MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	TTTTC	2	10	2755	2764	0 %	80 %	0 %	20 %	384128094
2	NC_017161	TAAAG	2	10	5399	5408	60 %	20 %	20 %	0 %	384128098
3	NC_017161	AACCA	2	10	6452	6461	60 %	0 %	0 %	40 %	384128098
4	NC_017161	TTTCT	2	10	9749	9758	0 %	80 %	0 %	20 %	384128102
5	NC_017161	CATAA	2	10	10140	10149	60 %	20 %	0 %	20 %	384128103
6	NC_017161	GGGAT	2	10	10742	10751	20 %	20 %	60 %	0 %	384128104
7	NC_017161	ATTTC	2	10	13041	13050	20 %	60 %	0 %	20 %	384128106
8	NC_017161	TTTTG	2	10	13119	13128	0 %	80 %	20 %	0 %	384128106
9	NC_017161	TTTAA	2	10	13524	13533	40 %	60 %	0 %	0 %	384128106
10	NC_017161	TCTTA	2	10	13616	13625	20 %	60 %	0 %	20 %	384128106
11	NC_017161	CTCTT	2	10	13787	13796	0 %	60 %	0 %	40 %	384128106
12	NC_017161	TATTT	2	10	16543	16552	20 %	80 %	0 %	0 %	384128108
13	NC_017161	GAATA	2	10	16736	16745	60 %	20 %	20 %	0 %	384128109
14	NC_017161	TTAAA	2	10	18894	18903	60 %	40 %	0 %	0 %	384128110
15	NC_017161	AAACA	2	10	19219	19228	80 %	0 %	0 %	20 %	384128110
16	NC_017161	TTCCT	2	10	21120	21129	0 %	60 %	0 %	40 %	384128111
17	NC_017161	AAAAG	2	10	22780	22789	80 %	0 %	20 %	0 %	384128114
18	NC_017161	TTACC	2	10	30618	30627	20 %	40 %	0 %	40 %	384128118
19	NC_017161	GAAGC	2	10	30665	30674	40 %	0 %	40 %	20 %	384128119
20	NC_017161	CTTAG	2	10	30868	30877	20 %	40 %	20 %	20 %	384128119
21	NC_017161	CCTTA	2	10	32447	32456	20 %	40 %	0 %	40 %	384128120
22	NC_017161	CCTCA	2	10	32651	32660	20 %	20 %	0 %	60 %	384128120
23	NC_017161	CTCGT	2	10	33512	33521	0 %	40 %	20 %	40 %	384128121
24	NC_017161	GAGCT	2	10	34284	34293	20 %	20 %	40 %	20 %	384128122
25	NC_017161	TGGTT	2	10	34433	34442	0 %	60 %	40 %	0 %	384128122
26	NC_017161	CATCT	2	10	34804	34813	20 %	40 %	0 %	40 %	384128122
27	NC_017161	ATATA	2	10	35886	35895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017161	CTTCT	2	10	37448	37457	0 %	60 %	0 %	40 %	384128124
29	NC_017161	CTGAG	2	10	38784	38793	20 %	20 %	40 %	20 %	384128124
30	NC_017161	GTAAA	2	10	42881	42890	60 %	20 %	20 %	0 %	384128128
31	NC_017161	ACCTG	2	10	43111	43120	20 %	20 %	20 %	40 %	384128129
32	NC_017161	TCCCC	2	10	45801	45810	0 %	20 %	0 %	80 %	384128131
33	NC_017161	TGTCT	2	10	47813	47822	0 %	60 %	20 %	20 %	384128131
34	NC_017161	CCTTC	2	10	48668	48677	0 %	40 %	0 %	60 %	384128132
35	NC_017161	CTTCT	2	10	49190	49199	0 %	60 %	0 %	40 %	384128132
36	NC_017161	AAGGC	2	10	49737	49746	40 %	0 %	40 %	20 %	384128133
37	NC_017161	GGCAG	2	10	50275	50284	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017161	GACAG	2	10	55074	55083	40 %	0 %	40 %	20 %	384128137
39	NC_017161	CACTT	2	10	56308	56317	20 %	40 %	0 %	40 %	384128139
40	NC_017161	AGCAT	2	10	56432	56441	40 %	20 %	20 %	20 %	384128139
41	NC_017161	CCTTA	2	10	56671	56680	20 %	40 %	0 %	40 %	384128139
42	NC_017161	ACACC	2	10	56888	56897	40 %	0 %	0 %	60 %	384128140
43	NC_017161	CTGCT	2	10	58616	58625	0 %	40 %	20 %	40 %	384128142
44	NC_017161	TGGTA	2	10	59082	59091	20 %	40 %	40 %	0 %	384128142
45	NC_017161	AGGTT	2	10	60720	60729	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017161	ATCTT	2	10	61805	61814	20 %	60 %	0 %	20 %	384128145
47	NC_017161	TGTGG	2	10	62145	62154	0 %	40 %	60 %	0 %	384128145
