MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 2984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	CCAGC	2	10	279	288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017168	GCGCT	2	10	1061	1070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017168	GCTGA	2	10	2117	2126	20 %	20 %	40 %	20 %	384137009
4	NC_017168	CAGCG	2	10	4829	4838	20 %	0 %	40 %	40 %	384137010
5	NC_017168	GGGCG	2	10	5599	5608	0 %	0 %	80 %	20 %	384137011
6	NC_017168	GGCAA	2	10	5785	5794	40 %	0 %	40 %	20 %	384137011
7	NC_017168	TGCGG	2	10	5806	5815	0 %	20 %	60 %	20 %	384137011
8	NC_017168	GCTTG	2	10	8775	8784	0 %	40 %	40 %	20 %	384137014
9	NC_017168	GCTGC	2	10	9210	9219	0 %	20 %	40 %	40 %	384137015
10	NC_017168	TAATG	2	10	10100	10109	40 %	40 %	20 %	0 %	384137016
11	NC_017168	AGGGA	2	10	10427	10436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017168	CTGAA	2	10	12805	12814	40 %	20 %	20 %	20 %	384137018
13	NC_017168	ACGAT	2	10	12880	12889	40 %	20 %	20 %	20 %	384137018
14	NC_017168	ATTGT	3	15	13959	13973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017168	TTGCT	2	10	15344	15353	0 %	60 %	20 %	20 %	384137020
16	NC_017168	GTTTA	2	10	15845	15854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017168	TGCTC	2	10	18651	18660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017168	CTTTA	2	10	18738	18747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017168	TTCCC	2	10	18837	18846	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017168	GCCGT	2	10	23652	23661	0 %	20 %	40 %	40 %	384137029
21	NC_017168	CTGCA	2	10	28067	28076	20 %	20 %	20 %	40 %	384137031
22	NC_017168	GCTGG	2	10	28237	28246	0 %	20 %	60 %	20 %	384137031
23	NC_017168	TGACC	2	10	28800	28809	20 %	20 %	20 %	40 %	384137032
24	NC_017168	ACCGC	2	10	29042	29051	20 %	0 %	20 %	60 %	384137032
25	NC_017168	ACTGA	2	10	30133	30142	40 %	20 %	20 %	20 %	384137032
26	NC_017168	CATGG	2	10	30772	30781	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
27	NC_017168	ACGGT	2	10	30844	30853	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
28	NC_017168	GCCTC	2	10	34139	34148	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017168	ACTTA	2	10	34509	34518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017168	ACTGA	2	10	35079	35088	40 %	20 %	20 %	20 %	384137036
31	NC_017168	ACTGG	2	10	36604	36613	20 %	20 %	40 %	20 %	384137037
32	NC_017168	ATATA	2	10	37196	37205	60 %	40 %	0 %	0 %	384137037
33	NC_017168	TATTT	2	10	37923	37932	20 %	80 %	0 %	0 %	384137038
34	NC_017168	ACTTA	2	10	39612	39621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017168	ACTGA	2	10	40182	40191	40 %	20 %	20 %	20 %	384137041
36	NC_017168	GTGGG	2	10	44032	44041	0 %	20 %	80 %	0 %	384137043
37	NC_017168	GGAGA	2	10	45935	45944	40 %	0 %	60 %	0 %	384137045
38	NC_017168	TTTAT	2	10	50469	50478	20 %	80 %	0 %	0 %	384137047
39	NC_017168	TTTGC	2	10	50697	50706	0 %	60 %	20 %	20 %	384137049
40	NC_017168	TGGCT	2	10	50777	50786	0 %	40 %	40 %	20 %	384137049
41	NC_017168	ATACG	2	10	51461	51470	40 %	20 %	20 %	20 %	384137049
42	NC_017168	TTTTG	2	10	52468	52477	0 %	80 %	20 %	0 %	384137050
43	NC_017168	ATAAA	2	10	57238	57247	80 %	20 %	0 %	0 %	384137056
44	NC_017168	GAACT	2	10	58914	58923	40 %	20 %	20 %	20 %	384137058
45	NC_017168	GTGAT	2	10	59718	59727	20 %	40 %	40 %	0 %	384137058
46	NC_017168	GAGAG	2	10	60011	60020	40 %	0 %	60 %	0 %	384137058
47	NC_017168	ATTAG	2	10	61070	61079	40 %	40 %	20 %	0 %	384137058
48	NC_017168	ATTCA	2	10	61246	61255	40 %	40 %	0 %	20 %	384137058
49	NC_017168	AATAA	2	10	61376	61385	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
50	NC_017168	ACTAA	2	10	61904	61913	60 %	20 %	0 %	20 %	384137058
