MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017157	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017157	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124321
4	NC_017157	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
5	NC_017157	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
6	NC_017157	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
7	NC_017157	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124321
8	NC_017157	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
9	NC_017157	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017157	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017157	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124322
12	NC_017157	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124322
13	NC_017157	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124322
14	NC_017157	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124322
15	NC_017157	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124322
16	NC_017157	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124322
17	NC_017157	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017157	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017157	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017157	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017157	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017157	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017157	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124323
24	NC_017157	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
25	NC_017157	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
26	NC_017157	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124323
27	NC_017157	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
28	NC_017157	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
29	NC_017157	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
30	NC_017157	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124323
31	NC_017157	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
32	NC_017157	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124324
33	NC_017157	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
34	NC_017157	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017157	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017157	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017157	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017157	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017157	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017157	CAT	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017157	TGA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017157	CCG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017157	GTT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017157	ATT	2	6	3747	3752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017157	AAG	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017157	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017157	TTC	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
48	NC_017157	TTC	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
49	NC_017157	GTA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124325
50	NC_017157	ATT	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124325
51	NC_017157	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
52	NC_017157	TCG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
53	NC_017157	TCA	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
54	NC_017157	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
55	NC_017157	ACG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124325
56	NC_017157	TAA	2	6	4938	4943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
57	NC_017157	TGC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
58	NC_017157	CCG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124325
59	NC_017157	CAT	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
60	NC_017157	TCA	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
61	NC_017157	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
62	NC_017157	AAC	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
63	NC_017157	CCG	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124326
64	NC_017157	CAG	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
65	NC_017157	CAT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
66	NC_017157	AGC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
67	NC_017157	TAA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
68	NC_017157	AAG	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124326
69	NC_017157	AGC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
70	NC_017157	ATC	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
71	NC_017157	ATA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
72	NC_017157	CAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
73	NC_017157	TCT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124326
74	NC_017157	CAC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124326
75	NC_017157	AAC	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
76	NC_017157	CAG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
77	NC_017157	AGC	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
78	NC_017157	TAT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124326
79	NC_017157	AAC	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017157	CGC	2	6	6466	6471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017157	GAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017157	CTG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017157	TCG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017157	CAG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017157	CAC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017157	CGC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017157	CAT	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017157	TTA	2	6	7069	7074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017157	CCA	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017157	TGT	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017157	ATG	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017157	AGC	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017157	TCC	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017157	CAG	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017157	CCA	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124327
96	NC_017157	CAC	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124327
97	NC_017157	CAG	2	6	7782	7787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124327
98	NC_017157	CTG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124327
99	NC_017157	GCT	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124327
100	NC_017157	GGC	2	6	7910	7915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124327
101	NC_017157	TCA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124328
102	NC_017157	CTT	3	9	8108	8116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124328
103	NC_017157	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124329
104	NC_017157	GAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124329
105	NC_017157	GCC	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124329
106	NC_017157	GTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124329
107	NC_017157	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124329
108	NC_017157	GCC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124329
109	NC_017157	GCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124329
110	NC_017157	TCT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124329
111	NC_017157	CAC	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017157	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017157	TGA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017157	ATC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017157	GTT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017157	GCG	2	6	9398	9403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017157	AGG	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017157	GAT	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017157	ATA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
120	NC_017157	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124330
121	NC_017157	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124330
122	NC_017157	ATA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
123	NC_017157	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124330
124	NC_017157	TCA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124330
125	NC_017157	ATT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124330
126	NC_017157	ATA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
127	NC_017157	AGT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124330
128	NC_017157	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124330
129	NC_017157	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
130	NC_017157	TAC	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017157	TAA	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017157	TCC	2	6	10295	10300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017157	ATT	2	6	10309	10314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017157	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017157	TAT	2	6	10381	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017157	TAA	2	6	10453	10458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017157	ACA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017157	AAT	2	6	10622	10627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017157	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124331
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250	NC_017157	TCA	2	6	18649	18654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_017157	ACC	2	6	19176	19181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124339
261	NC_017157	ATC	2	6	19191	19196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124339
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