48	NC_017161	TCTTT	2	10	63564	63573	0 %	80 %	0 %	20 %	384128147
49	NC_017161	AAGTA	2	10	64898	64907	60 %	20 %	20 %	0 %	384128150
50	NC_017161	ACAAA	2	10	65029	65038	80 %	0 %	0 %	20 %	384128150
51	NC_017161	TATGG	2	10	66192	66201	20 %	40 %	40 %	0 %	384128150
52	NC_017161	GAAAA	2	10	67066	67075	80 %	0 %	20 %	0 %	384128152
53	NC_017161	TCTTT	2	10	70170	70179	0 %	80 %	0 %	20 %	384128155
54	NC_017161	CCCTT	2	10	71891	71900	0 %	40 %	0 %	60 %	384128158
55	NC_017161	GCCAA	2	10	72435	72444	40 %	0 %	20 %	40 %	384128159
56	NC_017161	TCCTC	2	10	74436	74445	0 %	40 %	0 %	60 %	384128161
57	NC_017161	GCACA	2	10	78539	78548	40 %	0 %	20 %	40 %	384128166
58	NC_017161	AAAAG	2	10	78553	78562	80 %	0 %	20 %	0 %	384128166
59	NC_017161	TATAT	2	10	79362	79371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017161	TTTAA	2	10	79456	79465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017161	TGGAA	2	10	79813	79822	40 %	20 %	40 %	0 %	384128168
62	NC_017161	GAAAA	2	10	79947	79956	80 %	0 %	20 %	0 %	384128168
63	NC_017161	GCTTT	2	10	84580	84589	0 %	60 %	20 %	20 %	384128172
64	NC_017161	TGGAT	2	10	85012	85021	20 %	40 %	40 %	0 %	384128172
65	NC_017161	GCTAC	2	10	86151	86160	20 %	20 %	20 %	40 %	384128173
66	NC_017161	TGCTC	2	10	88568	88577	0 %	40 %	20 %	40 %	384128177
67	NC_017161	CTCTC	2	10	93855	93864	0 %	40 %	0 %	60 %	384128180
68	NC_017161	AACTA	2	10	94296	94305	60 %	20 %	0 %	20 %	384128181
69	NC_017161	ACTCT	2	10	94799	94808	20 %	40 %	0 %	40 %	384128181
70	NC_017161	ACTGC	2	10	95087	95096	20 %	20 %	20 %	40 %	384128181
71	NC_017161	AAGGA	2	10	97209	97218	60 %	0 %	40 %	0 %	384128183
72	NC_017161	TACAC	2	10	100523	100532	40 %	20 %	0 %	40 %	384128186
73	NC_017161	TGCCT	2	10	101119	101128	0 %	40 %	20 %	40 %	384128186
74	NC_017161	GTCCT	2	10	105425	105434	0 %	40 %	20 %	40 %	384128190
75	NC_017161	AAGCT	2	10	105623	105632	40 %	20 %	20 %	20 %	384128190
76	NC_017161	TCTTT	2	10	105654	105663	0 %	80 %	0 %	20 %	384128190
77	NC_017161	CAAAA	2	10	105693	105702	80 %	0 %	0 %	20 %	384128190
78	NC_017161	ACCTC	2	10	106759	106768	20 %	20 %	0 %	60 %	384128193
79	NC_017161	CTTCT	2	10	107305	107314	0 %	60 %	0 %	40 %	384128193
80	NC_017161	ATCCT	2	10	109669	109678	20 %	40 %	0 %	40 %	384128194
81	NC_017161	CAGTC	2	10	110691	110700	20 %	20 %	20 %	40 %	384128195
82	NC_017161	TATTT	2	10	111674	111683	20 %	80 %	0 %	0 %	384128196
83	NC_017161	CCCTT	2	10	118232	118241	0 %	40 %	0 %	60 %	384128203
84	NC_017161	TGATA	2	10	119407	119416	40 %	40 %	20 %	0 %	384128205
85	NC_017161	GCCAT	2	10	122154	122163	20 %	20 %	20 %	40 %	384128208
86	NC_017161	AAAGC	2	10	130274	130283	60 %	0 %	20 %	20 %	384128216
87	NC_017161	CCCCT	2	10	132311	132320	0 %	20 %	0 %	80 %	384128218
88	NC_017161	TATAC	2	10	134361	134370	40 %	40 %	0 %	20 %	384128221
89	NC_017161	CTGTG	2	10	135152	135161	0 %	40 %	40 %	20 %	384128222
90	NC_017161	TACAT	2	10	135569	135578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017161	AGTAG	2	10	137105	137114	40 %	20 %	40 %	0 %	384128225
92	NC_017161	AAAAG	2	10	139616	139625	80 %	0 %	20 %	0 %	384128227
93	NC_017161	AGAAA	2	10	139677	139686	80 %	0 %	20 %	0 %	384128227
