MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 plasmid unnamed

Total Repeats: 1067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017169	TCA	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141140
2	NC_017169	ATC	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141140
3	NC_017169	CAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141140
4	NC_017169	CAG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141140
5	NC_017169	TCG	3	9	1534	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141140
6	NC_017169	CAG	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141140
7	NC_017169	CCA	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141140
8	NC_017169	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141140
9	NC_017169	GGA	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384141141
10	NC_017169	TGA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141141
11	NC_017169	CGA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
12	NC_017169	AGC	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
13	NC_017169	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141141
14	NC_017169	CAG	2	6	2137	2142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
15	NC_017169	GTG	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141141
16	NC_017169	ATC	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141141
17	NC_017169	GCA	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
18	NC_017169	AAT	2	6	2455	2460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141141
19	NC_017169	ATC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141141
20	NC_017169	ACG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
21	NC_017169	CAC	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141141
22	NC_017169	CGC	2	6	2601	2606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141141
23	NC_017169	TCC	2	6	2609	2614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384141141
24	NC_017169	GAC	3	9	2631	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
25	NC_017169	CTT	2	6	2664	2669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141141
26	NC_017169	TCG	3	9	2747	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141141
27	NC_017169	CAA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141141
28	NC_017169	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141141
29	NC_017169	TGC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141141
30	NC_017169	TCT	2	6	2865	2870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141141
31	NC_017169	CAA	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141141
32	NC_017169	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141141
33	NC_017169	TGA	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141141
34	NC_017169	CGT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141141
35	NC_017169	CCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141142
36	NC_017169	GCC	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141142
37	NC_017169	TCA	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141142
38	NC_017169	CTT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141142
39	NC_017169	GGA	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384141142
40	NC_017169	CGC	2	6	3642	3647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141142
41	NC_017169	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141142
42	NC_017169	GTA	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141142
43	NC_017169	TTC	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141142
44	NC_017169	GAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141142
45	NC_017169	CAC	2	6	4225	4230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141142
46	NC_017169	CAC	2	6	4245	4250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141142
47	NC_017169	TTC	2	6	4298	4303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141142
48	NC_017169	GTG	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141142
49	NC_017169	CTT	2	6	4429	4434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141142
50	NC_017169	ATG	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141142
51	NC_017169	GAC	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141142
52	NC_017169	TCA	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141143
53	NC_017169	TCA	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141143
54	NC_017169	TCA	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141143
55	NC_017169	TCG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141143
56	NC_017169	CGA	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141143
57	NC_017169	CTT	2	6	4902	4907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141143
58	NC_017169	TCG	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141143
59	NC_017169	ACG	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141143
60	NC_017169	TCC	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384141143
61	NC_017169	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141144
62	NC_017169	GGC	2	6	5513	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141144
63	NC_017169	CCA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141144
64	NC_017169	GCA	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141144
65	NC_017169	AGC	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141144
66	NC_017169	TGA	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141144
67	NC_017169	CAG	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
68	NC_017169	AGC	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
69	NC_017169	CCA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141145
70	NC_017169	TCG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141145
71	NC_017169	ACG	3	9	5985	5993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
72	NC_017169	CGA	2	6	6162	6167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
73	NC_017169	GAT	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141145
74	NC_017169	GTT	3	9	6282	6290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141145
75	NC_017169	GGT	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141145
76	NC_017169	TGG	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141145
77	NC_017169	CAG	3	9	6372	6380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
78	NC_017169	ACG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141145
79	NC_017169	CCA	2	6	6407	6412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141145
80	NC_017169	GTC	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141145
81	NC_017169	ATA	2	6	6435	6440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141145
82	NC_017169	TGA	3	9	6578	6586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141145
83	NC_017169	TGA	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141146
84	NC_017169	CGT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141146
85	NC_017169	ATC	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141146
86	NC_017169	CTT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141146
87	NC_017169	CAG	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141146
88	NC_017169	GTT	3	9	6800	6808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141146
89	NC_017169	TTC	2	6	6916	6921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141147
90	NC_017169	GTC	2	6	6934	6939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141147
91	NC_017169	CCA	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141147
92	NC_017169	TCG	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141147
93	NC_017169	CAG	2	6	7161	7166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141147
94	NC_017169	TGG	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141147
95	NC_017169	TTG	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141147
96	NC_017169	GCA	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141147
97	NC_017169	AGA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141148
98	NC_017169	TCC	2	6	7560	7565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384141148
99	NC_017169	CAG	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141148
100	NC_017169	CTT	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141148
101	NC_017169	CTT	2	6	7684	7689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141148
102	NC_017169	TGC	2	6	7753	7758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
103	NC_017169	CTG	2	6	7832	7837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
104	NC_017169	CGT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
105	NC_017169	CTT	3	9	7900	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141148
106	NC_017169	GTC	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
107	NC_017169	GCC	2	6	7962	7967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141148
108	NC_017169	CGA	2	6	7971	7976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141148
109	NC_017169	ATG	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141148
110	NC_017169	CGT	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
111	NC_017169	GGC	2	6	8045	8050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141148
112	NC_017169	CTG	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141148
113	NC_017169	GTA	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141149
114	NC_017169	TGA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141149
115	NC_017169	GCC	2	6	8429	8434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141149
116	NC_017169	TCG	2	6	8438	8443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141149
117	NC_017169	TTC	2	6	8491	8496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141149
118	NC_017169	CGA	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141149
