MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 2386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	GCTGA	2	10	2117	2126	20 %	20 %	40 %	20 %	384137009
2	NC_017168	CAGCG	2	10	4829	4838	20 %	0 %	40 %	40 %	384137010
3	NC_017168	GGGCG	2	10	5599	5608	0 %	0 %	80 %	20 %	384137011
4	NC_017168	GGCAA	2	10	5785	5794	40 %	0 %	40 %	20 %	384137011
5	NC_017168	TGCGG	2	10	5806	5815	0 %	20 %	60 %	20 %	384137011
6	NC_017168	GCTTG	2	10	8775	8784	0 %	40 %	40 %	20 %	384137014
7	NC_017168	GCTGC	2	10	9210	9219	0 %	20 %	40 %	40 %	384137015
8	NC_017168	TAATG	2	10	10100	10109	40 %	40 %	20 %	0 %	384137016
9	NC_017168	CTGAA	2	10	12805	12814	40 %	20 %	20 %	20 %	384137018
10	NC_017168	ACGAT	2	10	12880	12889	40 %	20 %	20 %	20 %	384137018
11	NC_017168	TTGCT	2	10	15344	15353	0 %	60 %	20 %	20 %	384137020
12	NC_017168	GCCGT	2	10	23652	23661	0 %	20 %	40 %	40 %	384137029
13	NC_017168	CTGCA	2	10	28067	28076	20 %	20 %	20 %	40 %	384137031
14	NC_017168	GCTGG	2	10	28237	28246	0 %	20 %	60 %	20 %	384137031
15	NC_017168	TGACC	2	10	28800	28809	20 %	20 %	20 %	40 %	384137032
16	NC_017168	ACCGC	2	10	29042	29051	20 %	0 %	20 %	60 %	384137032
17	NC_017168	ACTGA	2	10	30133	30142	40 %	20 %	20 %	20 %	384137032
18	NC_017168	CATGG	2	10	30772	30781	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
19	NC_017168	ACGGT	2	10	30844	30853	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
20	NC_017168	ACTGA	2	10	35079	35088	40 %	20 %	20 %	20 %	384137036
21	NC_017168	ACTGG	2	10	36604	36613	20 %	20 %	40 %	20 %	384137037
22	NC_017168	ATATA	2	10	37196	37205	60 %	40 %	0 %	0 %	384137037
23	NC_017168	TATTT	2	10	37923	37932	20 %	80 %	0 %	0 %	384137038
24	NC_017168	ACTGA	2	10	40182	40191	40 %	20 %	20 %	20 %	384137041
25	NC_017168	GTGGG	2	10	44032	44041	0 %	20 %	80 %	0 %	384137043
26	NC_017168	GGAGA	2	10	45935	45944	40 %	0 %	60 %	0 %	384137045
27	NC_017168	TTTAT	2	10	50469	50478	20 %	80 %	0 %	0 %	384137047
28	NC_017168	TTTGC	2	10	50697	50706	0 %	60 %	20 %	20 %	384137049
29	NC_017168	TGGCT	2	10	50777	50786	0 %	40 %	40 %	20 %	384137049
30	NC_017168	ATACG	2	10	51461	51470	40 %	20 %	20 %	20 %	384137049
31	NC_017168	TTTTG	2	10	52468	52477	0 %	80 %	20 %	0 %	384137050
32	NC_017168	ATAAA	2	10	57238	57247	80 %	20 %	0 %	0 %	384137056
33	NC_017168	GAACT	2	10	58914	58923	40 %	20 %	20 %	20 %	384137058
34	NC_017168	GTGAT	2	10	59718	59727	20 %	40 %	40 %	0 %	384137058
35	NC_017168	GAGAG	2	10	60011	60020	40 %	0 %	60 %	0 %	384137058
36	NC_017168	ATTAG	2	10	61070	61079	40 %	40 %	20 %	0 %	384137058
37	NC_017168	ATTCA	2	10	61246	61255	40 %	40 %	0 %	20 %	384137058
38	NC_017168	AATAA	2	10	61376	61385	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
39	NC_017168	ACTAA	2	10	61904	61913	60 %	20 %	0 %	20 %	384137058
40	NC_017168	ATAAA	2	10	63816	63825	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
41	NC_017168	GTAGT	2	10	63873	63882	20 %	40 %	40 %	0 %	384137058
42	NC_017168	GAAAT	2	10	65106	65115	60 %	20 %	20 %	0 %	384137058
43	NC_017168	CTTTA	2	10	65184	65193	20 %	60 %	0 %	20 %	384137058
44	NC_017168	TATAA	2	10	65576	65585	60 %	40 %	0 %	0 %	384137058
