MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 1028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017167	TGAC	2	8	11463	11470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017167	AGCC	2	8	12174	12181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017167	GCGA	2	8	12613	12620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017167	AGCC	2	8	12710	12717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017167	GGCC	2	8	12749	12756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017167	GCGA	2	8	13035	13042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017167	GCGA	2	8	13391	13398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017167	GGGA	2	8	13960	13967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017167	ACCG	2	8	15089	15096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017167	GAAG	2	8	15211	15218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017167	GCGA	2	8	15369	15376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017167	GCGA	2	8	15510	15517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017167	CGAG	2	8	15549	15556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017167	AGGT	2	8	15671	15678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017167	GGGC	2	8	15860	15867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017167	CGGT	2	8	17620	17627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017167	GCGT	2	8	21008	21015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017167	CATG	2	8	23012	23019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017167	CGTG	2	8	23654	23661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017167	CTGT	2	8	23697	23704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017167	TCCG	2	8	26135	26142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017167	TAGG	2	8	26156	26163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017167	TGAA	2	8	26309	26316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017167	CGAG	2	8	26381	26388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017167	ACCA	2	8	29929	29936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017167	GGGC	2	8	33260	33267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017167	GCGG	2	8	37804	37811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017167	CACT	2	8	37863	37870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017167	GACA	2	8	38118	38125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017167	CGGT	2	8	39385	39392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017167	AATC	2	8	51613	51620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017167	CGTC	2	8	58779	58786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017167	GAAC	2	8	62888	62895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017167	GGGA	2	8	66730	66737	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017167	ACGG	2	8	70604	70611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017167	AAGA	2	8	72615	72622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017167	ACGG	2	8	72709	72716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017167	TGCG	2	8	74771	74778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017167	GGTT	2	8	78271	78278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017167	CGAG	2	8	78329	78336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017167	ATCC	2	8	78416	78423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017167	TGGG	2	8	84150	84157	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017167	TTGT	2	8	86719	86726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017167	AGAA	2	8	88605	88612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017167	CATG	2	8	88671	88678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017167	TCCT	2	8	91248	91255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017167	TGCG	2	8	91331	91338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017167	TCCA	2	8	96326	96333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017167	TCCC	2	8	102439	102446	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017167	GAAG	2	8	104316	104323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017167	CGGC	2	8	108101	108108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017167	CGTT	2	8	116903	116910	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017167	GCGG	2	8	116945	116952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017167	GGGC	2	8	117785	117792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017167	GAGT	2	8	117813	117820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017167	TGCC	2	8	118215	118222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017167	CCGC	2	8	121474	121481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017167	GCCG	2	8	121549	121556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017167	CAGG	2	8	122202	122209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017167	GCGG	2	8	128640	128647	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017167	CTCG	2	8	136931	136938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017167	CATC	2	8	138758	138765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017167	ACTC	2	8	139683	139690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017167	AAGC	2	8	139736	139743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017167	CTTC	2	8	140989	140996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017167	GCAA	2	8	141317	141324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017167	TCAC	2	8	142003	142010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017167	ACGA	2	8	144427	144434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017167	GATA	2	8	147249	147256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017167	TTTC	2	8	150033	150040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017167	GATG	2	8	151547	151554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017167	ATGT	2	8	151633	151640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017167	CTTC	2	8	152215	152222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017167	AGAT	2	8	152281	152288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017167	GATT	2	8	152435	152442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017167	TACA	2	8	152523	152530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017167	GACG	2	8	155634	155641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017167	AGGG	2	8	156118	156125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017167	TGCG	2	8	156242	156249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017167	CATG	2	8	156516	156523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017167	AACG	2	8	158580	158587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017167	CGGC	2	8	159010	159017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017167	GGTG	2	8	161239	161246	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017167	GTTC	2	8	165094	165101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017167	GAAG	2	8	165126	165133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017167	CGAG	2	8	171962	171969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017167	GTGC	2	8	175062	175069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017167	GCGG	2	8	178975	178982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017167	GGTC	2	8	185932	185939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017167	GAGT	2	8	185974	185981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017167	GGAG	2	8	186189	186196	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017167	AAGA	2	8	188404	188411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017167	GACG	2	8	204953	204960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017167	ATGG	2	8	205290	205297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017167	GAAG	2	8	205448	205455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017167	ATCT	2	8	206409	206416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017167	CGAC	2	8	207457	207464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017167	CGCA	2	8	208210	208217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017167	ACCA	2	8	211998	212005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017167	GTCG	2	8	212106	212113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017167	GGCC	2	8	212526	212533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017167	TCGA	2	8	215294	215301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017167	AGGG	2	8	221443	221450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017167	GGCG	2	8	234824	234831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017167	ACGT	2	8	239378	239385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017167	CTCG	2	8	240493	240500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017167	CGAC	2	8	240596	240603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017167	GGCG	2	8	247550	247557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017167	TCTT	2	8	247558	247565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017167	CGGT	2	8	249563	249570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017167	CCAG	2	8	250613	250620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017167	ACGC	2	8	250716	250723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017167	TTCG	2	8	250834	250841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017167	TGAA	2	8	251047	251054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017167	CGCC	2	8	257154	257161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017167	TGAC	2	8	258100	258107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017167	AGCC	2	8	258814	258821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017167	GCGA	2	8	259252	259259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017167	AGCC	2	8	259350	259357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017167	GGCC	2	8	259389	259396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017167	GCGA	2	8	259676	259683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017167	GCGA	2	8	260033	260040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017167	GGGA	2	8	260602	260609	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017167	ACCG	2	8	261732	261739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017167	GAAG	2	8	261852	261859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017167	AGGT	2	8	262314	262321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017167	GAAA	2	8	263524	263531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017167	TTTG	2	8	271348	271355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017167	CAAC	2	8	278796	278803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017167	AAGA	2	8	281364	281371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017167	CCGG	2	8	283154	283161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017167	CTTG	2	8	291925	291932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017167	CTGC	2	8	297821	297828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017167	TGGA	2	8	299138	299145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017167	GAGT	2	8	299184	299191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017167	TTCC	2	8	299735	299742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017167	ATAA	2	8	299931	299938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017167	AGAA	2	8	304404	304411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017167	GACA	2	8	304419	304426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017167	AGGG	2	8	304428	304435	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017167	CGTC	2	8	308896	308903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017167	CGCT	2	8	309065	309072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017167	CCAT	2	8	320857	320864	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017167	CGTT	2	8	322130	322137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017167	CAGG	2	8	331733	331740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017167	AGGC	2	8	332617	332624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017167	CCAA	2	8	332758	332765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017167	TTAC	2	8	333086	333093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017167	TGAC	2	8	334169	334176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017167	AGCC	2	8	334883	334890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017167	GCGA	2	8	335322	335329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_017167	TCAT	2	8	1505883	1505890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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