MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 5252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	TA	3	6	508	513	50 %	50 %	0 %	0 %	384128092
2	NC_017161	AG	3	6	724	729	50 %	0 %	50 %	0 %	384128092
3	NC_017161	AG	3	6	1141	1146	50 %	0 %	50 %	0 %	384128092
4	NC_017161	AG	4	8	1942	1949	50 %	0 %	50 %	0 %	384128093
5	NC_017161	GA	3	6	2552	2557	50 %	0 %	50 %	0 %	384128094
6	NC_017161	TC	3	6	2621	2626	0 %	50 %	0 %	50 %	384128094
7	NC_017161	CA	3	6	3328	3333	50 %	0 %	0 %	50 %	384128095
8	NC_017161	TA	3	6	3750	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017161	GA	4	8	3853	3860	50 %	0 %	50 %	0 %	384128096
10	NC_017161	AT	3	6	3916	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	384128096
11	NC_017161	TA	3	6	4339	4344	50 %	50 %	0 %	0 %	384128096
12	NC_017161	AT	3	6	4429	4434	50 %	50 %	0 %	0 %	384128096
13	NC_017161	AG	3	6	4498	4503	50 %	0 %	50 %	0 %	384128096
14	NC_017161	TA	3	6	4628	4633	50 %	50 %	0 %	0 %	384128096
15	NC_017161	TA	3	6	4707	4712	50 %	50 %	0 %	0 %	384128097
16	NC_017161	AG	3	6	4813	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	384128097
17	NC_017161	AG	3	6	5505	5510	50 %	0 %	50 %	0 %	384128098
18	NC_017161	AG	4	8	6237	6244	50 %	0 %	50 %	0 %	384128098
19	NC_017161	AG	3	6	6368	6373	50 %	0 %	50 %	0 %	384128098
20	NC_017161	CT	3	6	6652	6657	0 %	50 %	0 %	50 %	384128099
21	NC_017161	AG	3	6	6682	6687	50 %	0 %	50 %	0 %	384128099
22	NC_017161	CA	3	6	6724	6729	50 %	0 %	0 %	50 %	384128099
23	NC_017161	AG	4	8	7561	7568	50 %	0 %	50 %	0 %	384128099
24	NC_017161	GT	3	6	7599	7604	0 %	50 %	50 %	0 %	384128099
25	NC_017161	GT	3	6	7659	7664	0 %	50 %	50 %	0 %	384128099
26	NC_017161	CT	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	384128099
27	NC_017161	TC	3	6	7810	7815	0 %	50 %	0 %	50 %	384128100
28	NC_017161	GT	3	6	7978	7983	0 %	50 %	50 %	0 %	384128100
29	NC_017161	CT	3	6	8217	8222	0 %	50 %	0 %	50 %	384128100
30	NC_017161	TA	3	6	9921	9926	50 %	50 %	0 %	0 %	384128102
31	NC_017161	GA	3	6	10236	10241	50 %	0 %	50 %	0 %	384128103
32	NC_017161	TC	3	6	10284	10289	0 %	50 %	0 %	50 %	384128103
33	NC_017161	CT	3	6	10582	10587	0 %	50 %	0 %	50 %	384128104
34	NC_017161	CT	3	6	10917	10922	0 %	50 %	0 %	50 %	384128104
35	NC_017161	TC	3	6	11043	11048	0 %	50 %	0 %	50 %	384128104
36	NC_017161	CT	3	6	11176	11181	0 %	50 %	0 %	50 %	384128104
37	NC_017161	TA	3	6	11468	11473	50 %	50 %	0 %	0 %	384128104
38	NC_017161	CA	3	6	11481	11486	50 %	0 %	0 %	50 %	384128104
39	NC_017161	TA	3	6	11960	11965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017161	AG	3	6	12007	12012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017161	TA	3	6	12575	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	384128105
42	NC_017161	CT	4	8	12609	12616	0 %	50 %	0 %	50 %	384128105
43	NC_017161	CT	4	8	12633	12640	0 %	50 %	0 %	50 %	384128105
44	NC_017161	TC	3	6	12683	12688	0 %	50 %	0 %	50 %	384128105
45	NC_017161	TA	4	8	12739	12746	50 %	50 %	0 %	0 %	384128105
46	NC_017161	AT	3	6	13180	13185	50 %	50 %	0 %	0 %	384128106
47	NC_017161	CT	3	6	13322	13327	0 %	50 %	0 %	50 %	384128106
48	NC_017161	TC	4	8	13837	13844	0 %	50 %	0 %	50 %	384128106
49	NC_017161	AT	3	6	13893	13898	50 %	50 %	0 %	0 %	384128106
