MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	AATATA	2	12	57765	57776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017161	ATTATA	2	12	157828	157839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017161	AACCAG	2	12	192840	192851	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017161	CATAAG	2	12	193029	193040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017161	CGTTTT	2	12	210184	210195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017161	ATTCAC	2	12	238182	238193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017161	TGGAAT	2	12	269238	269249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017161	CTTTTG	2	12	383992	384003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017161	CTTTTG	2	12	405296	405307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017161	TTATAA	2	12	555743	555754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017161	TTGGCT	2	12	685402	685413	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017161	CCCTCT	2	12	810091	810102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017161	TTATAA	2	12	911045	911056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017161	AGCATA	2	12	932071	932082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017161	AAGAAA	2	12	942256	942267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017161	TAAAGA	2	12	996027	996038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017161	CTTTTT	2	12	1020676	1020687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017161	TAACTA	2	12	1026536	1026547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017161	CTTTGC	2	12	1206333	1206344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017161	TATGCT	2	12	1217142	1217153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017161	TTTATA	2	12	1244401	1244412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017161	GTTTAA	2	12	1260913	1260924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017161	TTCCTT	2	12	1263648	1263659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017161	ATTAAT	2	12	1371353	1371364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017161	ATTATC	2	12	1436137	1436148	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017161	GCTTTA	2	12	1492327	1492338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017161	TTTTAA	2	12	1516116	1516127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017161	CTTTTG	2	12	1532917	1532928	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017161	CAAAAG	2	12	1562713	1562724	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017161	GACCTT	2	12	1568590	1568601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017161	CTTTTT	2	12	1578925	1578936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.