MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p2ABTCDC0715

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017166	ATTT	2	8	3	10	25 %	75 %	0 %	0 %	385239414
2	NC_017166	CTTT	2	8	335	342	0 %	75 %	0 %	25 %	385239415
3	NC_017166	ATCA	2	8	441	448	50 %	25 %	0 %	25 %	385239415
4	NC_017166	TTAA	2	8	1776	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	385239417
5	NC_017166	AAAT	2	8	2170	2177	75 %	25 %	0 %	0 %	385239418
6	NC_017166	CTTT	2	8	2533	2540	0 %	75 %	0 %	25 %	385239419
7	NC_017166	TAAT	2	8	2773	2780	50 %	50 %	0 %	0 %	385239419
8	NC_017166	ACTA	2	8	2847	2854	50 %	25 %	0 %	25 %	385239419
9	NC_017166	TTAA	2	8	3706	3713	50 %	50 %	0 %	0 %	385239420
10	NC_017166	TGTT	2	8	5096	5103	0 %	75 %	25 %	0 %	385239422
11	NC_017166	GTAT	2	8	5119	5126	25 %	50 %	25 %	0 %	385239422
12	NC_017166	TGGA	2	8	5156	5163	25 %	25 %	50 %	0 %	385239422
13	NC_017166	CATT	2	8	5246	5253	25 %	50 %	0 %	25 %	385239422
14	NC_017166	TCAG	2	8	5525	5532	25 %	25 %	25 %	25 %	385239422
15	NC_017166	ATGA	2	8	5725	5732	50 %	25 %	25 %	0 %	385239423
16	NC_017166	AAAT	2	8	5866	5873	75 %	25 %	0 %	0 %	385239423
17	NC_017166	CTTA	2	8	6681	6688	25 %	50 %	0 %	25 %	385239426
18	NC_017166	TAAT	2	8	6827	6834	50 %	50 %	0 %	0 %	385239426
19	NC_017166	ATGT	2	8	7574	7581	25 %	50 %	25 %	0 %	385239427
20	NC_017166	CGTT	2	8	7637	7644	0 %	50 %	25 %	25 %	385239427
21	NC_017166	GTAT	2	8	7713	7720	25 %	50 %	25 %	0 %	385239427
22	NC_017166	AACT	2	8	7734	7741	50 %	25 %	0 %	25 %	385239427
23	NC_017166	CAAC	2	8	8264	8271	50 %	0 %	0 %	50 %	385239428
24	NC_017166	GCGA	2	8	8397	8404	25 %	0 %	50 %	25 %	385239428
25	NC_017166	AAGC	2	8	8984	8991	50 %	0 %	25 %	25 %	385239428
26	NC_017166	TTTG	2	8	9422	9429	0 %	75 %	25 %	0 %	385239429
27	NC_017166	CAAA	2	8	9472	9479	75 %	0 %	0 %	25 %	385239429
28	NC_017166	CATT	2	8	9991	9998	25 %	50 %	0 %	25 %	385239430
29	NC_017166	CAAT	2	8	10261	10268	50 %	25 %	0 %	25 %	385239431
30	NC_017166	TCTA	2	8	10603	10610	25 %	50 %	0 %	25 %	385239431
31	NC_017166	AGCC	2	8	10785	10792	25 %	0 %	25 %	50 %	385239431
32	NC_017166	AATA	2	8	10817	10824	75 %	25 %	0 %	0 %	385239431
33	NC_017166	TTTA	2	8	11564	11571	25 %	75 %	0 %	0 %	385239432
34	NC_017166	AAGC	2	8	11991	11998	50 %	0 %	25 %	25 %	385239432
35	NC_017166	ATTT	2	8	12427	12434	25 %	75 %	0 %	0 %	385239432
36	NC_017166	TATG	2	8	12737	12744	25 %	50 %	25 %	0 %	385239432
37	NC_017166	GAAA	2	8	12869	12876	75 %	0 %	25 %	0 %	385239432
38	NC_017166	AAAC	2	8	12943	12950	75 %	0 %	0 %	25 %	385239432
39	NC_017166	CGAT	2	8	13722	13729	25 %	25 %	25 %	25 %	385239433
40	NC_017166	AGAA	2	8	16165	16172	75 %	0 %	25 %	0 %	385239436
41	NC_017166	TTTG	2	8	16255	16262	0 %	75 %	25 %	0 %	385239437
42	NC_017166	AAAC	2	8	16571	16578	75 %	0 %	0 %	25 %	385239437
43	NC_017166	ATGT	2	8	16978	16985	25 %	50 %	25 %	0 %	385239438
44	NC_017166	CAAG	2	8	17357	17364	50 %	0 %	25 %	25 %	385239438
45	NC_017166	GCAC	2	8	17879	17886	25 %	0 %	25 %	50 %	385239438
46	NC_017166	TGCG	2	8	17923	17930	0 %	25 %	50 %	25 %	385239438
