MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 6473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017168	TG	3	6	1523	1528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017168	CG	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
4	NC_017168	GC	3	6	2423	2428	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
5	NC_017168	GC	3	6	2861	2866	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
6	NC_017168	TC	3	6	3969	3974	0 %	50 %	0 %	50 %	384137010
7	NC_017168	CG	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
8	NC_017168	TA	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	384137011
9	NC_017168	GC	3	6	5252	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
10	NC_017168	CG	3	6	5483	5488	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
11	NC_017168	GC	3	6	6339	6344	0 %	0 %	50 %	50 %	384137012
12	NC_017168	CT	3	6	6680	6685	0 %	50 %	0 %	50 %	384137012
13	NC_017168	GC	3	6	6757	6762	0 %	0 %	50 %	50 %	384137012
14	NC_017168	TG	3	6	8387	8392	0 %	50 %	50 %	0 %	384137014
15	NC_017168	TG	3	6	8792	8797	0 %	50 %	50 %	0 %	384137014
16	NC_017168	AT	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	384137016
17	NC_017168	AT	3	6	10032	10037	50 %	50 %	0 %	0 %	384137016
18	NC_017168	CT	3	6	10232	10237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017168	AT	3	6	10341	10346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017168	AG	3	6	11919	11924	50 %	0 %	50 %	0 %	384137017
21	NC_017168	TC	3	6	12766	12771	0 %	50 %	0 %	50 %	384137018
22	NC_017168	CT	4	8	12832	12839	0 %	50 %	0 %	50 %	384137018
23	NC_017168	TA	3	6	13621	13626	50 %	50 %	0 %	0 %	384137019
24	NC_017168	GT	3	6	14191	14196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017168	TC	3	6	14210	14215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017168	AT	3	6	15199	15204	50 %	50 %	0 %	0 %	384137020
27	NC_017168	AC	3	6	15582	15587	50 %	0 %	0 %	50 %	384137020
28	NC_017168	TG	3	6	15641	15646	0 %	50 %	50 %	0 %	384137020
29	NC_017168	AC	3	6	15856	15861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017168	GT	3	6	16845	16850	0 %	50 %	50 %	0 %	384137022
31	NC_017168	AT	3	6	17412	17417	50 %	50 %	0 %	0 %	384137023
32	NC_017168	CT	3	6	18200	18205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017168	GT	3	6	18504	18509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017168	AC	3	6	18749	18754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017168	TC	3	6	18813	18818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017168	GC	3	6	19324	19329	0 %	0 %	50 %	50 %	384137025
37	NC_017168	CG	3	6	20202	20207	0 %	0 %	50 %	50 %	384137026
38	NC_017168	GT	3	6	20365	20370	0 %	50 %	50 %	0 %	384137026
39	NC_017168	GC	3	6	21966	21971	0 %	0 %	50 %	50 %	384137027
40	NC_017168	TG	3	6	22246	22251	0 %	50 %	50 %	0 %	384137027
41	NC_017168	TG	3	6	22446	22451	0 %	50 %	50 %	0 %	384137028
42	NC_017168	GC	3	6	22664	22669	0 %	0 %	50 %	50 %	384137028
43	NC_017168	CG	3	6	22695	22700	0 %	0 %	50 %	50 %	384137028
44	NC_017168	CT	3	6	23623	23628	0 %	50 %	0 %	50 %	384137029
45	NC_017168	GC	3	6	25213	25218	0 %	0 %	50 %	50 %	384137030
46	NC_017168	CA	3	6	27128	27133	50 %	0 %	0 %	50 %	384137031
47	NC_017168	AC	3	6	28098	28103	50 %	0 %	0 %	50 %	384137031
48	NC_017168	AT	3	6	28663	28668	50 %	50 %	0 %	0 %	384137032
49	NC_017168	GC	3	6	29227	29232	0 %	0 %	50 %	50 %	384137032
50	NC_017168	GA	3	6	30677	30682	50 %	0 %	50 %	0 %	384137033
51	NC_017168	AT	3	6	32674	32679	50 %	50 %	0 %	0 %	384137033
52	NC_017168	AT	3	6	33341	33346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017168	TA	3	6	34586	34591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017168	AT	3	6	34832	34837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017168	CT	3	6	35804	35809	0 %	50 %	0 %	50 %	384137037
56	NC_017168	CT	3	6	36259	36264	0 %	50 %	0 %	50 %	384137037
57	NC_017168	GT	3	6	36319	36324	0 %	50 %	50 %	0 %	384137037
58	NC_017168	TC	3	6	36752	36757	0 %	50 %	0 %	50 %	384137037
59	NC_017168	AT	4	8	37399	37406	50 %	50 %	0 %	0 %	384137037
60	NC_017168	TA	3	6	39689	39694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017168	AT	3	6	39935	39940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017168	AC	3	6	40852	40857	50 %	0 %	0 %	50 %	384137042
63	NC_017168	GA	3	6	41000	41005	50 %	0 %	50 %	0 %	384137042
64	NC_017168	CT	3	6	41417	41422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017168	TA	3	6	42906	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	384137043
66	NC_017168	TG	3	6	43731	43736	0 %	50 %	50 %	0 %	384137043
67	NC_017168	TG	4	8	44010	44017	0 %	50 %	50 %	0 %	384137043
68	NC_017168	TC	3	6	44352	44357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017168	GC	3	6	45227	45232	0 %	0 %	50 %	50 %	384137044
70	NC_017168	GA	3	6	46857	46862	50 %	0 %	50 %	0 %	384137045
71	NC_017168	GC	3	6	49050	49055	0 %	0 %	50 %	50 %	384137047
72	NC_017168	GC	3	6	49195	49200	0 %	0 %	50 %	50 %	384137047