119	NC_017169	CCA	2	6	8568	8573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141149
120	NC_017169	TGA	2	6	8965	8970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141150
121	NC_017169	GAT	3	9	9250	9258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141150
122	NC_017169	GCT	2	6	9308	9313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141150
123	NC_017169	GCC	2	6	9526	9531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141150
124	NC_017169	ACC	2	6	9561	9566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141150
125	NC_017169	CTG	2	6	9611	9616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141150
126	NC_017169	ATC	2	6	9637	9642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141150
127	NC_017169	ATG	2	6	10073	10078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141150
128	NC_017169	CAG	2	6	10147	10152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141150
129	NC_017169	GGC	2	6	10156	10161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141150
130	NC_017169	TTA	2	6	10326	10331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141150
131	NC_017169	ACG	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141150
132	NC_017169	TCA	2	6	10595	10600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141151
133	NC_017169	GGC	2	6	10641	10646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141151
134	NC_017169	AGA	2	6	10719	10724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141151
135	NC_017169	TGG	2	6	10957	10962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141152
136	NC_017169	TTG	2	6	11086	11091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141152
137	NC_017169	GTC	2	6	11406	11411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141153
138	NC_017169	CAA	2	6	11415	11420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141153
139	NC_017169	GTC	2	6	11728	11733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141153
140	NC_017169	ATC	2	6	12121	12126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141154
141	NC_017169	GCT	2	6	12130	12135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141154
142	NC_017169	CAA	2	6	12168	12173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141154
143	NC_017169	CAA	2	6	12273	12278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141154
144	NC_017169	ATG	2	6	12296	12301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141154
145	NC_017169	TAC	2	6	12322	12327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141154
146	NC_017169	ATG	2	6	12500	12505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141154
147	NC_017169	TGA	2	6	12542	12547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141154
148	NC_017169	GCT	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141154
149	NC_017169	GCA	2	6	12678	12683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141154
150	NC_017169	AGT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141155
151	NC_017169	CGA	2	6	12921	12926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141155
152	NC_017169	GTT	2	6	13812	13817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141156
153	NC_017169	CTG	2	6	14040	14045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141156
154	NC_017169	ATC	2	6	14429	14434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141157
155	NC_017169	GAA	2	6	14533	14538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141157
156	NC_017169	GCT	2	6	15680	15685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141159
157	NC_017169	GCG	2	6	15921	15926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141159
158	NC_017169	TCG	2	6	15931	15936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141159
159	NC_017169	TCT	2	6	15953	15958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141159
160	NC_017169	CCA	2	6	15964	15969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141159
161	NC_017169	CCA	2	6	15980	15985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141159
162	NC_017169	TCT	2	6	16157	16162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141160
163	NC_017169	GGC	2	6	16177	16182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141160
164	NC_017169	AAC	2	6	16197	16202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141160
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167	NC_017169	GAA	2	6	16331	16336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141160
168	NC_017169	CTC	2	6	16362	16367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384141160
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172	NC_017169	GCT	2	6	16765	16770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141160
173	NC_017169	TGG	2	6	16780	16785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141160
174	NC_017169	GAT	2	6	16924	16929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141161
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186	NC_017169	ATG	2	6	18479	18484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141161
187	NC_017169	CGT	2	6	18555	18560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141161
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191	NC_017169	CAT	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141162
192	NC_017169	GAC	2	6	19190	19195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141162
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194	NC_017169	CAA	2	6	19255	19260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141162
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196	NC_017169	ACC	2	6	19440	19445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141162
197	NC_017169	GCA	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141162
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204	NC_017169	CTT	2	6	19957	19962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141162
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208	NC_017169	CGG	2	6	20554	20559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141164
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210	NC_017169	CTT	2	6	20850	20855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141164
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223	NC_017169	CAG	2	6	22313	22318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141166
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227	NC_017169	CTG	2	6	23466	23471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141167
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240	NC_017169	CAT	2	6	24223	24228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141167
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244	NC_017169	CAG	2	6	24912	24917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141168
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247	NC_017169	TTC	2	6	25149	25154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141169
248	NC_017169	ATC	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141169
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252	NC_017169	TCG	2	6	25341	25346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141169
253	NC_017169	TTC	2	6	25437	25442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141169
254	NC_017169	ATC	2	6	25508	25513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141170
255	NC_017169	ATA	2	6	25586	25591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141170
256	NC_017169	TAA	2	6	25594	25599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141170
257	NC_017169	AGC	2	6	25700	25705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141171
258	NC_017169	CGT	2	6	25724	25729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141171
259	NC_017169	GTC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141171
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261	NC_017169	CAA	2	6	25761	25766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141171
262	NC_017169	TCA	2	6	25773	25778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141171
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265	NC_017169	TGA	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141171
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269	NC_017169	CCT	2	6	26177	26182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384141172
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273	NC_017169	TGT	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141173
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277	NC_017169	TTG	2	6	26597	26602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141173
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281	NC_017169	TAA	2	6	27252	27257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141174
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283	NC_017169	GTC	2	6	27415	27420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141174
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369	NC_017169	GTG	2	6	34197	34202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141185
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372	NC_017169	CTT	2	6	34343	34348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141185
373	NC_017169	TCA	2	6	34375	34380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141185
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498	NC_017169	ATG	2	6	45857	45862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141200
499	NC_017169	CAC	2	6	45876	45881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384141200
500	NC_017169	CTT	3	9	46032	46040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141200

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