MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CTGG	2	8	109	116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017157	GTTC	2	8	148	155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017157	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017157	AGCC	2	8	3031	3038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017157	GGAT	2	8	3544	3551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017157	AGAT	2	8	3606	3613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017157	TAAA	2	8	4187	4194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017157	CTTT	2	8	6603	6610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017157	TCAG	2	8	6715	6722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017157	CCCT	2	8	7407	7414	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017157	CGAC	2	8	9319	9326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017157	ATAA	2	8	14601	14608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017157	TTAT	2	8	14769	14776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017157	AATG	2	8	15550	15557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017157	ATTT	2	8	15617	15624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017157	TTAT	2	8	17041	17048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017157	ATAA	2	8	17096	17103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017157	TTAA	2	8	18631	18638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017157	ATCG	2	8	26258	26265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017157	GTAG	2	8	27596	27603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017157	TGTT	2	8	34716	34723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017157	GAAA	2	8	34761	34768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017157	AGGG	2	8	34944	34951	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017157	CGCA	2	8	35401	35408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017157	TTAT	2	8	36643	36650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017157	TTCT	2	8	39316	39323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017157	ACTA	2	8	40261	40268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017157	AAAT	2	8	40385	40392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017157	CAAA	2	8	40479	40486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017157	ATAA	2	8	44002	44009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017157	TGTC	2	8	45023	45030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017157	TGGA	2	8	45944	45951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017157	TACA	2	8	45989	45996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017157	GACG	2	8	46125	46132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017157	TTAT	2	8	46148	46155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017157	TTTA	2	8	46457	46464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017157	AATA	2	8	46473	46480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017157	TTAA	2	8	47904	47911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017157	GCTG	2	8	48217	48224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017157	CGGA	2	8	48383	48390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017157	GGGA	2	8	49012	49019	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017157	CTTT	2	8	49341	49348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017157	CAGG	2	8	49484	49491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017157	AGAA	2	8	49526	49533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017157	CCCT	2	8	54032	54039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017157	GGGC	2	8	55277	55284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017157	TTAT	3	12	55323	55334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017157	GCCA	2	8	56748	56755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017157	CACT	2	8	56784	56791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017157	TCTG	2	8	56881	56888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017157	TGAA	2	8	56941	56948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017157	CAGT	2	8	57234	57241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017157	ATCC	2	8	57461	57468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017157	GCAG	2	8	59551	59558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017157	CCTC	2	8	61662	61669	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_017157	CCTG	2	8	64536	64543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017157	ATAA	2	8	65730	65737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017157	ACAA	2	8	66196	66203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017157	GGGA	2	8	67413	67420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017157	GCCA	2	8	68827	68834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017157	GCGG	2	8	69250	69257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017157	CGCC	2	8	69645	69652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.