50	NC_017161	TA	3	6	14729	14734	50 %	50 %	0 %	0 %	384128106
51	NC_017161	TC	4	8	14913	14920	0 %	50 %	0 %	50 %	384128106
52	NC_017161	GT	3	6	14956	14961	0 %	50 %	50 %	0 %	384128106
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54	NC_017161	CT	3	6	15959	15964	0 %	50 %	0 %	50 %	384128106
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61	NC_017161	CT	3	6	18527	18532	0 %	50 %	0 %	50 %	384128110
62	NC_017161	GT	3	6	19455	19460	0 %	50 %	50 %	0 %	384128110
63	NC_017161	TA	3	6	20033	20038	50 %	50 %	0 %	0 %	384128110
64	NC_017161	AT	3	6	20205	20210	50 %	50 %	0 %	0 %	384128110
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69	NC_017161	AG	3	6	22092	22097	50 %	0 %	50 %	0 %	384128113
70	NC_017161	GA	4	8	22126	22133	50 %	0 %	50 %	0 %	384128113
71	NC_017161	AG	3	6	22281	22286	50 %	0 %	50 %	0 %	384128113
72	NC_017161	TC	4	8	22460	22467	0 %	50 %	0 %	50 %	384128113
73	NC_017161	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_017161	AG	3	6	33981	33986	50 %	0 %	50 %	0 %	384128122
107	NC_017161	TC	3	6	34116	34121	0 %	50 %	0 %	50 %	384128122
108	NC_017161	AT	4	8	34469	34476	50 %	50 %	0 %	0 %	384128122
109	NC_017161	TG	3	6	34714	34719	0 %	50 %	50 %	0 %	384128122
110	NC_017161	CT	3	6	35509	35514	0 %	50 %	0 %	50 %	384128123
111	NC_017161	CT	3	6	35948	35953	0 %	50 %	0 %	50 %	384128124
112	NC_017161	AG	4	8	36378	36385	50 %	0 %	50 %	0 %	384128124
113	NC_017161	CT	3	6	37024	37029	0 %	50 %	0 %	50 %	384128124
114	NC_017161	AG	3	6	37099	37104	50 %	0 %	50 %	0 %	384128124
115	NC_017161	GA	4	8	37117	37124	50 %	0 %	50 %	0 %	384128124
116	NC_017161	TA	3	6	38446	38451	50 %	50 %	0 %	0 %	384128124
117	NC_017161	CT	3	6	38522	38527	0 %	50 %	0 %	50 %	384128124
118	NC_017161	AG	3	6	38635	38640	50 %	0 %	50 %	0 %	384128124
119	NC_017161	TA	3	6	38948	38953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017161	AG	3	6	39459	39464	50 %	0 %	50 %	0 %	384128125
121	NC_017161	TG	3	6	39560	39565	0 %	50 %	50 %	0 %	384128125
122	NC_017161	AT	3	6	39710	39715	50 %	50 %	0 %	0 %	384128126
123	NC_017161	AC	3	6	40230	40235	50 %	0 %	0 %	50 %	384128126
124	NC_017161	TA	3	6	40790	40795	50 %	50 %	0 %	0 %	384128127
125	NC_017161	CT	3	6	40885	40890	0 %	50 %	0 %	50 %	384128127
126	NC_017161	TA	3	6	41268	41273	50 %	50 %	0 %	0 %	384128127
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129	NC_017161	AT	3	6	42258	42263	50 %	50 %	0 %	0 %	384128128
130	NC_017161	AG	3	6	42504	42509	50 %	0 %	50 %	0 %	384128128
131	NC_017161	AG	3	6	43885	43890	50 %	0 %	50 %	0 %	384128129
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133	NC_017161	AG	3	6	44791	44796	50 %	0 %	50 %	0 %	384128130
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135	NC_017161	CT	3	6	45460	45465	0 %	50 %	0 %	50 %	384128131
136	NC_017161	CT	3	6	45473	45478	0 %	50 %	0 %	50 %	384128131
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139	NC_017161	CT	3	6	46545	46550	0 %	50 %	0 %	50 %	384128131
140	NC_017161	CT	3	6	46878	46883	0 %	50 %	0 %	50 %	384128131
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142	NC_017161	CT	3	6	47159	47164	0 %	50 %	0 %	50 %	384128131
143	NC_017161	GT	3	6	47343	47348	0 %	50 %	50 %	0 %	384128131
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