MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017158	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017158	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017158	CTT	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017158	TTC	2	6	13256	13261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017158	ATA	2	6	13303	13308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017158	CAG	2	6	18553	18558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017158	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017158	GGC	2	6	22429	22434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017158	GCC	2	6	22438	22443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017158	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017158	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017158	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017158	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017158	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017158	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017158	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017158	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017158	TGA	2	6	29847	29852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017158	CGT	2	6	29931	29936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017158	ATC	2	6	29942	29947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017158	CTT	2	6	29994	29999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017158	CAG	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017158	GTT	3	9	30022	30030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017158	ATA	2	6	32093	32098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017158	TCA	2	6	33817	33822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017158	GGC	2	6	33863	33868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017158	AGA	2	6	33941	33946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017158	GTC	2	6	34628	34633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017158	CAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017158	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017158	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017158	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017158	GAA	2	6	35174	35179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017158	AGT	2	6	36138	36143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017158	CGA	2	6	36144	36149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017158	TTG	2	6	36339	36344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017158	CCG	2	6	36788	36793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017158	TGG	2	6	36873	36878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017158	TTG	2	6	37426	37431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017158	TGG	2	6	37483	37488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017158	GTT	2	6	37507	37512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017158	CCA	2	6	37576	37581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017158	ATC	2	6	37651	37656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017158	GAA	2	6	37755	37760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017158	TCC	2	6	37891	37896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017158	TTG	2	6	37918	37923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017158	TAA	2	6	37974	37979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017158	TCC	2	6	37983	37988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017158	TTG	2	6	38562	38567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017158	TCT	2	6	42164	42169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017158	GCC	2	6	42286	42291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017158	AAC	2	6	43356	43361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017158	ACA	2	6	43366	43371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017158	AGA	2	6	43378	43383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017158	CAG	2	6	43520	43525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017158	TAT	2	6	43656	43661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017158	TAT	2	6	44795	44800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017158	TCT	2	6	44854	44859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017158	ACT	2	6	44864	44869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017158	GCC	3	9	44994	45002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017158	ATT	2	6	45828	45833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017158	AAT	2	6	45848	45853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017158	AGA	2	6	45876	45881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017158	ATA	2	6	45979	45984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017158	AGG	2	6	46044	46049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017158	CCA	2	6	46147	46152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017158	TGA	2	6	46417	46422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017158	CCA	2	6	46452	46457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017158	AAC	3	9	47639	47647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017158	GTT	2	6	47778	47783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017158	CAC	2	6	47837	47842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017158	CAG	2	6	47971	47976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017158	TCG	2	6	47997	48002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017158	TGG	2	6	48047	48052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017158	ATC	2	6	48567	48572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017158	ATA	2	6	48645	48650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017158	TAA	2	6	48653	48658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017158	AGC	2	6	48759	48764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017158	CGT	2	6	48783	48788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017158	GTC	2	6	48789	48794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017158	CAA	2	6	48802	48807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017158	CAA	2	6	48820	48825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017158	TCA	2	6	48832	48837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017158	TTC	2	6	48906	48911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017158	AAC	2	6	48940	48945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017158	TGA	2	6	48969	48974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017158	TTG	2	6	49006	49011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017158	CTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017158	TTG	2	6	49918	49923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017158	ATA	2	6	49927	49932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017158	AAG	2	6	50911	50916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017158	ACC	2	6	50980	50985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017158	ATA	2	6	51047	51052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017158	CGT	2	6	52246	52251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017158	GAT	2	6	52277	52282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017158	CAG	2	6	52336	52341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017158	CCA	2	6	52363	52368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017158	AGA	2	6	52387	52392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017158	ATG	2	6	52437	52442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017158	CAT	2	6	55283	55288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017158	TGG	2	6	56134	56139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017158	CGT	2	6	56165	56170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017158	GGT	2	6	56235	56240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017158	GAA	2	6	56295	56300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017158	GTC	2	6	56313	56318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017158	ATA	2	6	56528	56533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017158	ATC	2	6	56549	56554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017158	TGA	2	6	57097	57102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017158	GGA	2	6	57208	57213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017158	CAG	2	6	57289	57294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017158	CAC	2	6	57357	57362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017158	TAG	2	6	57465	57470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017158	GCC	2	6	57486	57491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017158	CCG	2	6	58110	58115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017158	TGG	2	6	62187	62192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017158	TTA	2	6	65990	65995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017158	TGA	2	6	66124	66129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017158	TTC	2	6	66194	66199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017158	ATC	2	6	66304	66309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017158	TAC	3	9	66338	66346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017158	TTA	2	6	66554	66559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017158	GCT	2	6	68255	68260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017158	TTG	2	6	68261	68266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017158	GAT	2	6	68277	68282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017158	CTC	2	6	68299	68304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017158	ATT	2	6	68364	68369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017158	TAA	2	6	68374	68379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017158	AAC	2	6	68394	68399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017158	AAT	2	6	68413	68418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017158	AAT	2	6	68434	68439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017158	ATA	2	6	68520	68525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017158	TAT	2	6	68578	68583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017158	TAT	2	6	68618	68623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017158	AGG	2	6	68762	68767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017158	ATA	2	6	68770	68775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017158	CCT	2	6	68778	68783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017158	TAT	2	6	68789	68794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017158	AAT	2	6	69332	69337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017158	CCT	2	6	72708	72713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.