51	NC_017168	ATAAA	2	10	63816	63825	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
52	NC_017168	GTAGT	2	10	63873	63882	20 %	40 %	40 %	0 %	384137058
53	NC_017168	GAAAT	2	10	65106	65115	60 %	20 %	20 %	0 %	384137058
54	NC_017168	CTTTA	2	10	65184	65193	20 %	60 %	0 %	20 %	384137058
55	NC_017168	TATAA	2	10	65576	65585	60 %	40 %	0 %	0 %	384137058
56	NC_017168	CCAAA	2	10	69623	69632	60 %	0 %	0 %	40 %	384137060
57	NC_017168	GGCGG	2	10	69967	69976	0 %	0 %	80 %	20 %	384137061
58	NC_017168	AACCA	2	10	71683	71692	60 %	0 %	0 %	40 %	384137063
59	NC_017168	GCTTT	2	10	72176	72185	0 %	60 %	20 %	20 %	384137064
60	NC_017168	GGTTT	2	10	72467	72476	0 %	60 %	40 %	0 %	384137064
61	NC_017168	CGGAT	2	10	73789	73798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017168	CAAAT	2	10	75056	75065	60 %	20 %	0 %	20 %	384137067
63	NC_017168	ACACC	2	10	77097	77106	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_017168	CCAAC	2	10	77262	77271	40 %	0 %	0 %	60 %	384137070
65	NC_017168	GCGCT	2	10	77989	77998	0 %	20 %	40 %	40 %	384137070
66	NC_017168	ATAGC	2	10	78003	78012	40 %	20 %	20 %	20 %	384137070
67	NC_017168	TTCAC	2	10	79406	79415	20 %	40 %	0 %	40 %	384137072
68	NC_017168	GGGTT	2	10	80456	80465	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017168	CAGAG	2	10	81819	81828	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017168	TGCTC	2	10	85738	85747	0 %	40 %	20 %	40 %	384137078
71	NC_017168	TCTGG	2	10	88115	88124	0 %	40 %	40 %	20 %	384137079
72	NC_017168	TGGCA	2	10	88451	88460	20 %	20 %	40 %	20 %	384137079
73	NC_017168	GTTCG	2	10	90233	90242	0 %	40 %	40 %	20 %	384137081
74	NC_017168	AAGGT	2	10	90582	90591	40 %	20 %	40 %	0 %	384137081
75	NC_017168	AGCGC	2	10	90982	90991	20 %	0 %	40 %	40 %	384137082
76	NC_017168	TCAAA	2	10	91620	91629	60 %	20 %	0 %	20 %	384137082
77	NC_017168	CTGAT	2	10	93835	93844	20 %	40 %	20 %	20 %	384137084
78	NC_017168	TTCTC	2	10	94826	94835	0 %	60 %	0 %	40 %	384137085
79	NC_017168	TCAGT	2	10	96890	96899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017168	TAAAT	2	10	98251	98260	60 %	40 %	0 %	0 %	384137089
81	NC_017168	TCATA	2	10	99883	99892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017168	TGGGC	2	10	99936	99945	0 %	20 %	60 %	20 %	384137091
83	NC_017168	CCAAT	2	10	102472	102481	40 %	20 %	0 %	40 %	384137094
84	NC_017168	TGTGC	2	10	102853	102862	0 %	40 %	40 %	20 %	384137094
85	NC_017168	TTTGG	2	10	106713	106722	0 %	60 %	40 %	0 %	384137098
86	NC_017168	CGTCA	2	10	106868	106877	20 %	20 %	20 %	40 %	384137098
87	NC_017168	GATGT	2	10	106963	106972	20 %	40 %	40 %	0 %	384137098
88	NC_017168	GTGCG	2	10	109381	109390	0 %	20 %	60 %	20 %	384137100
89	NC_017168	AAAGT	2	10	113694	113703	60 %	20 %	20 %	0 %	384137102
90	NC_017168	TGTTC	2	10	113949	113958	0 %	60 %	20 %	20 %	384137102
91	NC_017168	ATTTT	2	10	114410	114419	20 %	80 %	0 %	0 %	384137104
92	NC_017168	TAGTT	2	10	115150	115159	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017168	TTTTA	2	10	115233	115242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017168	TTCTA	2	10	115460	115469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017168	AATTA	2	10	115483	115492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017168	ATAAA	2	10	115840	115849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017168	TGGAA	2	10	115858	115867	40 %	20 %	40 %	0 %	384137105
98	NC_017168	CGCAG	2	10	116616	116625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017168	GGCGT	2	10	117173	117182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017168	CTCTT	2	10	118139	118148	0 %	60 %	0 %	40 %	384137106
101	NC_017168	GAAGA	2	10	119144	119153	60 %	0 %	40 %	0 %	384137106
