MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017158	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017158	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017158	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017158	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017158	GCGA	2	8	18463	18470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017158	CGCA	2	8	18496	18503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017158	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017158	TAGG	2	8	26542	26549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017158	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017158	TACT	3	12	32081	32092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017158	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017158	ATAA	3	12	35265	35276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017158	AAAG	2	8	36883	36890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017158	GGTG	2	8	37532	37539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017158	ACCT	2	8	38729	38736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017158	TAAG	2	8	43417	43424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017158	TCGT	2	8	44960	44967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017158	GTTT	2	8	46139	46146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017158	ACCA	2	8	46364	46371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017158	AATG	2	8	47688	47695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017158	TGAA	2	8	47789	47796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017158	TGGT	2	8	47944	47951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017158	TTAT	2	8	49020	49027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017158	TGAG	2	8	50837	50844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017158	AGTA	2	8	51053	51060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017158	CGAG	2	8	56516	56523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017158	TACT	2	8	56540	56547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017158	GAAA	2	8	57038	57045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017158	GAAG	2	8	57064	57071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017158	TCGT	2	8	63534	63541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017158	AGTA	2	8	63576	63583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017158	TAGG	2	8	66070	66077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017158	TGTT	2	8	66138	66145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017158	CCAT	2	8	66231	66238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017158	GAAA	2	8	66470	66477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017158	GAAA	2	8	68323	68330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017158	AGGG	2	8	68340	68347	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017158	TTTA	2	8	72838	72845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017158	CTTG	2	8	72882	72889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017158	AGCC	2	8	74075	74082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017158	GCTG	2	8	74157	74164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017158	AACC	2	8	74193	74200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017158	GTCT	2	8	77732	77739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017158	GATA	2	8	78011	78018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017158	GCAA	2	8	78112	78119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017158	CAGG	2	8	78163	78170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017158	GCTG	2	8	78224	78231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017158	CATA	2	8	81721	81728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017158	AGCG	2	8	82398	82405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017158	CCTG	2	8	84291	84298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017158	TTTG	2	8	87343	87350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017158	AGGC	2	8	87457	87464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017158	AATG	2	8	89066	89073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017158	CCAG	2	8	89793	89800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017158	TCGC	2	8	92331	92338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017158	CTGC	2	8	93043	93050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017158	AAGA	2	8	93926	93933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.