MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	384124389
2	NC_017158	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	384124389
3	NC_017158	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	384124389
4	NC_017158	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	384124391
5	NC_017158	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	384124391
6	NC_017158	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	384124392
7	NC_017158	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	384124392
8	NC_017158	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	384124392
9	NC_017158	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	384124392
10	NC_017158	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	384124392
11	NC_017158	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	384124392
12	NC_017158	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	384124393
13	NC_017158	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	384124394
14	NC_017158	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	384124394
15	NC_017158	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	384124394
16	NC_017158	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	384124394
17	NC_017158	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	384124394
18	NC_017158	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	384124394
19	NC_017158	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	384124394
20	NC_017158	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	384124396
21	NC_017158	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	384124397
22	NC_017158	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	384124398
23	NC_017158	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	384124399
24	NC_017158	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	384124399
25	NC_017158	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	384124399
26	NC_017158	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	384124399
27	NC_017158	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	384124401
28	NC_017158	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	384124401
29	NC_017158	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	384124403
30	NC_017158	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124408
31	NC_017158	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	384124410
32	NC_017158	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	384124410
33	NC_017158	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	384124410
34	NC_017158	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	384124410
35	NC_017158	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	384124411
36	NC_017158	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	384124411
37	NC_017158	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	384124411
38	NC_017158	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	384124411
39	NC_017158	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	384124412
40	NC_017158	CG	3	6	32623	32628	0 %	0 %	50 %	50 %	384124418
41	NC_017158	AG	3	6	33688	33693	50 %	0 %	50 %	0 %	384124418
42	NC_017158	GA	3	6	34242	34247	50 %	0 %	50 %	0 %	384124419
43	NC_017158	CA	3	6	38365	38370	50 %	0 %	0 %	50 %	384124422
44	NC_017158	AG	3	6	40300	40305	50 %	0 %	50 %	0 %	384124425
45	NC_017158	TG	3	6	40520	40525	0 %	50 %	50 %	0 %	384124425
46	NC_017158	GT	3	6	41618	41623	0 %	50 %	50 %	0 %	384124425
47	NC_017158	AG	3	6	42963	42968	50 %	0 %	50 %	0 %	384124426
48	NC_017158	AC	3	6	43915	43920	50 %	0 %	0 %	50 %	384124427
