MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 4099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	AAGG	2	8	1267	1274	50 %	0 %	50 %	0 %	384128092
2	NC_017161	CTTG	2	8	1399	1406	0 %	50 %	25 %	25 %	384128093
3	NC_017161	AAAT	2	8	2345	2352	75 %	25 %	0 %	0 %	384128093
4	NC_017161	CAGG	2	8	2704	2711	25 %	0 %	50 %	25 %	384128094
5	NC_017161	ATGG	2	8	3628	3635	25 %	25 %	50 %	0 %	384128095
6	NC_017161	TACC	2	8	4389	4396	25 %	25 %	0 %	50 %	384128096
7	NC_017161	AGAA	2	8	5652	5659	75 %	0 %	25 %	0 %	384128098
8	NC_017161	AAAG	2	8	6515	6522	75 %	0 %	25 %	0 %	384128098
9	NC_017161	TGCT	2	8	6628	6635	0 %	50 %	25 %	25 %	384128099
10	NC_017161	CCTT	2	8	7230	7237	0 %	50 %	0 %	50 %	384128099
11	NC_017161	TGAA	2	8	8331	8338	50 %	25 %	25 %	0 %	384128100
12	NC_017161	TTTC	2	8	9844	9851	0 %	75 %	0 %	25 %	384128102
13	NC_017161	CCTT	2	8	9907	9914	0 %	50 %	0 %	50 %	384128102
14	NC_017161	AAGA	2	8	10040	10047	75 %	0 %	25 %	0 %	384128102
15	NC_017161	TGTA	2	8	10382	10389	25 %	50 %	25 %	0 %	384128103
16	NC_017161	GGAA	2	8	10923	10930	50 %	0 %	50 %	0 %	384128104
17	NC_017161	AATC	2	8	12465	12472	50 %	25 %	0 %	25 %	384128105
18	NC_017161	AGAA	2	8	12692	12699	75 %	0 %	25 %	0 %	384128105
19	NC_017161	ACTT	2	8	12892	12899	25 %	50 %	0 %	25 %	384128105
20	NC_017161	ATTT	2	8	14032	14039	25 %	75 %	0 %	0 %	384128106
21	NC_017161	CTTC	2	8	14664	14671	0 %	50 %	0 %	50 %	384128106
22	NC_017161	TTTA	2	8	15107	15114	25 %	75 %	0 %	0 %	384128106
23	NC_017161	ATTT	2	8	15887	15894	25 %	75 %	0 %	0 %	384128106
24	NC_017161	ATAG	2	8	15995	16002	50 %	25 %	25 %	0 %	384128106
25	NC_017161	CCAA	2	8	16076	16083	50 %	0 %	0 %	50 %	384128106
26	NC_017161	TTAA	2	8	16573	16580	50 %	50 %	0 %	0 %	384128109
27	NC_017161	TTTA	2	8	16581	16588	25 %	75 %	0 %	0 %	384128109
28	NC_017161	TATC	2	8	16679	16686	25 %	50 %	0 %	25 %	384128109
29	NC_017161	CTTT	2	8	16957	16964	0 %	75 %	0 %	25 %	384128109
30	NC_017161	GAGG	2	8	17348	17355	25 %	0 %	75 %	0 %	384128109
31	NC_017161	ATTC	2	8	17514	17521	25 %	50 %	0 %	25 %	384128109
32	NC_017161	TATT	2	8	17623	17630	25 %	75 %	0 %	0 %	384128109
33	NC_017161	TTTA	2	8	18109	18116	25 %	75 %	0 %	0 %	384128110
34	NC_017161	GTTT	2	8	18224	18231	0 %	75 %	25 %	0 %	384128110
35	NC_017161	TCCA	2	8	18420	18427	25 %	25 %	0 %	50 %	384128110
36	NC_017161	CTTC	2	8	19022	19029	0 %	50 %	0 %	50 %	384128110
37	NC_017161	TCTG	2	8	19039	19046	0 %	50 %	25 %	25 %	384128110
38	NC_017161	ATAA	2	8	19052	19059	75 %	25 %	0 %	0 %	384128110
39	NC_017161	CTTT	2	8	19084	19091	0 %	75 %	0 %	25 %	384128110
40	NC_017161	TCAA	2	8	19604	19611	50 %	25 %	0 %	25 %	384128110
41	NC_017161	CCTT	2	8	19652	19659	0 %	50 %	0 %	50 %	384128110
42	NC_017161	AGTA	2	8	19751	19758	50 %	25 %	25 %	0 %	384128110
43	NC_017161	TATT	2	8	19814	19821	25 %	75 %	0 %	0 %	384128110
44	NC_017161	TTTA	2	8	19948	19955	25 %	75 %	0 %	0 %	384128110
45	NC_017161	ACTT	2	8	20802	20809	25 %	50 %	0 %	25 %	384128111
46	NC_017161	CTTG	2	8	20903	20910	0 %	50 %	25 %	25 %	384128111
