MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CAGCC	2	10	4584	4593	20 %	0 %	20 %	60 %	384124325
2	NC_017157	TTTGG	2	10	6060	6069	0 %	60 %	40 %	0 %	384124326
3	NC_017157	GCTTG	2	10	12987	12996	0 %	40 %	40 %	20 %	384124334
4	NC_017157	GATGC	2	10	20313	20322	20 %	20 %	40 %	20 %	384124340
5	NC_017157	GCCGC	2	10	20556	20565	0 %	0 %	40 %	60 %	384124340
6	NC_017157	CCATC	2	10	24436	24445	20 %	20 %	0 %	60 %	384124344
7	NC_017157	GCATC	2	10	24709	24718	20 %	20 %	20 %	40 %	384124344
8	NC_017157	TTGTT	2	10	32598	32607	0 %	80 %	20 %	0 %	384124354
9	NC_017157	GCAGA	2	10	33498	33507	40 %	0 %	40 %	20 %	384124355
10	NC_017157	TTTCT	2	10	34983	34992	0 %	80 %	0 %	20 %	384124356
11	NC_017157	CCAAG	2	10	36251	36260	40 %	0 %	20 %	40 %	384124357
12	NC_017157	TTTGG	2	10	37386	37395	0 %	60 %	40 %	0 %	384124359
13	NC_017157	CGTCT	2	10	37442	37451	0 %	40 %	20 %	40 %	384124359
14	NC_017157	CTGAA	2	10	38285	38294	40 %	20 %	20 %	20 %	384124359
15	NC_017157	GTACG	2	10	38603	38612	20 %	20 %	40 %	20 %	384124359
16	NC_017157	CATTC	2	10	39554	39563	20 %	40 %	0 %	40 %	384124361
17	NC_017157	AAAGT	2	10	39763	39772	60 %	20 %	20 %	0 %	384124361
18	NC_017157	ATTGC	2	10	40732	40741	20 %	40 %	20 %	20 %	384124362
19	NC_017157	GAATG	2	10	40973	40982	40 %	20 %	40 %	0 %	384124362
20	NC_017157	TGGAT	2	10	51928	51937	20 %	40 %	40 %	0 %	384124373
21	NC_017157	GCCAT	2	10	52438	52447	20 %	20 %	20 %	40 %	384124373
22	NC_017157	TGGCT	2	10	52701	52710	0 %	40 %	40 %	20 %	384124373
23	NC_017157	AGCGC	2	10	56142	56151	20 %	0 %	40 %	40 %	384124375
24	NC_017157	GCTAA	2	10	65086	65095	40 %	20 %	20 %	20 %	384124382

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.