MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	384124389
2	NC_017158	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	384124390
3	NC_017158	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017158	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	384124393
5	NC_017158	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	384124393
6	NC_017158	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	384124394
7	NC_017158	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	384124395
8	NC_017158	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	384124401
9	NC_017158	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	384124407
10	NC_017158	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	384124410
11	NC_017158	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	384124410
12	NC_017158	T	6	6	31303	31308	0 %	100 %	0 %	0 %	384124416
13	NC_017158	A	6	6	31926	31931	100 %	0 %	0 %	0 %	384124417
14	NC_017158	A	6	6	32773	32778	100 %	0 %	0 %	0 %	384124418
15	NC_017158	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017158	T	7	7	35182	35188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017158	A	6	6	35199	35204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017158	A	6	6	35335	35340	100 %	0 %	0 %	0 %	384124420
19	NC_017158	A	6	6	35779	35784	100 %	0 %	0 %	0 %	384124420
20	NC_017158	T	6	6	36030	36035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017158	T	6	6	36302	36307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017158	T	6	6	36350	36355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017158	A	6	6	36455	36460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017158	A	6	6	37951	37956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017158	A	6	6	38685	38690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017158	T	6	6	39319	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	384124423
27	NC_017158	T	7	7	41752	41758	0 %	100 %	0 %	0 %	384124425
28	NC_017158	T	7	7	43671	43677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017158	G	7	7	43835	43841	0 %	0 %	100 %	0 %	384124427
30	NC_017158	A	6	6	43886	43891	100 %	0 %	0 %	0 %	384124427
31	NC_017158	A	6	6	44609	44614	100 %	0 %	0 %	0 %	384124427
32	NC_017158	T	6	6	48132	48137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017158	T	6	6	49465	49470	0 %	100 %	0 %	0 %	384124431
34	NC_017158	T	6	6	49475	49480	0 %	100 %	0 %	0 %	384124432
35	NC_017158	A	6	6	49940	49945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017158	A	6	6	55223	55228	100 %	0 %	0 %	0 %	384124437
37	NC_017158	C	6	6	55820	55825	0 %	0 %	0 %	100 %	384124438
38	NC_017158	T	6	6	56971	56976	0 %	100 %	0 %	0 %	384124439
39	NC_017158	A	6	6	57459	57464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017158	A	6	6	58103	58108	100 %	0 %	0 %	0 %	384124440
41	NC_017158	T	7	7	63840	63846	0 %	100 %	0 %	0 %	384124444
42	NC_017158	A	6	6	66859	66864	100 %	0 %	0 %	0 %	384124445
43	NC_017158	A	7	7	68229	68235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017158	A	6	6	68378	68383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017158	A	7	7	68503	68509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017158	T	7	7	69307	69313	0 %	100 %	0 %	0 %	384124447
47	NC_017158	T	6	6	69450	69455	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
48	NC_017158	T	6	6	69523	69528	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
49	NC_017158	T	6	6	69909	69914	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
50	NC_017158	T	6	6	70257	70262	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
51	NC_017158	A	7	7	70324	70330	100 %	0 %	0 %	0 %	384124448
52	NC_017158	T	6	6	70382	70387	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
53	NC_017158	T	8	8	70633	70640	0 %	100 %	0 %	0 %	384124448
54	NC_017158	C	6	6	70850	70855	0 %	0 %	0 %	100 %	384124448
55	NC_017158	C	6	6	70972	70977	0 %	0 %	0 %	100 %	384124448
56	NC_017158	C	6	6	72136	72141	0 %	0 %	0 %	100 %	384124449
57	NC_017158	T	6	6	73268	73273	0 %	100 %	0 %	0 %	384124450
58	NC_017158	T	6	6	73671	73676	0 %	100 %	0 %	0 %	384124450
59	NC_017158	A	6	6	74037	74042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017158	A	6	6	74934	74939	100 %	0 %	0 %	0 %	384124451
61	NC_017158	A	7	7	75399	75405	100 %	0 %	0 %	0 %	384124451
62	NC_017158	T	6	6	75527	75532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017158	T	7	7	75603	75609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017158	A	7	7	75628	75634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017158	A	6	6	75704	75709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017158	A	6	6	75859	75864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017158	T	9	9	79716	79724	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
68	NC_017158	T	6	6	79774	79779	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
69	NC_017158	T	6	6	79875	79880	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
70	NC_017158	T	7	7	80073	80079	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
71	NC_017158	T	6	6	80375	80380	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
72	NC_017158	T	7	7	80537	80543	0 %	100 %	0 %	0 %	384124455
73	NC_017158	G	6	6	80729	80734	0 %	0 %	100 %	0 %	384124455
74	NC_017158	A	8	8	81429	81436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017158	A	6	6	81652	81657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017158	T	6	6	81673	81678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017158	A	6	6	81865	81870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017158	T	7	7	81887	81893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017158	T	6	6	83989	83994	0 %	100 %	0 %	0 %	384124459
80	NC_017158	T	6	6	84050	84055	0 %	100 %	0 %	0 %	384124459
81	NC_017158	T	8	8	84769	84776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017158	T	6	6	85030	85035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017158	T	6	6	87305	87310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017158	A	6	6	90104	90109	100 %	0 %	0 %	0 %	384124464
85	NC_017158	A	6	6	91238	91243	100 %	0 %	0 %	0 %	384124465
86	NC_017158	T	6	6	92472	92477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017158	A	6	6	94033	94038	100 %	0 %	0 %	0 %	384124468
88	NC_017158	A	7	7	94048	94054	100 %	0 %	0 %	0 %	384124468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.