MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017157	GGACC	2	10	7059	7068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017157	TGTAG	2	10	7102	7111	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017157	ATTAA	2	10	8295	8304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017157	AACAT	2	10	10417	10426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017157	TTTTA	2	10	18475	18484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017157	TAAAA	2	10	18614	18623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017157	TTCAC	2	10	32289	32298	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017157	TAAAT	2	10	34812	34821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017157	CTATA	2	10	47920	47929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017157	CGGGG	2	10	55098	55107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017157	AAAAG	2	10	55341	55350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017157	TCGCC	2	10	56650	56659	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017157	ATTAA	2	10	58656	58665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017157	AATCG	2	10	61439	61448	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017157	CCTCA	2	10	61521	61530	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017157	CTGTA	2	10	61716	61725	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017157	ACCTT	2	10	69225	69234	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.