73	NC_017168	TG	3	6	49548	49553	0 %	50 %	50 %	0 %	384137047
74	NC_017168	TC	3	6	50339	50344	0 %	50 %	0 %	50 %	384137047
75	NC_017168	TA	3	6	51341	51346	50 %	50 %	0 %	0 %	384137049
76	NC_017168	TA	3	6	51437	51442	50 %	50 %	0 %	0 %	384137049
77	NC_017168	GC	3	6	54046	54051	0 %	0 %	50 %	50 %	384137052
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79	NC_017168	TA	3	6	54925	54930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017168	GC	3	6	55481	55486	0 %	0 %	50 %	50 %	384137053
81	NC_017168	AT	3	6	56227	56232	50 %	50 %	0 %	0 %	384137055
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84	NC_017168	AT	3	6	58010	58015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017168	AT	3	6	58229	58234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017168	TA	3	6	58493	58498	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
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88	NC_017168	AT	3	6	58630	58635	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
89	NC_017168	TA	4	8	58774	58781	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
90	NC_017168	TG	3	6	58882	58887	0 %	50 %	50 %	0 %	384137058
91	NC_017168	CT	3	6	60553	60558	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
92	NC_017168	CT	3	6	60591	60596	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
93	NC_017168	AT	3	6	60637	60642	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
94	NC_017168	AT	3	6	60706	60711	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
95	NC_017168	CT	3	6	60814	60819	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
96	NC_017168	AG	3	6	60825	60830	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
97	NC_017168	GA	3	6	60834	60839	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
98	NC_017168	TA	3	6	60990	60995	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
99	NC_017168	AG	3	6	63588	63593	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
100	NC_017168	GA	4	8	63710	63717	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
101	NC_017168	TC	5	10	64833	64842	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
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104	NC_017168	GA	3	6	67628	67633	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
105	NC_017168	AG	3	6	67817	67822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017168	TG	3	6	67874	67879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017168	CG	4	8	68856	68863	0 %	0 %	50 %	50 %	384137059
108	NC_017168	GT	3	6	70693	70698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017168	AG	3	6	71375	71380	50 %	0 %	50 %	0 %	384137063
110	NC_017168	AG	3	6	71840	71845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017168	TG	3	6	72522	72527	0 %	50 %	50 %	0 %	384137064
112	NC_017168	TC	3	6	73891	73896	0 %	50 %	0 %	50 %	384137066
113	NC_017168	CA	3	6	74347	74352	50 %	0 %	0 %	50 %	384137066
114	NC_017168	GC	3	6	75350	75355	0 %	0 %	50 %	50 %	384137067
115	NC_017168	AG	3	6	78236	78241	50 %	0 %	50 %	0 %	384137071
116	NC_017168	CG	3	6	78887	78892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017168	CG	3	6	79559	79564	0 %	0 %	50 %	50 %	384137072
118	NC_017168	CT	3	6	79953	79958	0 %	50 %	0 %	50 %	384137073
119	NC_017168	GC	4	8	82185	82192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017168	GT	3	6	83468	83473	0 %	50 %	50 %	0 %	384137075
121	NC_017168	GA	3	6	85520	85525	50 %	0 %	50 %	0 %	384137077
122	NC_017168	TC	3	6	87434	87439	0 %	50 %	0 %	50 %	384137079
123	NC_017168	CT	3	6	87450	87455	0 %	50 %	0 %	50 %	384137079
124	NC_017168	TG	3	6	89423	89428	0 %	50 %	50 %	0 %	384137080
125	NC_017168	TC	4	8	90200	90207	0 %	50 %	0 %	50 %	384137081
126	NC_017168	CG	3	6	90429	90434	0 %	0 %	50 %	50 %	384137081
127	NC_017168	TC	3	6	90543	90548	0 %	50 %	0 %	50 %	384137081
128	NC_017168	CG	3	6	92064	92069	0 %	0 %	50 %	50 %	384137083
129	NC_017168	GT	3	6	92311	92316	0 %	50 %	50 %	0 %	384137083
130	NC_017168	CT	3	6	93245	93250	0 %	50 %	0 %	50 %	384137084
131	NC_017168	GT	3	6	94060	94065	0 %	50 %	50 %	0 %	384137084
132	NC_017168	GC	3	6	94277	94282	0 %	0 %	50 %	50 %	384137084
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135	NC_017168	GT	3	6	96290	96295	0 %	50 %	50 %	0 %	384137087
136	NC_017168	TC	3	6	99575	99580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017168	TA	3	6	99640	99645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017168	GA	3	6	100212	100217	50 %	0 %	50 %	0 %	384137091
139	NC_017168	AT	4	8	100650	100657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017168	CT	3	6	100693	100698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017168	TG	3	6	101712	101717	0 %	50 %	50 %	0 %	384137092
142	NC_017168	GA	3	6	102185	102190	50 %	0 %	50 %	0 %	384137093
143	NC_017168	GA	3	6	102801	102806	50 %	0 %	50 %	0 %	384137094
144	NC_017168	CG	3	6	102926	102931	0 %	0 %	50 %	50 %	384137094
145	NC_017168	AC	3	6	103481	103486	50 %	0 %	0 %	50 %	384137095
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