MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 11795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	TCCT	2	8	1434	1441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017168	GATC	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017168	TAAA	2	8	3426	3433	75 %	25 %	0 %	0 %	384137010
4	NC_017168	CCAG	2	8	3837	3844	25 %	0 %	25 %	50 %	384137010
5	NC_017168	GAAA	2	8	5048	5055	75 %	0 %	25 %	0 %	384137011
6	NC_017168	ACCA	2	8	5842	5849	50 %	0 %	0 %	50 %	384137011
7	NC_017168	CCAG	2	8	6504	6511	25 %	0 %	25 %	50 %	384137012
8	NC_017168	TGAG	2	8	6867	6874	25 %	25 %	50 %	0 %	384137012
9	NC_017168	GGCC	2	8	7265	7272	0 %	0 %	50 %	50 %	384137013
10	NC_017168	CGCT	2	8	7899	7906	0 %	25 %	25 %	50 %	384137014
11	NC_017168	GGCT	2	8	8227	8234	0 %	25 %	50 %	25 %	384137014
12	NC_017168	TCTA	2	8	8816	8823	25 %	50 %	0 %	25 %	384137014
13	NC_017168	TGGC	2	8	9048	9055	0 %	25 %	50 %	25 %	384137014
14	NC_017168	TTTA	2	8	9440	9447	25 %	75 %	0 %	0 %	384137016
15	NC_017168	TATT	2	8	9559	9566	25 %	75 %	0 %	0 %	384137016
16	NC_017168	GCCA	2	8	10040	10047	25 %	0 %	25 %	50 %	384137016
17	NC_017168	TTGT	2	8	10212	10219	0 %	75 %	25 %	0 %	384137016
18	NC_017168	ACTG	2	8	12173	12180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017168	AATG	2	8	12690	12697	50 %	25 %	25 %	0 %	384137018
20	NC_017168	AGTA	2	8	13388	13395	50 %	25 %	25 %	0 %	384137019
21	NC_017168	CTTT	2	8	13400	13407	0 %	75 %	0 %	25 %	384137019
22	NC_017168	TAAT	2	8	13523	13530	50 %	50 %	0 %	0 %	384137019
23	NC_017168	TAAA	2	8	14633	14640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017168	TAAT	2	8	14740	14747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017168	GTTT	2	8	15609	15616	0 %	75 %	25 %	0 %	384137020
26	NC_017168	GTAG	2	8	15762	15769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017168	CCAA	2	8	15786	15793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017168	TTCT	2	8	16044	16051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017168	AAAT	2	8	17109	17116	75 %	25 %	0 %	0 %	384137023
30	NC_017168	ATTG	2	8	17259	17266	25 %	50 %	25 %	0 %	384137023
31	NC_017168	TTAT	2	8	17340	17347	25 %	75 %	0 %	0 %	384137023
32	NC_017168	GAAG	2	8	17785	17792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017168	AGAT	3	12	17825	17836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017168	ACTC	2	8	17972	17979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017168	AATG	2	8	18704	18711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017168	GTGG	2	8	18766	18773	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017168	ATTC	2	8	18807	18814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017168	AAAG	2	8	18943	18950	75 %	0 %	25 %	0 %	384137025
39	NC_017168	GCTG	2	8	19063	19070	0 %	25 %	50 %	25 %	384137025
40	NC_017168	AGAA	2	8	19388	19395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017168	GATC	2	8	19786	19793	25 %	25 %	25 %	25 %	384137026
42	NC_017168	AATG	2	8	21049	21056	50 %	25 %	25 %	0 %	384137027
43	NC_017168	CTGC	2	8	21303	21310	0 %	25 %	25 %	50 %	384137027
44	NC_017168	AGCC	2	8	21903	21910	25 %	0 %	25 %	50 %	384137027
45	NC_017168	ATCA	2	8	21955	21962	50 %	25 %	0 %	25 %	384137027
46	NC_017168	GGCA	2	8	22426	22433	25 %	0 %	50 %	25 %	384137028
