MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p2ABTCDC0715

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017166	AAAAT	2	10	201	210	80 %	20 %	0 %	0 %	385239414
2	NC_017166	TAAAA	2	10	750	759	80 %	20 %	0 %	0 %	385239415
3	NC_017166	ATTGC	2	10	3673	3682	20 %	40 %	20 %	20 %	385239420
4	NC_017166	AAAAG	2	10	5466	5475	80 %	0 %	20 %	0 %	385239422
5	NC_017166	ATGAA	2	10	5630	5639	60 %	20 %	20 %	0 %	385239423
6	NC_017166	AAACA	2	10	5708	5717	80 %	0 %	0 %	20 %	385239423
7	NC_017166	GTGGG	2	10	6286	6295	0 %	20 %	80 %	0 %	385239425
8	NC_017166	GTTTT	2	10	6412	6421	0 %	80 %	20 %	0 %	385239425
9	NC_017166	TCTTT	2	10	6665	6674	0 %	80 %	0 %	20 %	385239426
10	NC_017166	TTTGT	2	10	7682	7691	0 %	80 %	20 %	0 %	385239427
11	NC_017166	GAAAA	2	10	10232	10241	80 %	0 %	20 %	0 %	385239431
12	NC_017166	AATGC	2	10	10485	10494	40 %	20 %	20 %	20 %	385239431
13	NC_017166	GAATC	2	10	11309	11318	40 %	20 %	20 %	20 %	385239432
14	NC_017166	ATCGT	2	10	14318	14327	20 %	40 %	20 %	20 %	385239434
15	NC_017166	AATGG	2	10	17138	17147	40 %	20 %	40 %	0 %	385239438
16	NC_017166	AACTT	2	10	17217	17226	40 %	40 %	0 %	20 %	385239438
17	NC_017166	GAAAA	2	10	18207	18216	80 %	0 %	20 %	0 %	385239438
18	NC_017166	ACAGA	2	10	19269	19278	60 %	0 %	20 %	20 %	385239439
19	NC_017166	ACAAA	2	10	19313	19322	80 %	0 %	0 %	20 %	385239439
20	NC_017166	GCAAA	2	10	19431	19440	60 %	0 %	20 %	20 %	385239439
21	NC_017166	ACTTG	2	10	20849	20858	20 %	40 %	20 %	20 %	385239441
22	NC_017166	ATTCA	2	10	21208	21217	40 %	40 %	0 %	20 %	385239441
23	NC_017166	AATTT	2	10	24200	24209	40 %	60 %	0 %	0 %	385239442
24	NC_017166	TGCTA	2	10	26457	26466	20 %	40 %	20 %	20 %	385239445
25	NC_017166	TAGTG	2	10	26624	26633	20 %	40 %	40 %	0 %	385239445
26	NC_017166	TATAG	2	10	26727	26736	40 %	40 %	20 %	0 %	385239445
27	NC_017166	AGCAA	2	10	27011	27020	60 %	0 %	20 %	20 %	385239445
28	NC_017166	ATTCA	2	10	32062	32071	40 %	40 %	0 %	20 %	385239451
29	NC_017166	AAATG	2	10	33821	33830	60 %	20 %	20 %	0 %	385239452
30	NC_017166	AATGA	2	10	36106	36115	60 %	20 %	20 %	0 %	385239456
31	NC_017166	ATCAA	2	10	36121	36130	60 %	20 %	0 %	20 %	385239456
32	NC_017166	CTATT	2	10	38601	38610	20 %	60 %	0 %	20 %	385239464
33	NC_017166	AATAC	2	10	41285	41294	60 %	20 %	0 %	20 %	385239470
34	NC_017166	ACTTT	2	10	42170	42179	20 %	60 %	0 %	20 %	385239471
35	NC_017166	TCAAA	2	10	42983	42992	60 %	20 %	0 %	20 %	385239472
36	NC_017166	ATGCA	2	10	45818	45827	40 %	20 %	20 %	20 %	385239474
37	NC_017166	AAATG	2	10	46748	46757	60 %	20 %	20 %	0 %	385239477
38	NC_017166	AGCAA	2	10	47282	47291	60 %	0 %	20 %	20 %	385239477
39	NC_017166	TCTAT	2	10	48033	48042	20 %	60 %	0 %	20 %	385239478
40	NC_017166	AAAAT	2	10	49233	49242	80 %	20 %	0 %	0 %	385239479
41	NC_017166	AAAAT	2	10	49515	49524	80 %	20 %	0 %	0 %	385239480
42	NC_017166	AAACA	2	10	50022	50031	80 %	0 %	0 %	20 %	385239480
43	NC_017166	TTAAG	2	10	50194	50203	40 %	40 %	20 %	0 %	385239481
44	NC_017166	GCTAT	2	10	52798	52807	20 %	40 %	20 %	20 %	385239486
45	NC_017166	AAAAG	2	10	52950	52959	80 %	0 %	20 %	0 %	385239486
46	NC_017166	ATTTG	2	10	55271	55280	20 %	60 %	20 %	0 %	385239489
47	NC_017166	CGGAT	2	10	55501	55510	20 %	20 %	40 %	20 %	385239490
48	NC_017166	AACAA	2	10	57038	57047	80 %	0 %	0 %	20 %	385239493
49	NC_017166	AATTT	2	10	59729	59738	40 %	60 %	0 %	0 %	385239497
50	NC_017166	AAATT	2	10	60735	60744	60 %	40 %	0 %	0 %	385239499
51	NC_017166	ATTTT	2	10	62346	62355	20 %	80 %	0 %	0 %	385239501
52	NC_017166	TTTCC	2	10	64238	64247	0 %	60 %	0 %	40 %	385239501
53	NC_017166	ACCAT	2	10	64949	64958	40 %	20 %	0 %	40 %	385239501
54	NC_017166	CTTTT	2	10	66591	66600	0 %	80 %	0 %	20 %	385239502
55	NC_017166	TTTAA	2	10	67070	67079	40 %	60 %	0 %	0 %	385239502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.