	NC_017169	TTAT	2	8	25961	25968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017169	CTGG	2	8	26540	26547	0 %	25 %	50 %	25 %	384141173
69	NC_017169	TCAT	2	8	26766	26773	25 %	50 %	0 %	25 %	384141173
70	NC_017169	CCCA	2	8	27236	27243	25 %	0 %	0 %	75 %	384141174
71	NC_017169	TACC	2	8	27264	27271	25 %	25 %	0 %	50 %	384141174
72	NC_017169	TTAC	2	8	27753	27760	25 %	50 %	0 %	25 %	384141174
73	NC_017169	TGAG	2	8	27777	27784	25 %	25 %	50 %	0 %	384141175
74	NC_017169	AGTA	2	8	27993	28000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017169	TCGC	2	8	28083	28090	0 %	25 %	25 %	50 %	384141176
76	NC_017169	AACA	2	8	29417	29424	75 %	0 %	0 %	25 %	384141178
77	NC_017169	TGGG	2	8	29521	29528	0 %	25 %	75 %	0 %	384141178
78	NC_017169	ATCC	2	8	30172	30179	25 %	25 %	0 %	50 %	384141178
79	NC_017169	GGGC	2	8	30192	30199	0 %	0 %	75 %	25 %	384141178
80	NC_017169	CAGC	2	8	30415	30422	25 %	0 %	25 %	50 %	384141179
81	NC_017169	TCAA	2	8	31017	31024	50 %	25 %	0 %	25 %	384141179
82	NC_017169	CAGA	2	8	31060	31067	50 %	0 %	25 %	25 %	384141179
83	NC_017169	CGAG	2	8	31498	31505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017169	TACT	2	8	31522	31529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017169	GGTT	2	8	31719	31726	0 %	50 %	50 %	0 %	384141180
86	NC_017169	GAAA	2	8	32020	32027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017169	GAAG	2	8	32046	32053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017169	TAAG	2	8	32973	32980	50 %	25 %	25 %	0 %	384141182
89	NC_017169	TCTG	2	8	34151	34158	0 %	50 %	25 %	25 %	384141185
90	NC_017169	CTGA	2	8	34350	34357	25 %	25 %	25 %	25 %	384141185
91	NC_017169	TGAG	2	8	34601	34608	25 %	25 %	50 %	0 %	384141185
92	NC_017169	CAGC	2	8	35096	35103	25 %	0 %	25 %	50 %	384141186
93	NC_017169	GAAT	2	8	35608	35615	50 %	25 %	25 %	0 %	384141186
94	NC_017169	GCGA	2	8	35663	35670	25 %	0 %	50 %	25 %	384141186
95	NC_017169	CGTT	2	8	35987	35994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017169	CAGT	2	8	37753	37760	25 %	25 %	25 %	25 %	384141187
97	NC_017169	GTCC	2	8	37789	37796	0 %	25 %	25 %	50 %	384141187
98	NC_017169	GGCA	2	8	38993	39000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017169	AGCG	2	8	39705	39712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017169	ATCC	2	8	40052	40059	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
101	NC_017169	CCAG	2	8	40222	40229	25 %	0 %	25 %	50 %	384141191
102	NC_017169	ATCC	2	8	40620	40627	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
103	NC_017169	CCAT	2	8	40673	40680	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
104	NC_017169	TCGG	2	8	41687	41694	0 %	25 %	50 %	25 %	384141194
105	NC_017169	GCTG	2	8	42243	42250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017169	ATGA	2	8	42409	42416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017169	CATT	2	8	42971	42978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017169	CTGC	2	8	43153	43160	0 %	25 %	25 %	50 %	384141197
109	NC_017169	GAAC	2	8	43962	43969	50 %	0 %	25 %	25 %	384141197
110	NC_017169	GAGG	2	8	44186	44193	25 %	0 %	75 %	0 %	384141197
111	NC_017169	TGAA	2	8	44240	44247	50 %	25 %	25 %	0 %	384141197
112	NC_017169	GCCT	2	8	44580	44587	0 %	25 %	25 %	50 %	384141198
113	NC_017169	CAAA	2	8	44694	44701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017169	TTTC	2	8	44885	44892	0 %	75 %	0 %	25 %	384141199
115	NC_017169	TTTC	2	8	45226	45233	0 %	75 %	0 %	25 %	384141199
116	NC_017169	GCAG	2	8	45407	45414	25 %	0 %	50 %	25 %	384141199
117	NC_017169	AACG	2	8	45566	45573	50 %	0 %	25 %	25 %	384141199
118	NC_017169	TACA	2	8	46997	47004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017169	CAGG	2	8	47745	47752	25 %	0 %	50 %	25 %	384141202
120	NC_017169	ACCA	2	8	48292	48299	50 %	0 %	0 %	50 %	384141203
121	NC_017169	TATT	2	8	49324	49331	25 %	75 %	0 %	0 %	384141204
122	NC_017169	CAGG	2	8	49333	49340	25 %	0 %	50 %	25 %	384141204
123	NC_017169	GCGG	2	8	49796	49803	0 %	0 %	75 %	25 %	384141205
124	NC_017169	TATG	2	8	50315	50322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017169	CTCG	2	8	50795	50802	0 %	25 %	25 %	50 %	384141207
126	NC_017169	ATTA	2	8	51284	51291	50 %	50 %	0 %	0 %	384141208
127	NC_017169	CTTA	2	8	51357	51364	25 %	50 %	0 %	25 %	384141208
128	NC_017169	CAGA	2	8	52170	52177	50 %	0 %	25 %	25 %	384141208
129	NC_017169	ATTG	2	8	52570	52577	25 %	50 %	25 %	0 %	384141208
130	NC_017169	AGTA	2	8	53003	53010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017169	CTGG	2	8	53443	53450	0 %	25 %	50 %	25 %	384141209
132	NC_017169	CAGC	2	8	53594	53601	25 %	0 %	25 %	50 %	384141209
133	NC_017169	GCCA	2	8	53810	53817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017169	CCTG	2	8	53873	53880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017169	CTTG	2	8	53923	53930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017169	CAGA	2	8	54303	54310	50 %	0 %	25 %	25 %	384141210
137	NC_017169	TATT	2	8	54592	54599	25 %	75 %	0 %	0 %	384141211
138	NC_017169	TCTG	2	8	54846	54853	0 %	50 %	25 %	25 %	384141211
139	NC_017169	GCTG	2	8	55066	55073	0 %	25 %	50 %	25 %	384141212
140	NC_017169	GCCA	2	8	57155	57162	25 %	0 %	25 %	50 %	384141214
141	NC_017169	GGTT	2	8	57843	57850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017169	CAGC	2	8	57879	57886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017169	GGCT	2	8	57961	57968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017169	CAAT	2	8	58229	58236	50 %	25 %	0 %	25 %	384141215
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.