47	NC_017168	GATC	2	8	22784	22791	25 %	25 %	25 %	25 %	384137028
48	NC_017168	GCTG	2	8	22907	22914	0 %	25 %	50 %	25 %	384137028
49	NC_017168	GCTG	2	8	23091	23098	0 %	25 %	50 %	25 %	384137029
50	NC_017168	TGCC	2	8	23820	23827	0 %	25 %	25 %	50 %	384137029
51	NC_017168	CTGG	2	8	23842	23849	0 %	25 %	50 %	25 %	384137029
52	NC_017168	GGCT	2	8	24419	24426	0 %	25 %	50 %	25 %	384137029
53	NC_017168	CTGC	2	8	25275	25282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017168	ACTG	2	8	25566	25573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017168	CTTA	2	8	25599	25606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017168	CTGG	2	8	25939	25946	0 %	25 %	50 %	25 %	384137031
57	NC_017168	GCCT	2	8	26789	26796	0 %	25 %	25 %	50 %	384137031
58	NC_017168	GCGG	2	8	27439	27446	0 %	0 %	75 %	25 %	384137031
59	NC_017168	AACA	2	8	28052	28059	75 %	0 %	0 %	25 %	384137031
60	NC_017168	CTGC	2	8	28114	28121	0 %	25 %	25 %	50 %	384137031
61	NC_017168	TCAA	2	8	28158	28165	50 %	25 %	0 %	25 %	384137031
62	NC_017168	GAGC	2	8	28207	28214	25 %	0 %	50 %	25 %	384137031
63	NC_017168	AGCC	2	8	28402	28409	25 %	0 %	25 %	50 %	384137032
64	NC_017168	GCAG	2	8	29143	29150	25 %	0 %	50 %	25 %	384137032
65	NC_017168	CGCC	2	8	29349	29356	0 %	0 %	25 %	75 %	384137032
66	NC_017168	GCCC	2	8	29590	29597	0 %	0 %	25 %	75 %	384137032
67	NC_017168	GAAT	2	8	31103	31110	50 %	25 %	25 %	0 %	384137033
68	NC_017168	CTGC	2	8	31233	31240	0 %	25 %	25 %	50 %	384137033
69	NC_017168	TGAA	2	8	31297	31304	50 %	25 %	25 %	0 %	384137033
70	NC_017168	TGAT	2	8	31687	31694	25 %	50 %	25 %	0 %	384137033
71	NC_017168	ATTA	2	8	32153	32160	50 %	50 %	0 %	0 %	384137033
72	NC_017168	TCAA	2	8	32834	32841	50 %	25 %	0 %	25 %	384137033
73	NC_017168	TTTG	2	8	32906	32913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017168	AATG	2	8	33109	33116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017168	AAAT	2	8	33264	33271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017168	TTCA	2	8	33349	33356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017168	ATTA	2	8	34706	34713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017168	CTTA	2	8	34925	34932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017168	CATA	2	8	35732	35739	50 %	25 %	0 %	25 %	384137037
80	NC_017168	GCCA	2	8	35812	35819	25 %	0 %	25 %	50 %	384137037
81	NC_017168	AAGC	2	8	36802	36809	50 %	0 %	25 %	25 %	384137037
82	NC_017168	ATCC	2	8	37088	37095	25 %	25 %	0 %	50 %	384137037
83	NC_017168	TAAA	2	8	37108	37115	75 %	25 %	0 %	0 %	384137037
84	NC_017168	CAAA	2	8	37310	37317	75 %	0 %	0 %	25 %	384137037
85	NC_017168	AAGG	2	8	38185	38192	50 %	0 %	50 %	0 %	384137038
86	NC_017168	TAAT	2	8	38354	38361	50 %	50 %	0 %	0 %	384137038
87	NC_017168	TTTA	2	8	38408	38415	25 %	75 %	0 %	0 %	384137038
88	NC_017168	TGCC	2	8	38885	38892	0 %	25 %	25 %	50 %	384137039
89	NC_017168	TTAA	2	8	39810	39817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017168	ATGA	2	8	39856	39863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017168	CTTA	2	8	40028	40035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017168	CCAC	2	8	40659	40666	25 %	0 %	0 %	75 %	384137041
93	NC_017168	TTAA	2	8	40685	40692	50 %	50 %	0 %	0 %	384137041
94	NC_017168	TTCT	2	8	40792	40799	0 %	75 %	0 %	25 %	384137042
