MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124389
2	NC_017158	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124389
3	NC_017158	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124389
4	NC_017158	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124389
5	NC_017158	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124389
6	NC_017158	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124389
7	NC_017158	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124389
8	NC_017158	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124389
9	NC_017158	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124389
10	NC_017158	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124389
11	NC_017158	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124390
12	NC_017158	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124390
13	NC_017158	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124390
14	NC_017158	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124390
15	NC_017158	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124390
16	NC_017158	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124390
17	NC_017158	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124390
18	NC_017158	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124390
19	NC_017158	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124390
20	NC_017158	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124390
21	NC_017158	TCT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124391
22	NC_017158	TCA	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124391
23	NC_017158	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124391
24	NC_017158	TTC	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124391
25	NC_017158	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124391
26	NC_017158	CTT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124391
27	NC_017158	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124391
28	NC_017158	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124391
29	NC_017158	GTC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124391
30	NC_017158	GGT	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124391
31	NC_017158	CAG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124391
32	NC_017158	CAG	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
33	NC_017158	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
34	NC_017158	CTG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
35	NC_017158	TGT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124392
36	NC_017158	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124392
37	NC_017158	ATC	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
38	NC_017158	GCC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124392
39	NC_017158	ATG	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124392
40	NC_017158	GGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124392
41	NC_017158	ACT	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
42	NC_017158	AAC	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124392
43	NC_017158	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124392
44	NC_017158	CTG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
45	NC_017158	ACC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124392
46	NC_017158	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124392
47	NC_017158	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124392
48	NC_017158	GCT	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
49	NC_017158	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
50	NC_017158	CAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124392
51	NC_017158	CAG	3	9	4428	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
52	NC_017158	ACT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
53	NC_017158	AAC	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124392
54	NC_017158	CTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
55	NC_017158	GTT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124392
56	NC_017158	TGC	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
57	NC_017158	CCG	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124392
58	NC_017158	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
59	NC_017158	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
60	NC_017158	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
61	NC_017158	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124392
62	NC_017158	AGC	4	12	5002	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
63	NC_017158	GAA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124392
64	NC_017158	GCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
65	NC_017158	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124392
66	NC_017158	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124392
67	NC_017158	TGA	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124392
68	NC_017158	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124392
69	NC_017158	CCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124393
70	NC_017158	AAC	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124393
71	NC_017158	TTA	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124393
72	NC_017158	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124393
73	NC_017158	GCT	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124393
74	NC_017158	ACC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124393
75	NC_017158	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124393
76	NC_017158	ATA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124393
77	NC_017158	TAA	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124394
78	NC_017158	CTG	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
79	NC_017158	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124394
80	NC_017158	TAG	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124394
81	NC_017158	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
82	NC_017158	GCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
83	NC_017158	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124394
84	NC_017158	CGC	2	6	7261	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124394
85	NC_017158	GCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
86	NC_017158	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
87	NC_017158	TGC	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
88	NC_017158	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
89	NC_017158	TCT	2	6	7632	7637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
90	NC_017158	CGG	2	6	7642	7647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124394
91	NC_017158	GTG	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124394
92	NC_017158	TCG	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
93	NC_017158	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
94	NC_017158	TCG	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
95	NC_017158	TCT	2	6	8020	8025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
96	NC_017158	ATT	2	6	8045	8050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124394
97	NC_017158	CGG	2	6	8185	8190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124394
98	NC_017158	GGA	2	6	8207	8212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124394
99	NC_017158	TTG	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124394
100	NC_017158	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
101	NC_017158	TCC	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124394
102	NC_017158	AGC	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
103	NC_017158	CGG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124394
104	NC_017158	GTG	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124394
105	NC_017158	GGC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124394
106	NC_017158	GGC	2	6	8940	8945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124394
107	NC_017158	TGA	2	6	8977	8982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124394
108	NC_017158	GTT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124394
109	NC_017158	ACG	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
110	NC_017158	TGT	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124394