45	NC_017168	CCAAA	2	10	69623	69632	60 %	0 %	0 %	40 %	384137060
46	NC_017168	GGCGG	2	10	69967	69976	0 %	0 %	80 %	20 %	384137061
47	NC_017168	AACCA	2	10	71683	71692	60 %	0 %	0 %	40 %	384137063
48	NC_017168	GCTTT	2	10	72176	72185	0 %	60 %	20 %	20 %	384137064
49	NC_017168	GGTTT	2	10	72467	72476	0 %	60 %	40 %	0 %	384137064
50	NC_017168	CAAAT	2	10	75056	75065	60 %	20 %	0 %	20 %	384137067
51	NC_017168	CCAAC	2	10	77262	77271	40 %	0 %	0 %	60 %	384137070
52	NC_017168	GCGCT	2	10	77989	77998	0 %	20 %	40 %	40 %	384137070
53	NC_017168	ATAGC	2	10	78003	78012	40 %	20 %	20 %	20 %	384137070
54	NC_017168	TTCAC	2	10	79406	79415	20 %	40 %	0 %	40 %	384137072
55	NC_017168	TGCTC	2	10	85738	85747	0 %	40 %	20 %	40 %	384137078
56	NC_017168	TCTGG	2	10	88115	88124	0 %	40 %	40 %	20 %	384137079
57	NC_017168	TGGCA	2	10	88451	88460	20 %	20 %	40 %	20 %	384137079
58	NC_017168	GTTCG	2	10	90233	90242	0 %	40 %	40 %	20 %	384137081
59	NC_017168	AAGGT	2	10	90582	90591	40 %	20 %	40 %	0 %	384137081
60	NC_017168	AGCGC	2	10	90982	90991	20 %	0 %	40 %	40 %	384137082
61	NC_017168	TCAAA	2	10	91620	91629	60 %	20 %	0 %	20 %	384137082
62	NC_017168	CTGAT	2	10	93835	93844	20 %	40 %	20 %	20 %	384137084
63	NC_017168	TTCTC	2	10	94826	94835	0 %	60 %	0 %	40 %	384137085
64	NC_017168	TAAAT	2	10	98251	98260	60 %	40 %	0 %	0 %	384137089
65	NC_017168	TGGGC	2	10	99936	99945	0 %	20 %	60 %	20 %	384137091
66	NC_017168	CCAAT	2	10	102472	102481	40 %	20 %	0 %	40 %	384137094
67	NC_017168	TGTGC	2	10	102853	102862	0 %	40 %	40 %	20 %	384137094
68	NC_017168	TTTGG	2	10	106713	106722	0 %	60 %	40 %	0 %	384137098
69	NC_017168	CGTCA	2	10	106868	106877	20 %	20 %	20 %	40 %	384137098
70	NC_017168	GATGT	2	10	106963	106972	20 %	40 %	40 %	0 %	384137098
71	NC_017168	GTGCG	2	10	109381	109390	0 %	20 %	60 %	20 %	384137100
72	NC_017168	AAAGT	2	10	113694	113703	60 %	20 %	20 %	0 %	384137102
73	NC_017168	TGTTC	2	10	113949	113958	0 %	60 %	20 %	20 %	384137102
74	NC_017168	ATTTT	2	10	114410	114419	20 %	80 %	0 %	0 %	384137104
75	NC_017168	TGGAA	2	10	115858	115867	40 %	20 %	40 %	0 %	384137105
76	NC_017168	CTCTT	2	10	118139	118148	0 %	60 %	0 %	40 %	384137106
77	NC_017168	GAAGA	2	10	119144	119153	60 %	0 %	40 %	0 %	384137106
78	NC_017168	GGTGT	2	10	119522	119531	0 %	40 %	60 %	0 %	384137107
79	NC_017168	AATGG	2	10	120758	120767	40 %	20 %	40 %	0 %	384137108
80	NC_017168	GCATT	2	10	124206	124215	20 %	40 %	20 %	20 %	384137113
81	NC_017168	TTGGG	2	10	124221	124230	0 %	40 %	60 %	0 %	384137113
82	NC_017168	TGAAT	2	10	124330	124339	40 %	40 %	20 %	0 %	384137113
83	NC_017168	TATTT	2	10	126067	126076	20 %	80 %	0 %	0 %	384137114
84	NC_017168	TTCTA	2	10	126171	126180	20 %	60 %	0 %	20 %	384137114
85	NC_017168	GCTCG	2	10	127554	127563	0 %	20 %	40 %	40 %	384137116
86	NC_017168	GCATC	2	10	128014	128023	20 %	20 %	20 %	40 %	384137116
87	NC_017168	TGGCA	2	10	129138	129147	20 %	20 %	40 %	20 %	384137118
88	NC_017168	GGGTC	2	10	130184	130193	0 %	20 %	60 %	20 %	384137118
89	NC_017168	TTCAG	2	10	131554	131563	20 %	40 %	20 %	20 %	384137119
90	NC_017168	AAGCT	2	10	131780	131789	40 %	20 %	20 %	20 %	384137119