49	NC_017158	TG	3	6	48445	48450	0 %	50 %	50 %	0 %	384124430
50	NC_017158	GT	3	6	49206	49211	0 %	50 %	50 %	0 %	384124431
51	NC_017158	CG	4	8	51621	51628	0 %	0 %	50 %	50 %	384124434
52	NC_017158	AG	3	6	51733	51738	50 %	0 %	50 %	0 %	384124434
53	NC_017158	CG	3	6	52867	52872	0 %	0 %	50 %	50 %	384124435
54	NC_017158	GA	3	6	53040	53045	50 %	0 %	50 %	0 %	384124435
55	NC_017158	GT	4	8	53658	53665	0 %	50 %	50 %	0 %	384124436
56	NC_017158	TC	4	8	54615	54622	0 %	50 %	0 %	50 %	384124437
57	NC_017158	CG	3	6	54844	54849	0 %	0 %	50 %	50 %	384124437
58	NC_017158	TC	3	6	54958	54963	0 %	50 %	0 %	50 %	384124437
59	NC_017158	GA	3	6	56653	56658	50 %	0 %	50 %	0 %	384124439
60	NC_017158	TA	3	6	57019	57024	50 %	50 %	0 %	0 %	384124439
61	NC_017158	CT	3	6	57565	57570	0 %	50 %	0 %	50 %	384124440
62	NC_017158	CA	3	6	57973	57978	50 %	0 %	0 %	50 %	384124440
63	NC_017158	CG	3	6	59821	59826	0 %	0 %	50 %	50 %	384124442
64	NC_017158	CT	3	6	60335	60340	0 %	50 %	0 %	50 %	384124442
65	NC_017158	GT	3	6	61110	61115	0 %	50 %	50 %	0 %	384124442
66	NC_017158	TC	3	6	61846	61851	0 %	50 %	0 %	50 %	384124442
67	NC_017158	TC	3	6	62015	62020	0 %	50 %	0 %	50 %	384124442
68	NC_017158	AC	3	6	62754	62759	50 %	0 %	0 %	50 %	384124443
69	NC_017158	GT	3	6	63102	63107	0 %	50 %	50 %	0 %	384124443
70	NC_017158	GA	3	6	63312	63317	50 %	0 %	50 %	0 %	384124443
71	NC_017158	TG	3	6	65582	65587	0 %	50 %	50 %	0 %	384124444
72	NC_017158	CT	3	6	65688	65693	0 %	50 %	0 %	50 %	384124444
73	NC_017158	TC	3	6	66690	66695	0 %	50 %	0 %	50 %	384124445
74	NC_017158	CG	3	6	67604	67609	0 %	0 %	50 %	50 %	384124446
75	NC_017158	GA	3	6	68956	68961	50 %	0 %	50 %	0 %	384124447
76	NC_017158	AT	3	6	69315	69320	50 %	50 %	0 %	0 %	384124447
77	NC_017158	TC	3	6	69494	69499	0 %	50 %	0 %	50 %	384124448
78	NC_017158	TC	3	6	69783	69788	0 %	50 %	0 %	50 %	384124448
79	NC_017158	AC	3	6	70128	70133	50 %	0 %	0 %	50 %	384124448
80	NC_017158	GT	3	6	70899	70904	0 %	50 %	50 %	0 %	384124448
81	NC_017158	CT	3	6	71786	71791	0 %	50 %	0 %	50 %	384124448
82	NC_017158	CA	3	6	71871	71876	50 %	0 %	0 %	50 %	384124448
83	NC_017158	AT	3	6	72303	72308	50 %	50 %	0 %	0 %	384124449
84	NC_017158	CT	3	6	72353	72358	0 %	50 %	0 %	50 %	384124449
85	NC_017158	AT	3	6	73062	73067	50 %	50 %	0 %	0 %	384124450
86	NC_017158	AT	3	6	73185	73190	50 %	50 %	0 %	0 %	384124450
87	NC_017158	AG	3	6	73428	73433	50 %	0 %	50 %	0 %	384124450
88	NC_017158	CA	3	6	74580	74585	50 %	0 %	0 %	50 %	384124451
89	NC_017158	TC	3	6	78568	78573	0 %	50 %	0 %	50 %	384124454
90	NC_017158	TG	3	6	80253	80258	0 %	50 %	50 %	0 %	384124455
91	NC_017158	TA	3	6	80748	80753	50 %	50 %	0 %	0 %	384124455
92	NC_017158	GA	3	6	81301	81306	50 %	0 %	50 %	0 %	384124456
93	NC_017158	AG	3	6	82746	82751	50 %	0 %	50 %	0 %	384124457
94	NC_017158	AT	3	6	85071	85076	50 %	50 %	0 %	0 %	384124460
95	NC_017158	AT	4	8	85379	85386	50 %	50 %	0 %	0 %	384124460
96	NC_017158	AT	3	6	86287	86292	50 %	50 %	0 %	0 %	384124461
97	NC_017158	CG	3	6	86516	86521	0 %	0 %	50 %	50 %	384124462
98	NC_017158	TC	4	8	86820	86827	0 %	50 %	0 %	50 %	384124462
99	NC_017158	GA	3	6	87120	87125	50 %	0 %	50 %	0 %	384124462
100	NC_017158	CA	3	6	87862	87867	50 %	0 %	0 %	50 %	384124463
101	NC_017158	CA	3	6	90397	90402	50 %	0 %	0 %	50 %	384124464
102	NC_017158	GC	3	6	90544	90549	0 %	0 %	50 %	50 %	384124464
103	NC_017158	GC	3	6	91342	91347	0 %	0 %	50 %	50 %	384124466
104	NC_017158	GC	3	6	91714	91719	0 %	0 %	50 %	50 %	384124466
105	NC_017158	CG	3	6	91742	91747	0 %	0 %	50 %	50 %	384124466
106	NC_017158	GC	3	6	94401	94406	0 %	0 %	50 %	50 %	384124468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.