111	NC_017158	ATT	2	6	9317	9322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124394
112	NC_017158	TCA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124394
113	NC_017158	CAG	2	6	9743	9748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
114	NC_017158	ACG	2	6	9824	9829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
115	NC_017158	CCT	2	6	9835	9840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124394
116	NC_017158	TTG	3	9	9882	9890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124394
117	NC_017158	CAT	2	6	9977	9982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124394
118	NC_017158	CCA	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124394
119	NC_017158	AGA	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124394
120	NC_017158	TTC	2	6	10154	10159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
121	NC_017158	ACA	2	6	10285	10290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124394
122	NC_017158	CGA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
123	NC_017158	GCA	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124394
124	NC_017158	GTA	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124394
125	NC_017158	CGT	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
126	NC_017158	ATC	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124394
127	NC_017158	CCA	2	6	10999	11004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124394
128	NC_017158	TCG	2	6	11070	11075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124394
129	NC_017158	TCT	3	9	11146	11154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124394
130	NC_017158	GAA	2	6	11211	11216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124395
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133	NC_017158	CCG	2	6	11484	11489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124395
134	NC_017158	TGT	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124395
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250	NC_017158	CAG	2	6	21185	21190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124405
251	NC_017158	AGT	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124405
252	NC_017158	TCG	2	6	21378	21383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124405
253	NC_017158	TGG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124405
254	NC_017158	CGA	2	6	21856	21861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124405
255	NC_017158	TTC	2	6	22102	22107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124406
256	NC_017158	GCC	2	6	22178	22183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124406
257	NC_017158	GTC	2	6	22195	22200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124406
258	NC_017158	GCT	2	6	22219	22224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124406
259	NC_017158	GCT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124406
260	NC_017158	TTC	3	9	22410	22418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124406
261	NC_017158	TGC	2	6	22466	22471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124407
262	NC_017158	GAT	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124407
263	NC_017158	CTG	2	6	23000	23005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124407
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265	NC_017158	CAA	2	6	23307	23312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124408
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267	NC_017158	GGC	2	6	23454	23459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124408
268	NC_017158	CAT	2	6	23470	23475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124408
269	NC_017158	GCA	2	6	23505	23510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124408
270	NC_017158	CAT	2	6	23542	23547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124408
271	NC_017158	TCG	2	6	23588	23593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124408
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273	NC_017158	TCG	2	6	23639	23644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124408
274	NC_017158	TGG	3	9	23682	23690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124408
275	NC_017158	GCG	2	6	23710	23715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124408
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277	NC_017158	GTT	2	6	24025	24030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124408
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280	NC_017158	ATC	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124409
281	NC_017158	CAC	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124409
282	NC_017158	CAG	2	6	24684	24689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124409
283	NC_017158	TCG	3	9	24757	24765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124409
284	NC_017158	CAG	2	6	24833	24838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124409
285	NC_017158	CCA	2	6	24847	24852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124409
286	NC_017158	ACG	2	6	24894	24899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124409
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288	NC_017158	TGA	2	6	25160	25165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124410
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327	NC_017158	CTT	2	6	27652	27657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124411
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330	NC_017158	TCA	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
331	NC_017158	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
332	NC_017158	TCA	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
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353	NC_017158	ATA	2	6	29657	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124414
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357	NC_017158	CCA	2	6	30163	30168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124415
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361	NC_017158	TTG	2	6	30441	30446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124415
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369	NC_017158	CTG	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
370	NC_017158	CGT	2	6	31071	31076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
371	NC_017158	CTT	3	9	31122	31130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
372	NC_017158	GTC	2	6	31138	31143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
373	NC_017158	GCC	2	6	31184	31189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124416
374	NC_017158	CGA	2	6	31193	31198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124416
375	NC_017158	ATG	2	6	31211	31216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124416
376	NC_017158	CGT	2	6	31218	31223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
377	NC_017158	GGC	2	6	31267	31272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124416
378	NC_017158	CTG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
379	NC_017158	GTA	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
380	NC_017158	TGA	2	6	31463	31468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
381	NC_017158	GCC	2	6	31651	31656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124417
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387	NC_017158	GAT	3	9	32472	32480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
388	NC_017158	GCT	2	6	32530	32535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124418
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390	NC_017158	ACC	2	6	32783	32788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124418
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396	NC_017158	TTA	2	6	33548	33553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124418
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405	NC_017158	TAC	2	6	35545	35550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124420
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498	NC_017158	ATC	2	6	48321	48326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124430
499	NC_017158	CGC	2	6	48347	48352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124430
500	NC_017158	ATC	2	6	48361	48366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124430

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