47	NC_017166	AAGC	2	8	18959	18966	50 %	0 %	25 %	25 %	385239438
48	NC_017166	TAAA	2	8	19195	19202	75 %	25 %	0 %	0 %	385239439
49	NC_017166	AGAA	2	8	19748	19755	75 %	0 %	25 %	0 %	385239439
50	NC_017166	ATTA	2	8	20208	20215	50 %	50 %	0 %	0 %	385239441
51	NC_017166	AAAT	2	8	20285	20292	75 %	25 %	0 %	0 %	385239441
52	NC_017166	GTTT	2	8	20360	20367	0 %	75 %	25 %	0 %	385239441
53	NC_017166	TAAA	2	8	20471	20478	75 %	25 %	0 %	0 %	385239441
54	NC_017166	CCAA	2	8	20947	20954	50 %	0 %	0 %	50 %	385239441
55	NC_017166	ATAA	2	8	21614	21621	75 %	25 %	0 %	0 %	385239441
56	NC_017166	TAGA	2	8	21788	21795	50 %	25 %	25 %	0 %	385239442
57	NC_017166	TTGG	2	8	21821	21828	0 %	50 %	50 %	0 %	385239442
58	NC_017166	GGAT	2	8	21970	21977	25 %	25 %	50 %	0 %	385239442
59	NC_017166	ACTT	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	385239442
60	NC_017166	ATTA	2	8	22791	22798	50 %	50 %	0 %	0 %	385239442
61	NC_017166	CAAT	2	8	23260	23267	50 %	25 %	0 %	25 %	385239442
62	NC_017166	GAAC	2	8	23462	23469	50 %	0 %	25 %	25 %	385239442
63	NC_017166	TAAG	2	8	23507	23514	50 %	25 %	25 %	0 %	385239442
64	NC_017166	AACA	2	8	23848	23855	75 %	0 %	0 %	25 %	385239442
65	NC_017166	GATT	2	8	24495	24502	25 %	50 %	25 %	0 %	385239442
66	NC_017166	GAAA	2	8	24543	24550	75 %	0 %	25 %	0 %	385239442
67	NC_017166	TCGA	2	8	25174	25181	25 %	25 %	25 %	25 %	385239443
68	NC_017166	TAAA	2	8	25227	25234	75 %	25 %	0 %	0 %	385239443
69	NC_017166	TATT	2	8	26076	26083	25 %	75 %	0 %	0 %	385239444
70	NC_017166	ACTA	2	8	26753	26760	50 %	25 %	0 %	25 %	385239445
71	NC_017166	TGAA	2	8	26980	26987	50 %	25 %	25 %	0 %	385239445
72	NC_017166	AAAG	2	8	27337	27344	75 %	0 %	25 %	0 %	385239445
73	NC_017166	ATGT	2	8	27617	27624	25 %	50 %	25 %	0 %	385239445
74	NC_017166	TTAT	2	8	28144	28151	25 %	75 %	0 %	0 %	385239446
75	NC_017166	GAAA	2	8	28190	28197	75 %	0 %	25 %	0 %	385239446
76	NC_017166	TTAT	2	8	28236	28243	25 %	75 %	0 %	0 %	385239446
77	NC_017166	AATT	2	8	28957	28964	50 %	50 %	0 %	0 %	385239446
78	NC_017166	ATAA	2	8	29403	29410	75 %	25 %	0 %	0 %	385239447
79	NC_017166	TCAC	2	8	30458	30465	25 %	25 %	0 %	50 %	385239449
80	NC_017166	AATC	2	8	31072	31079	50 %	25 %	0 %	25 %	385239449
81	NC_017166	AAAG	2	8	31148	31155	75 %	0 %	25 %	0 %	385239449
82	NC_017166	AATA	2	8	31586	31593	75 %	25 %	0 %	0 %	385239450
83	NC_017166	TAAA	2	8	31987	31994	75 %	25 %	0 %	0 %	385239451
84	NC_017166	CAAT	2	8	32019	32026	50 %	25 %	0 %	25 %	385239451
85	NC_017166	AAAT	2	8	32554	32561	75 %	25 %	0 %	0 %	385239451
86	NC_017166	TTGG	2	8	32667	32674	0 %	50 %	50 %	0 %	385239451
87	NC_017166	TTAT	2	8	32745	32752	25 %	75 %	0 %	0 %	385239451
88	NC_017166	AATG	2	8	32780	32787	50 %	25 %	25 %	0 %	385239451
89	NC_017166	AAAT	2	8	33016	33023	75 %	25 %	0 %	0 %	385239452
90	NC_017166	AATT	2	8	33697	33704	50 %	50 %	0 %	0 %	385239452
91	NC_017166	AGTT	2	8	33755	33762	25 %	50 %	25 %	0 %	385239452
92	NC_017166	AAAG	2	8	33972	33979	75 %	0 %	25 %	0 %	385239452
93	NC_017166	TTGA	2	8	33990	33997	25 %	50 %	25 %	0 %	385239452