47	NC_017161	AAAG	2	8	20998	21005	75 %	0 %	25 %	0 %	384128111
48	NC_017161	GGGT	2	8	21313	21320	0 %	25 %	75 %	0 %	384128112
49	NC_017161	AGGT	2	8	21501	21508	25 %	25 %	50 %	0 %	384128112
50	NC_017161	GGAG	2	8	21740	21747	25 %	0 %	75 %	0 %	384128113
51	NC_017161	AAAG	2	8	21776	21783	75 %	0 %	25 %	0 %	384128113
52	NC_017161	ACAG	2	8	22117	22124	50 %	0 %	25 %	25 %	384128113
53	NC_017161	GAGG	2	8	22168	22175	25 %	0 %	75 %	0 %	384128113
54	NC_017161	TGCA	2	8	22312	22319	25 %	25 %	25 %	25 %	384128113
55	NC_017161	AGAT	2	8	22408	22415	50 %	25 %	25 %	0 %	384128113
56	NC_017161	AATG	2	8	23125	23132	50 %	25 %	25 %	0 %	384128114
57	NC_017161	AGGA	2	8	23359	23366	50 %	0 %	50 %	0 %	384128114
58	NC_017161	ATGT	2	8	24137	24144	25 %	50 %	25 %	0 %	384128115
59	NC_017161	CCTC	2	8	26085	26092	0 %	25 %	0 %	75 %	384128115
60	NC_017161	CAAG	2	8	26496	26503	50 %	0 %	25 %	25 %	384128116
61	NC_017161	ATAA	2	8	27278	27285	75 %	25 %	0 %	0 %	384128116
62	NC_017161	GACT	2	8	27421	27428	25 %	25 %	25 %	25 %	384128116
63	NC_017161	TGCC	2	8	27709	27716	0 %	25 %	25 %	50 %	384128117
64	NC_017161	GTAG	2	8	29127	29134	25 %	25 %	50 %	0 %	384128118
65	NC_017161	AAAG	2	8	29230	29237	75 %	0 %	25 %	0 %	384128118
66	NC_017161	GAGG	2	8	29509	29516	25 %	0 %	75 %	0 %	384128118
67	NC_017161	AGGT	2	8	29573	29580	25 %	25 %	50 %	0 %	384128118
68	NC_017161	GAAA	2	8	29858	29865	75 %	0 %	25 %	0 %	384128118
69	NC_017161	AGGA	2	8	30044	30051	50 %	0 %	50 %	0 %	384128118
70	NC_017161	CAGA	2	8	30321	30328	50 %	0 %	25 %	25 %	384128118
71	NC_017161	CATA	2	8	30899	30906	50 %	25 %	0 %	25 %	384128119
72	NC_017161	ACCT	2	8	31728	31735	25 %	25 %	0 %	50 %	384128119
73	NC_017161	TGAG	2	8	31827	31834	25 %	25 %	50 %	0 %	384128120
74	NC_017161	CTTC	2	8	32679	32686	0 %	50 %	0 %	50 %	384128120
75	NC_017161	CCTC	2	8	32710	32717	0 %	25 %	0 %	75 %	384128120
76	NC_017161	CCTC	2	8	33902	33909	0 %	25 %	0 %	75 %	384128122
77	NC_017161	CACC	2	8	34951	34958	25 %	0 %	0 %	75 %	384128123
78	NC_017161	GGTG	2	8	38086	38093	0 %	25 %	75 %	0 %	384128124
79	NC_017161	GACA	2	8	38255	38262	50 %	0 %	25 %	25 %	384128124
80	NC_017161	AGGC	2	8	38675	38682	25 %	0 %	50 %	25 %	384128124
81	NC_017161	AAGG	2	8	39856	39863	50 %	0 %	50 %	0 %	384128126
82	NC_017161	GAAA	2	8	40303	40310	75 %	0 %	25 %	0 %	384128126
83	NC_017161	TACT	2	8	40689	40696	25 %	50 %	0 %	25 %	384128127
84	NC_017161	TTGC	2	8	40873	40880	0 %	50 %	25 %	25 %	384128127
85	NC_017161	TACA	2	8	40943	40950	50 %	25 %	0 %	25 %	384128127
86	NC_017161	AGAT	2	8	41275	41282	50 %	25 %	25 %	0 %	384128127
87	NC_017161	GAAG	2	8	41396	41403	50 %	0 %	50 %	0 %	384128127
88	NC_017161	AGGA	2	8	41894	41901	50 %	0 %	50 %	0 %	384128128
89	NC_017161	AGAC	2	8	42107	42114	50 %	0 %	25 %	25 %	384128128
90	NC_017161	TCTT	2	8	42449	42456	0 %	75 %	0 %	25 %	384128128
91	NC_017161	CTTT	2	8	42477	42484	0 %	75 %	0 %	25 %	384128128
92	NC_017161	TCCT	2	8	43121	43128	0 %	50 %	0 %	50 %	384128129
93	NC_017161	AATC	2	8	43164	43171	50 %	25 %	0 %	25 %	384128129