102	NC_017168	GGTGT	2	10	119522	119531	0 %	40 %	60 %	0 %	384137107
103	NC_017168	TGTTT	2	10	120287	120296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017168	AATGG	2	10	120758	120767	40 %	20 %	40 %	0 %	384137108
105	NC_017168	GTAGA	2	10	120907	120916	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017168	GCATT	2	10	124206	124215	20 %	40 %	20 %	20 %	384137113
107	NC_017168	TTGGG	2	10	124221	124230	0 %	40 %	60 %	0 %	384137113
108	NC_017168	TGAAT	2	10	124330	124339	40 %	40 %	20 %	0 %	384137113
109	NC_017168	TTCAC	2	10	125070	125079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017168	TATTT	2	10	126067	126076	20 %	80 %	0 %	0 %	384137114
111	NC_017168	TTCTA	2	10	126171	126180	20 %	60 %	0 %	20 %	384137114
112	NC_017168	CTAGA	2	10	126636	126645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017168	GCTCG	2	10	127554	127563	0 %	20 %	40 %	40 %	384137116
114	NC_017168	GCATC	2	10	128014	128023	20 %	20 %	20 %	40 %	384137116
115	NC_017168	TGGCA	2	10	129138	129147	20 %	20 %	40 %	20 %	384137118
116	NC_017168	GGGTC	2	10	130184	130193	0 %	20 %	60 %	20 %	384137118
117	NC_017168	TTCAG	2	10	131554	131563	20 %	40 %	20 %	20 %	384137119
118	NC_017168	AAGCT	2	10	131780	131789	40 %	20 %	20 %	20 %	384137119
119	NC_017168	TAATC	2	10	133635	133644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017168	GCCGA	2	10	134507	134516	20 %	0 %	40 %	40 %	384137121
121	NC_017168	ACAGC	2	10	134871	134880	40 %	0 %	20 %	40 %	384137121
122	NC_017168	ACTCT	2	10	135987	135996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017168	GAATA	2	10	141816	141825	60 %	20 %	20 %	0 %	384137134
124	NC_017168	CTGGC	2	10	142245	142254	0 %	20 %	40 %	40 %	384137135
125	NC_017168	AAAGT	2	10	142884	142893	60 %	20 %	20 %	0 %	384137136
126	NC_017168	GCAAG	2	10	144539	144548	40 %	0 %	40 %	20 %	384137137
127	NC_017168	CAAAA	2	10	148867	148876	80 %	0 %	0 %	20 %	384137142
128	NC_017168	TTGGT	2	10	150125	150134	0 %	60 %	40 %	0 %	384137143
129	NC_017168	TATTT	2	10	150402	150411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017168	ATTAA	2	10	151493	151502	60 %	40 %	0 %	0 %	384137144
131	NC_017168	TGCAT	2	10	152733	152742	20 %	40 %	20 %	20 %	384137147
132	NC_017168	CTTAA	2	10	155055	155064	40 %	40 %	0 %	20 %	384137149
133	NC_017168	TTATT	2	10	155179	155188	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
134	NC_017168	TTGAA	2	10	155357	155366	40 %	40 %	20 %	0 %	384137149
135	NC_017168	ATTTT	2	10	155403	155412	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
136	NC_017168	ATTAA	2	10	155596	155605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017168	GAATG	2	10	155880	155889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017168	AATGT	2	10	159354	159363	40 %	40 %	20 %	0 %	384137152
139	NC_017168	GTATT	2	10	159434	159443	20 %	60 %	20 %	0 %	384137152
140	NC_017168	ATCTG	2	10	160374	160383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017168	AGCGT	2	10	162090	162099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017168	GCCAT	2	10	163671	163680	20 %	20 %	20 %	40 %	384137155
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152	NC_017168	ATTTC	2	10	179861	179870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017168	TTTCG	2	10	180140	180149	0 %	60 %	20 %	20 %	384137168
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179	NC_017168	TAATT	2	10	208486	208495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017168	TTTAC	2	10	215689	215698	20 %	60 %	0 %	20 %	384137201
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266	NC_017168	TAAAA	2	10	340887	340896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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