95	NC_017168	AGAA	2	8	41036	41043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017168	GACT	2	8	42097	42104	25 %	25 %	25 %	25 %	384137043
97	NC_017168	TTGC	2	8	42393	42400	0 %	50 %	25 %	25 %	384137043
98	NC_017168	GGCG	2	8	42718	42725	0 %	0 %	75 %	25 %	384137043
99	NC_017168	CGCC	2	8	42913	42920	0 %	0 %	25 %	75 %	384137043
100	NC_017168	TTTG	2	8	42958	42965	0 %	75 %	25 %	0 %	384137043
101	NC_017168	TGGG	2	8	42974	42981	0 %	25 %	75 %	0 %	384137043
102	NC_017168	TGCA	2	8	43188	43195	25 %	25 %	25 %	25 %	384137043
103	NC_017168	TGGA	2	8	43277	43284	25 %	25 %	50 %	0 %	384137043
104	NC_017168	CTCA	2	8	44373	44380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017168	ATTA	2	8	44464	44471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017168	AGTC	2	8	44666	44673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017168	CTTT	2	8	44844	44851	0 %	75 %	0 %	25 %	384137044
108	NC_017168	ATTA	2	8	44902	44909	50 %	50 %	0 %	0 %	384137044
109	NC_017168	ATTA	2	8	44975	44982	50 %	50 %	0 %	0 %	384137044
110	NC_017168	GACC	2	8	45730	45737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017168	AAAG	2	8	45971	45978	75 %	0 %	25 %	0 %	384137045
112	NC_017168	TGAA	2	8	46092	46099	50 %	25 %	25 %	0 %	384137045
113	NC_017168	AGCC	2	8	46102	46109	25 %	0 %	25 %	50 %	384137045
114	NC_017168	TGAA	2	8	46116	46123	50 %	25 %	25 %	0 %	384137045
115	NC_017168	CCAG	2	8	46863	46870	25 %	0 %	25 %	50 %	384137045
116	NC_017168	CAGG	2	8	47304	47311	25 %	0 %	50 %	25 %	384137046
117	NC_017168	TATT	2	8	47738	47745	25 %	75 %	0 %	0 %	384137046
118	NC_017168	TGTT	2	8	48332	48339	0 %	75 %	25 %	0 %	384137047
119	NC_017168	TCAG	2	8	48699	48706	25 %	25 %	25 %	25 %	384137047
120	NC_017168	GCCA	2	8	48761	48768	25 %	0 %	25 %	50 %	384137047
121	NC_017168	TGAA	2	8	49185	49192	50 %	25 %	25 %	0 %	384137047
122	NC_017168	TTCA	2	8	49988	49995	25 %	50 %	0 %	25 %	384137047
123	NC_017168	TGGC	2	8	50275	50282	0 %	25 %	50 %	25 %	384137047
124	NC_017168	GCTT	2	8	51175	51182	0 %	50 %	25 %	25 %	384137049
125	NC_017168	GATG	2	8	51939	51946	25 %	25 %	50 %	0 %	384137050
126	NC_017168	TTGG	2	8	52189	52196	0 %	50 %	50 %	0 %	384137050
127	NC_017168	AACG	2	8	52427	52434	50 %	0 %	25 %	25 %	384137050
128	NC_017168	TCGA	2	8	52605	52612	25 %	25 %	25 %	25 %	384137050
129	NC_017168	TTAC	2	8	53134	53141	25 %	50 %	0 %	25 %	384137051
130	NC_017168	GTTT	2	8	53267	53274	0 %	75 %	25 %	0 %	384137051
131	NC_017168	TAAA	2	8	54727	54734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017168	CAAC	2	8	55014	55021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017168	CGAC	2	8	55569	55576	25 %	0 %	25 %	50 %	384137053
134	NC_017168	TGAT	2	8	55865	55872	25 %	50 %	25 %	0 %	384137054
135	NC_017168	CAGG	2	8	56352	56359	25 %	0 %	50 %	25 %	384137055
136	NC_017168	GGGT	2	8	56455	56462	0 %	25 %	75 %	0 %	384137055
137	NC_017168	GCCA	2	8	56476	56483	25 %	0 %	25 %	50 %	384137055
138	NC_017168	AATG	2	8	57854	57861	50 %	25 %	25 %	0 %	384137057
139	NC_017168	AAAT	2	8	58285	58292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017168	TAAT	2	8	58407	58414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017168	AGGG	2	8	58827	58834	25 %	0 %	75 %	0 %	384137058
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