94	NC_017161	TCATC	2	10	140165	140174	20 %	40 %	0 %	40 %	384128228
95	NC_017161	AGAGG	2	10	142433	142442	40 %	0 %	60 %	0 %	384128229
96	NC_017161	GAGCA	2	10	144299	144308	40 %	0 %	40 %	20 %	384128231
97	NC_017161	AATGA	2	10	145386	145395	60 %	20 %	20 %	0 %	384128233
98	NC_017161	TCCCA	2	10	145935	145944	20 %	20 %	0 %	60 %	384128234
99	NC_017161	AGCTA	2	10	146042	146051	40 %	20 %	20 %	20 %	384128234
100	NC_017161	GTTGG	2	10	146515	146524	0 %	40 %	60 %	0 %	384128234
101	NC_017161	TCCTC	2	10	148037	148046	0 %	40 %	0 %	60 %	384128235
102	NC_017161	GAGGG	2	10	149345	149354	20 %	0 %	80 %	0 %	384128235
103	NC_017161	GCTTA	2	10	150651	150660	20 %	40 %	20 %	20 %	384128235
104	NC_017161	TAGCT	2	10	153892	153901	20 %	40 %	20 %	20 %	384128238
105	NC_017161	TCCTC	2	10	155836	155845	0 %	40 %	0 %	60 %	384128240
106	NC_017161	GAGCA	2	10	156096	156105	40 %	0 %	40 %	20 %	384128240
107	NC_017161	CATCC	2	10	156765	156774	20 %	20 %	0 %	60 %	384128241
108	NC_017161	CATCA	2	10	157952	157961	40 %	20 %	0 %	40 %	384128242
109	NC_017161	TTACC	2	10	158440	158449	20 %	40 %	0 %	40 %	384128242
110	NC_017161	AAGCT	2	10	159008	159017	40 %	20 %	20 %	20 %	384128243
111	NC_017161	CTTCC	2	10	159634	159643	0 %	40 %	0 %	60 %	384128243
112	NC_017161	TGGAG	2	10	161121	161130	20 %	20 %	60 %	0 %	384128244
113	NC_017161	GAAGA	2	10	163720	163729	60 %	0 %	40 %	0 %	384128247
114	NC_017161	GGCTT	2	10	164583	164592	0 %	40 %	40 %	20 %	384128248
115	NC_017161	GAAAA	2	10	164626	164635	80 %	0 %	20 %	0 %	384128248
116	NC_017161	TGAAG	2	10	166706	166715	40 %	20 %	40 %	0 %	384128251
117	NC_017161	AGAGG	2	10	171586	171595	40 %	0 %	60 %	0 %	384128256
118	NC_017161	AGGCA	2	10	172577	172586	40 %	0 %	40 %	20 %	384128257
119	NC_017161	TGCCA	2	10	172839	172848	20 %	20 %	20 %	40 %	384128257
120	NC_017161	GAAAG	2	10	174141	174150	60 %	0 %	40 %	0 %	384128258
121	NC_017161	AAAAG	2	10	176324	176333	80 %	0 %	20 %	0 %	384128260
122	NC_017161	CTCTA	2	10	176739	176748	20 %	40 %	0 %	40 %	384128261
123	NC_017161	TGATG	2	10	176799	176808	20 %	40 %	40 %	0 %	384128261
124	NC_017161	ATAGC	2	10	179127	179136	40 %	20 %	20 %	20 %	384128264
125	NC_017161	GCACA	2	10	182080	182089	40 %	0 %	20 %	40 %	384128267
126	NC_017161	AGCTG	2	10	186117	186126	20 %	20 %	40 %	20 %	384128271
127	NC_017161	CTATC	2	10	186610	186619	20 %	40 %	0 %	40 %	384128272
128	NC_017161	GCCTT	2	10	188089	188098	0 %	40 %	20 %	40 %	384128275
129	NC_017161	CTTCT	2	10	188762	188771	0 %	60 %	0 %	40 %	384128276
130	NC_017161	GTCCC	2	10	190865	190874	0 %	20 %	20 %	60 %	384128278
131	NC_017161	GCCTT	2	10	191055	191064	0 %	40 %	20 %	40 %	384128278
132	NC_017161	CAGCA	2	10	191656	191665	40 %	0 %	20 %	40 %	384128278
133	NC_017161	AAAGC	2	10	195226	195235	60 %	0 %	20 %	20 %	384128281
134	NC_017161	AAAAG	2	10	198964	198973	80 %	0 %	20 %	0 %	384128283
135	NC_017161	AAGGC	2	10	199772	199781	40 %	0 %	40 %	20 %	384128284
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174	NC_017161	CTCGG	2	10	244223	244232	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_017161	AGTAA	2	10	353243	353252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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