91	NC_017168	GCCGA	2	10	134507	134516	20 %	0 %	40 %	40 %	384137121
92	NC_017168	ACAGC	2	10	134871	134880	40 %	0 %	20 %	40 %	384137121
93	NC_017168	GAATA	2	10	141816	141825	60 %	20 %	20 %	0 %	384137134
94	NC_017168	CTGGC	2	10	142245	142254	0 %	20 %	40 %	40 %	384137135
95	NC_017168	AAAGT	2	10	142884	142893	60 %	20 %	20 %	0 %	384137136
96	NC_017168	GCAAG	2	10	144539	144548	40 %	0 %	40 %	20 %	384137137
97	NC_017168	CAAAA	2	10	148867	148876	80 %	0 %	0 %	20 %	384137142
98	NC_017168	TTGGT	2	10	150125	150134	0 %	60 %	40 %	0 %	384137143
99	NC_017168	ATTAA	2	10	151493	151502	60 %	40 %	0 %	0 %	384137144
100	NC_017168	TGCAT	2	10	152733	152742	20 %	40 %	20 %	20 %	384137147
101	NC_017168	CTTAA	2	10	155055	155064	40 %	40 %	0 %	20 %	384137149
102	NC_017168	TTATT	2	10	155179	155188	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
103	NC_017168	TTGAA	2	10	155357	155366	40 %	40 %	20 %	0 %	384137149
104	NC_017168	ATTTT	2	10	155403	155412	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
105	NC_017168	AATGT	2	10	159354	159363	40 %	40 %	20 %	0 %	384137152
106	NC_017168	GTATT	2	10	159434	159443	20 %	60 %	20 %	0 %	384137152
107	NC_017168	GCCAT	2	10	163671	163680	20 %	20 %	20 %	40 %	384137155
108	NC_017168	TGGCG	2	10	163906	163915	0 %	20 %	60 %	20 %	384137155
109	NC_017168	ATTTT	2	10	165584	165593	20 %	80 %	0 %	0 %	384137156
110	NC_017168	ATGTC	2	10	167183	167192	20 %	40 %	20 %	20 %	384137158
111	NC_017168	AAGTA	2	10	168243	168252	60 %	20 %	20 %	0 %	384137158
112	NC_017168	CGTTT	2	10	171916	171925	0 %	60 %	20 %	20 %	384137161
113	NC_017168	CAATG	2	10	174339	174348	40 %	20 %	20 %	20 %	384137163
114	NC_017168	AACCA	2	10	175751	175760	60 %	0 %	0 %	40 %	384137164
115	NC_017168	ACCCC	2	10	176207	176216	20 %	0 %	0 %	80 %	384137164
116	NC_017168	TTTCG	2	10	180140	180149	0 %	60 %	20 %	20 %	384137168
117	NC_017168	GGGTC	2	10	180985	180994	0 %	20 %	60 %	20 %	384137168
118	NC_017168	GCCCA	2	10	181920	181929	20 %	0 %	20 %	60 %	384137169
119	NC_017168	TTCAC	2	10	183388	183397	20 %	40 %	0 %	40 %	384137170
120	NC_017168	AACCC	2	10	184767	184776	40 %	0 %	0 %	60 %	384137171
121	NC_017168	GTTTG	2	10	185635	185644	0 %	60 %	40 %	0 %	384137171
122	NC_017168	TCAAA	2	10	186473	186482	60 %	20 %	0 %	20 %	384137172
123	NC_017168	TGCGG	2	10	187479	187488	0 %	20 %	60 %	20 %	384137173
124	NC_017168	TCTGC	2	10	189686	189695	0 %	40 %	20 %	40 %	384137176
125	NC_017168	AGCCA	2	10	189878	189887	40 %	0 %	20 %	40 %	384137176
126	NC_017168	GACCA	2	10	192402	192411	40 %	0 %	20 %	40 %	384137179
127	NC_017168	GGTGA	2	10	192493	192502	20 %	20 %	60 %	0 %	384137179
128	NC_017168	GATCA	2	10	192735	192744	40 %	20 %	20 %	20 %	384137179
129	NC_017168	AATAA	2	10	194143	194152	80 %	20 %	0 %	0 %	384137181
130	NC_017168	GTTCG	2	10	197574	197583	0 %	40 %	40 %	20 %	384137185
131	NC_017168	AAGGT	2	10	197923	197932	40 %	20 %	40 %	0 %	384137185
132	NC_017168	AGCGC	2	10	198323	198332	20 %	0 %	40 %	40 %	384137186
133	NC_017168	TCAAA	2	10	198961	198970	60 %	20 %	0 %	20 %	384137186
134	NC_017168	GCCAG	2	10	199866	199875	20 %	0 %	40 %	40 %	384137187
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