94	NC_017166	AAGA	2	8	34409	34416	75 %	0 %	25 %	0 %	385239453
95	NC_017166	TTCA	2	8	35410	35417	25 %	50 %	0 %	25 %	385239455
96	NC_017166	TTGT	2	8	37030	37037	0 %	75 %	25 %	0 %	385239460
97	NC_017166	GCCA	2	8	37169	37176	25 %	0 %	25 %	50 %	385239460
98	NC_017166	AAGC	2	8	37192	37199	50 %	0 %	25 %	25 %	385239460
99	NC_017166	AATC	2	8	37453	37460	50 %	25 %	0 %	25 %	385239460
100	NC_017166	AACC	2	8	37522	37529	50 %	0 %	0 %	50 %	385239461
101	NC_017166	AATT	2	8	37995	38002	50 %	50 %	0 %	0 %	385239462
102	NC_017166	AAAC	2	8	38157	38164	75 %	0 %	0 %	25 %	385239462
103	NC_017166	TGAA	2	8	38527	38534	50 %	25 %	25 %	0 %	385239464
104	NC_017166	ACTC	2	8	38555	38562	25 %	25 %	0 %	50 %	385239464
105	NC_017166	TGAT	2	8	38824	38831	25 %	50 %	25 %	0 %	385239464
106	NC_017166	AGAA	2	8	38980	38987	75 %	0 %	25 %	0 %	385239465
107	NC_017166	AAGC	2	8	39586	39593	50 %	0 %	25 %	25 %	385239467
108	NC_017166	ATTG	2	8	41663	41670	25 %	50 %	25 %	0 %	385239470
109	NC_017166	TAAT	2	8	42459	42466	50 %	50 %	0 %	0 %	385239471
110	NC_017166	GATT	2	8	42467	42474	25 %	50 %	25 %	0 %	385239471
111	NC_017166	ATCG	2	8	43307	43314	25 %	25 %	25 %	25 %	385239472
112	NC_017166	CAAA	2	8	44359	44366	75 %	0 %	0 %	25 %	385239473
113	NC_017166	AACA	2	8	45837	45844	75 %	0 %	0 %	25 %	385239474
114	NC_017166	AGAA	2	8	46019	46026	75 %	0 %	25 %	0 %	385239474
115	NC_017166	ACTT	2	8	46585	46592	25 %	50 %	0 %	25 %	385239476
116	NC_017166	AATT	2	8	46661	46668	50 %	50 %	0 %	0 %	385239476
117	NC_017166	TTGA	2	8	47247	47254	25 %	50 %	25 %	0 %	385239477
118	NC_017166	AAAC	2	8	47851	47858	75 %	0 %	0 %	25 %	385239478
119	NC_017166	TTCA	2	8	47996	48003	25 %	50 %	0 %	25 %	385239478
120	NC_017166	TTCT	2	8	48705	48712	0 %	75 %	0 %	25 %	385239478
121	NC_017166	TATT	2	8	48994	49001	25 %	75 %	0 %	0 %	385239478
122	NC_017166	TTTC	2	8	49644	49651	0 %	75 %	0 %	25 %	385239480
123	NC_017166	TTTA	2	8	49670	49677	25 %	75 %	0 %	0 %	385239480
124	NC_017166	TGCT	2	8	49732	49739	0 %	50 %	25 %	25 %	385239480
125	NC_017166	ATTA	2	8	49829	49836	50 %	50 %	0 %	0 %	385239480
126	NC_017166	ATTA	2	8	50220	50227	50 %	50 %	0 %	0 %	385239482
127	NC_017166	TCCT	2	8	51061	51068	0 %	50 %	0 %	50 %	385239483
128	NC_017166	TCAG	2	8	51694	51701	25 %	25 %	25 %	25 %	385239484
129	NC_017166	TGAG	2	8	52721	52728	25 %	25 %	50 %	0 %	385239486
130	NC_017166	TTTA	2	8	52829	52836	25 %	75 %	0 %	0 %	385239486
131	NC_017166	TATC	2	8	53610	53617	25 %	50 %	0 %	25 %	385239487
132	NC_017166	CGTT	2	8	53780	53787	0 %	50 %	25 %	25 %	385239487
133	NC_017166	AGCA	2	8	54092	54099	50 %	0 %	25 %	25 %	385239488
134	NC_017166	TAAT	2	8	54166	54173	50 %	50 %	0 %	0 %	385239488
135	NC_017166	TAAT	2	8	54373	54380	50 %	50 %	0 %	0 %	385239488
136	NC_017166	TCAA	2	8	54454	54461	50 %	25 %	0 %	25 %	385239488
137	NC_017166	GGCC	2	8	55579	55586	0 %	0 %	50 %	50 %	385239490
138	NC_017166	CCAA	2	8	55661	55668	50 %	0 %	0 %	50 %	385239490
139	NC_017166	TAAC	2	8	55926	55933	50 %	25 %	0 %	25 %	385239491
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.