MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p1ABTCDC0715

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017165	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017165	GTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017165	GTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239403
4	NC_017165	ATT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017165	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017165	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239405
7	NC_017165	TTG	2	6	1273	1278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239405
8	NC_017165	CTG	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239405
9	NC_017165	GAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
10	NC_017165	TAG	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
11	NC_017165	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
12	NC_017165	AGA	3	9	1864	1872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
13	NC_017165	ATC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239406
14	NC_017165	AAG	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
15	NC_017165	TGA	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239406
16	NC_017165	GAA	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
17	NC_017165	CAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
18	NC_017165	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239406
19	NC_017165	CAC	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239406
20	NC_017165	ACA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
21	NC_017165	CAA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
22	NC_017165	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239406
23	NC_017165	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017165	GCT	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017165	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017165	ATT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017165	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017165	AAT	2	6	2907	2912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017165	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017165	CCA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239407
31	NC_017165	TTA	2	6	3155	3160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239407
32	NC_017165	TCA	2	6	3338	3343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239407
33	NC_017165	TGC	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
34	NC_017165	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
35	NC_017165	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239407
36	NC_017165	ACT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017165	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017165	CTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017165	AAT	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017165	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017165	GAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239408
42	NC_017165	TGG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239408
43	NC_017165	TGA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239408
44	NC_017165	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239408
45	NC_017165	TGA	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239409
46	NC_017165	CAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239409
47	NC_017165	TCA	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239409
48	NC_017165	TAG	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017165	GTT	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017165	TAC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
51	NC_017165	TGA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
52	NC_017165	TAT	2	6	4937	4942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
53	NC_017165	AAT	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
54	NC_017165	GTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239410
55	NC_017165	TAC	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
56	NC_017165	CAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
57	NC_017165	CTC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239410
58	NC_017165	AGA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
59	NC_017165	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
60	NC_017165	ATG	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
61	NC_017165	TAT	2	6	5580	5585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
62	NC_017165	TCA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
63	NC_017165	ATG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
64	NC_017165	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
65	NC_017165	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
66	NC_017165	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
67	NC_017165	ACC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239410
68	NC_017165	CAG	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
69	NC_017165	TAA	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
70	NC_017165	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
71	NC_017165	CTA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
72	NC_017165	AAT	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
73	NC_017165	GAT	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
74	NC_017165	CTG	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239410
75	NC_017165	CCT	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239410
76	NC_017165	TGA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
77	NC_017165	ATA	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
78	NC_017165	AAT	2	6	6972	6977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
79	NC_017165	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
80	NC_017165	TCT	2	6	7088	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017165	AGA	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017165	CAG	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017165	CAA	2	6	7414	7419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239411
84	NC_017165	AAC	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239411
85	NC_017165	ACT	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239411
86	NC_017165	ATG	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
87	NC_017165	TGA	2	6	7626	7631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
88	NC_017165	GCA	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239411
89	NC_017165	TCA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239411
90	NC_017165	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
91	NC_017165	TCA	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017165	AAT	2	6	8318	8323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017165	ACT	2	6	8334	8339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
94	NC_017165	ATC	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
95	NC_017165	CAT	2	6	8437	8442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
96	NC_017165	ATC	2	6	8503	8508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
97	NC_017165	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239412
98	NC_017165	TTA	2	6	8719	8724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.