MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii 1656-2 plasmid ABKp1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017163	CGGGC	2	10	251	260	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017163	AAATT	2	10	1377	1386	60 %	40 %	0 %	0 %	384133687
3	NC_017163	CTTAT	2	10	1525	1534	20 %	60 %	0 %	20 %	384133687
4	NC_017163	ATTTG	2	10	1967	1976	20 %	60 %	20 %	0 %	384133688
5	NC_017163	CGGAT	2	10	2197	2206	20 %	20 %	40 %	20 %	384133689
6	NC_017163	TTTAT	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017163	AACAA	2	10	3734	3743	80 %	0 %	0 %	20 %	384133692
8	NC_017163	CGGGC	2	10	6030	6039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017163	AATTT	2	10	6621	6630	40 %	60 %	0 %	0 %	384133697
10	NC_017163	AAATT	2	10	7627	7636	60 %	40 %	0 %	0 %	384133699
11	NC_017163	TATCT	2	10	8687	8696	20 %	60 %	0 %	20 %	384133702
12	NC_017163	TTTAT	2	10	10476	10485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017163	ATTAA	2	10	11296	11305	60 %	40 %	0 %	0 %	384133705
14	NC_017163	AAAAG	2	10	11776	11785	80 %	0 %	20 %	0 %	384133705
15	NC_017163	ATGGT	2	10	13418	13427	20 %	40 %	40 %	0 %	384133706
16	NC_017163	GTAGA	2	10	13498	13507	40 %	20 %	40 %	0 %	384133706
17	NC_017163	GGAAA	2	10	14129	14138	60 %	0 %	40 %	0 %	384133706
18	NC_017163	ATTAA	2	10	16638	16647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017163	AAATT	2	10	17159	17168	60 %	40 %	0 %	0 %	384133708
20	NC_017163	AAAAT	2	10	17472	17481	80 %	20 %	0 %	0 %	384133708
21	NC_017163	TAAAA	2	10	18021	18030	80 %	20 %	0 %	0 %	384133709
22	NC_017163	ATTGC	2	10	20944	20953	20 %	40 %	20 %	20 %	384133714
23	NC_017163	AAAAG	2	10	22737	22746	80 %	0 %	20 %	0 %	384133717
24	NC_017163	ATGAA	2	10	22901	22910	60 %	20 %	20 %	0 %	384133718
25	NC_017163	AAACA	2	10	22979	22988	80 %	0 %	0 %	20 %	384133718
26	NC_017163	GTGGG	2	10	23557	23566	0 %	20 %	80 %	0 %	384133720
27	NC_017163	GTTTT	2	10	23683	23692	0 %	80 %	20 %	0 %	384133720
28	NC_017163	TCTTT	2	10	23936	23945	0 %	80 %	0 %	20 %	384133721
29	NC_017163	TTTGT	2	10	24953	24962	0 %	80 %	20 %	0 %	384133722
30	NC_017163	GAAAA	2	10	27503	27512	80 %	0 %	20 %	0 %	384133726
31	NC_017163	AATGC	2	10	27756	27765	40 %	20 %	20 %	20 %	384133726
32	NC_017163	GAATC	2	10	28580	28589	40 %	20 %	20 %	20 %	384133727
33	NC_017163	ATCGT	2	10	31589	31598	20 %	40 %	20 %	20 %	384133729
34	NC_017163	AATGG	2	10	34409	34418	40 %	20 %	40 %	0 %	384133734
35	NC_017163	AACTT	2	10	34488	34497	40 %	40 %	0 %	20 %	384133734
36	NC_017163	GAAAA	2	10	35478	35487	80 %	0 %	20 %	0 %	384133734
37	NC_017163	ACAGA	2	10	36540	36549	60 %	0 %	20 %	20 %	384133735
38	NC_017163	ACAAA	2	10	36584	36593	80 %	0 %	0 %	20 %	384133735
39	NC_017163	GCAAA	2	10	36702	36711	60 %	0 %	20 %	20 %	384133735
40	NC_017163	ACTTG	2	10	38120	38129	20 %	40 %	20 %	20 %	384133737
41	NC_017163	ATTCA	2	10	38479	38488	40 %	40 %	0 %	20 %	384133737
42	NC_017163	AATTT	2	10	41471	41480	40 %	60 %	0 %	0 %	384133738
43	NC_017163	TGCTA	2	10	43729	43738	20 %	40 %	20 %	20 %	384133741
44	NC_017163	TTGTC	2	10	43784	43793	0 %	60 %	20 %	20 %	384133741
45	NC_017163	TATAG	2	10	43999	44008	40 %	40 %	20 %	0 %	384133741
46	NC_017163	AGCAA	2	10	44283	44292	60 %	0 %	20 %	20 %	384133741
47	NC_017163	ATGGG	2	10	44952	44961	20 %	20 %	60 %	0 %	384133741
48	NC_017163	TATTT	2	10	45966	45975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017163	TAAGA	2	10	47127	47136	60 %	20 %	20 %	0 %	384133745
50	NC_017163	TGATT	2	10	49024	49033	20 %	60 %	20 %	0 %	384133748
51	NC_017163	ATGCT	2	10	50271	50280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017163	AGTAT	2	10	51674	51683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017163	ATTCA	2	10	52225	52234	40 %	40 %	0 %	20 %	384133754
54	NC_017163	AAATG	2	10	53984	53993	60 %	20 %	20 %	0 %	384133755
55	NC_017163	TTAGA	2	10	54828	54837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017163	TTGAA	2	10	55898	55907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017163	AATGA	2	10	56269	56278	60 %	20 %	20 %	0 %	384133759
58	NC_017163	TGGAC	2	10	57941	57950	20 %	20 %	40 %	20 %	384133764
59	NC_017163	ATTTA	2	10	58862	58871	40 %	60 %	0 %	0 %	384133767
60	NC_017163	TGAAT	2	10	60828	60837	40 %	40 %	20 %	0 %	384133770
61	NC_017163	ATTTA	2	10	61159	61168	40 %	60 %	0 %	0 %	384133770
62	NC_017163	ATTAA	2	10	63108	63117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017163	AATAC	2	10	63354	63363	60 %	20 %	0 %	20 %	384133772
64	NC_017163	ACTTT	2	10	64239	64248	20 %	60 %	0 %	20 %	384133773
65	NC_017163	TCAAA	2	10	65053	65062	60 %	20 %	0 %	20 %	384133774
66	NC_017163	ATGCA	2	10	67888	67897	40 %	20 %	20 %	20 %	384133776
67	NC_017163	TTTAT	2	10	68564	68573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017163	AAATG	2	10	68768	68777	60 %	20 %	20 %	0 %	384133779
69	NC_017163	AGCAA	2	10	69302	69311	60 %	0 %	20 %	20 %	384133779
70	NC_017163	TCTAT	2	10	70053	70062	20 %	60 %	0 %	20 %	384133780
71	NC_017163	AAAAT	2	10	71253	71262	80 %	20 %	0 %	0 %	384133781
72	NC_017163	TTAAG	2	10	72214	72223	40 %	40 %	20 %	0 %	384133783

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.