94	NC_017161	AAGG	2	8	43891	43898	50 %	0 %	50 %	0 %	384128129
95	NC_017161	GTGC	2	8	43984	43991	0 %	25 %	50 %	25 %	384128129
96	NC_017161	ATCT	2	8	44076	44083	25 %	50 %	0 %	25 %	384128129
97	NC_017161	CTTT	2	8	44274	44281	0 %	75 %	0 %	25 %	384128129
98	NC_017161	CTTT	2	8	44345	44352	0 %	75 %	0 %	25 %	384128129
99	NC_017161	CTTT	2	8	45343	45350	0 %	75 %	0 %	25 %	384128131
100	NC_017161	AAGG	2	8	45480	45487	50 %	0 %	50 %	0 %	384128131
101	NC_017161	TCCC	2	8	45636	45643	0 %	25 %	0 %	75 %	384128131
102	NC_017161	ATTT	2	8	45675	45682	25 %	75 %	0 %	0 %	384128131
103	NC_017161	TGCT	2	8	46769	46776	0 %	50 %	25 %	25 %	384128131
104	NC_017161	AAGT	2	8	47518	47525	50 %	25 %	25 %	0 %	384128131
105	NC_017161	CCTG	2	8	47957	47964	0 %	25 %	25 %	50 %	384128132
106	NC_017161	CATC	2	8	48468	48475	25 %	25 %	0 %	50 %	384128132
107	NC_017161	TGCG	2	8	48507	48514	0 %	25 %	50 %	25 %	384128132
108	NC_017161	TTTC	2	8	48936	48943	0 %	75 %	0 %	25 %	384128132
109	NC_017161	CTTC	2	8	48960	48967	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
110	NC_017161	CTTC	2	8	49876	49883	0 %	50 %	0 %	50 %	384128133
111	NC_017161	GAAG	2	8	51174	51181	50 %	0 %	50 %	0 %	384128134
112	NC_017161	TAGT	2	8	51855	51862	25 %	50 %	25 %	0 %	384128134
113	NC_017161	AACT	2	8	52024	52031	50 %	25 %	0 %	25 %	384128134
114	NC_017161	TCTT	2	8	52038	52045	0 %	75 %	0 %	25 %	384128134
115	NC_017161	CCCA	2	8	52391	52398	25 %	0 %	0 %	75 %	384128134
116	NC_017161	CATA	2	8	52811	52818	50 %	25 %	0 %	25 %	384128135
117	NC_017161	ATTA	2	8	54314	54321	50 %	50 %	0 %	0 %	384128136
118	NC_017161	CAGT	2	8	54832	54839	25 %	25 %	25 %	25 %	384128137
119	NC_017161	TAAG	2	8	57916	57923	50 %	25 %	25 %	0 %	384128142
120	NC_017161	GGAA	2	8	58196	58203	50 %	0 %	50 %	0 %	384128142
121	NC_017161	TGCT	2	8	58255	58262	0 %	50 %	25 %	25 %	384128142
122	NC_017161	AGGA	2	8	58587	58594	50 %	0 %	50 %	0 %	384128142
123	NC_017161	AGGA	2	8	58968	58975	50 %	0 %	50 %	0 %	384128142
124	NC_017161	TCAA	2	8	59014	59021	50 %	25 %	0 %	25 %	384128142
125	NC_017161	AGAT	2	8	59041	59048	50 %	25 %	25 %	0 %	384128142
126	NC_017161	ACCT	2	8	59649	59656	25 %	25 %	0 %	50 %	384128143
127	NC_017161	ACTG	2	8	59708	59715	25 %	25 %	25 %	25 %	384128143
128	NC_017161	CAGT	2	8	59716	59723	25 %	25 %	25 %	25 %	384128143
129	NC_017161	TCTT	2	8	59911	59918	0 %	75 %	0 %	25 %	384128143
130	NC_017161	GAAG	2	8	60795	60802	50 %	0 %	50 %	0 %	384128144
131	NC_017161	TCCT	2	8	61819	61826	0 %	50 %	0 %	50 %	384128145
132	NC_017161	CCTC	2	8	62543	62550	0 %	25 %	0 %	75 %	384128145
133	NC_017161	CTGC	2	8	63240	63247	0 %	25 %	25 %	50 %	384128147
134	NC_017161	AACC	2	8	63591	63598	50 %	0 %	0 %	50 %	384128147
135	NC_017161	TGCT	2	8	63717	63724	0 %	50 %	25 %	25 %	384128148
136	NC_017161	ACGC	2	8	63766	63773	25 %	0 %	25 %	50 %	384128148
137	NC_017161	TGCC	2	8	64064	64071	0 %	25 %	25 %	50 %	384128148
138	NC_017161	ACCT	2	8	64371	64378	25 %	25 %	0 %	50 %	384128149
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