MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017167	AC	3	6	6075	6080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017167	GC	3	6	8594	8599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017167	GC	3	6	8610	8615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017167	GC	3	6	9706	9711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017167	CG	3	6	10627	10632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017167	AC	3	6	10663	10668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017167	GA	3	6	10938	10943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017167	AC	3	6	11557	11562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017167	AC	3	6	11939	11944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017167	AC	3	6	12108	12113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017167	GT	3	6	12300	12305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017167	CT	3	6	12327	12332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017167	CG	3	6	12785	12790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017167	GC	3	6	14075	14080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017167	GA	3	6	14413	14418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017167	CG	3	6	14727	14732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017167	AG	3	6	15433	15438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017167	CT	3	6	15778	15783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017167	TG	3	6	15945	15950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017167	GA	3	6	18599	18604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017167	GT	4	8	23341	23348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017167	GA	3	6	26329	26334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017167	GA	3	6	33158	33163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017167	AG	4	8	36191	36198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017167	CA	3	6	36255	36260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017167	GA	3	6	36344	36349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017167	CG	3	6	38162	38167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017167	GA	3	6	39451	39456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017167	GC	3	6	43001	43006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017167	CG	3	6	46635	46640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017167	GC	3	6	51815	51820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017167	GT	3	6	55598	55603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017167	GT	3	6	58748	58753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017167	CA	3	6	59720	59725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017167	CG	3	6	59752	59757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017167	CG	3	6	59773	59778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017167	GC	3	6	59867	59872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017167	CG	3	6	60829	60834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017167	GC	3	6	63594	63599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017167	CG	3	6	63603	63608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017167	GC	3	6	73042	73047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017167	GC	3	6	74730	74735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017167	GA	3	6	76518	76523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017167	TC	3	6	86657	86662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017167	GA	3	6	88557	88562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017167	CG	3	6	89947	89952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017167	CT	3	6	89959	89964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017167	GA	3	6	89986	89991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017167	TA	3	6	97370	97375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017167	TC	3	6	100293	100298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017167	TG	3	6	104333	104338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017167	CG	3	6	104354	104359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017167	GC	3	6	108169	108174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017167	CG	3	6	111237	111242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017167	CG	3	6	114297	114302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017167	TA	4	8	120501	120508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017167	CG	3	6	121229	121234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017167	CG	3	6	121482	121487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017167	GC	3	6	121566	121571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017167	GA	3	6	129562	129567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017167	CT	3	6	129639	129644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017167	CG	3	6	129736	129741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017167	CG	3	6	131774	131779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017167	CT	3	6	141039	141044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017167	TA	3	6	141079	141084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017167	AG	3	6	141101	141106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017167	TA	3	6	141168	141173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017167	AG	3	6	141205	141210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017167	AT	3	6	142530	142535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017167	AG	3	6	144896	144901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017167	AG	3	6	145074	145079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017167	CA	3	6	149952	149957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017167	GA	3	6	151694	151699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017167	GA	3	6	151905	151910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017167	TG	3	6	152089	152094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017167	CG	3	6	156601	156606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017167	CG	3	6	158541	158546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017167	CT	3	6	158654	158659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017167	GC	3	6	163540	163545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017167	CG	3	6	165321	165326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017167	CG	3	6	165387	165392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017167	CG	3	6	165401	165406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017167	CA	3	6	169894	169899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017167	TC	3	6	173238	173243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017167	GC	3	6	174928	174933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017167	GA	3	6	175086	175091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017167	TA	3	6	176864	176869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017167	GC	3	6	178947	178952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017167	AG	3	6	207484	207489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017167	AT	3	6	207861	207866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017167	TG	3	6	210404	210409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017167	GC	3	6	212123	212128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017167	GA	3	6	212151	212156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017167	GT	3	6	212252	212257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017167	CG	3	6	212425	212430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017167	GT	3	6	213861	213866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017167	CG	3	6	214475	214480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017167	CT	3	6	214606	214611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017167	GT	3	6	215092	215097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017167	CG	4	8	216476	216483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017167	TG	3	6	216618	216623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017167	GT	3	6	220784	220789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017167	GC	3	6	225173	225178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017167	TG	3	6	227841	227846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017167	CA	3	6	227953	227958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017167	GC	3	6	227961	227966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017167	GC	3	6	238916	238921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017167	CG	3	6	240050	240055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017167	GC	3	6	240585	240590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017167	CG	3	6	247537	247542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017167	TG	3	6	251010	251015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017167	TG	3	6	254737	254742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017167	GC	3	6	254821	254826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017167	GA	3	6	254896	254901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017167	CG	3	6	257266	257271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017167	AC	3	6	257302	257307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017167	GA	3	6	257573	257578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017167	AC	3	6	258195	258200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017167	AC	3	6	258579	258584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017167	AC	3	6	258747	258752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017167	GT	3	6	258940	258945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017167	CT	3	6	258966	258971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017167	CG	3	6	259425	259430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017167	GC	3	6	260717	260722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017167	GA	3	6	261055	261060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017167	CG	3	6	261369	261374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017167	AG	3	6	264495	264500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017167	GC	3	6	265835	265840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017167	GC	3	6	271363	271368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017167	CG	3	6	271371	271376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017167	GC	3	6	278614	278619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017167	GC	3	6	281837	281842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017167	GC	3	6	281880	281885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017167	CG	3	6	297379	297384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017167	TG	3	6	297623	297628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017167	TC	3	6	297748	297753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017167	TC	3	6	297788	297793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017167	AG	3	6	299788	299793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017167	GC	4	8	299818	299825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017167	GC	4	8	299859	299866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017167	GC	3	6	306354	306359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017167	AG	3	6	308622	308627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017167	GC	3	6	308723	308728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017167	GC	3	6	308758	308763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017167	GT	3	6	310806	310811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017167	CG	3	6	315789	315794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017167	CG	3	6	315809	315814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017167	GC	3	6	322059	322064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017167	GC	3	6	322083	322088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017167	GC	3	6	322173	322178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017167	AG	3	6	328503	328508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017167	CG	3	6	331061	331066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017167	GC	3	6	332623	332628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017167	GC	3	6	332660	332665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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