MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017158	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017158	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017158	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017158	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017158	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017158	TA	3	6	32073	32078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017158	CG	3	6	34513	34518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017158	TC	3	6	34560	34565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017158	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017158	GC	3	6	36192	36197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017158	TG	3	6	36424	36429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017158	CT	3	6	36839	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017158	TC	4	8	44880	44887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017158	AG	3	6	45863	45868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017158	AG	3	6	45972	45977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017158	CT	3	6	46008	46013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017158	AT	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017158	CA	3	6	46151	46156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017158	AG	3	6	46334	46339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017158	AG	3	6	46376	46381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017158	AG	3	6	47564	47569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017158	CT	3	6	47807	47812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017158	CG	4	8	47914	47921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017158	TA	3	6	48698	48703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017158	TA	3	6	51063	51068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017158	CA	3	6	56186	56191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017158	AG	3	6	62250	62255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017158	TA	3	6	63553	63558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017158	AT	3	6	63560	63565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017158	TG	3	6	66014	66019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017158	CT	3	6	68595	68600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017158	AG	3	6	69359	69364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017158	CA	3	6	72852	72857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017158	GT	3	6	75821	75826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017158	CG	3	6	77100	77105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017158	TC	3	6	77163	77168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017158	TA	3	6	81785	81790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017158	GT	3	6	85036	85041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017158	TA	3	6	89088	89093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017158	GC	3	6	89514	89519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017158	TG	3	6	90653	90658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017158	CG	3	6	93020	93025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017158	CG	3	6	93456	93461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017158	TG	3	6	96027	96032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.