MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124321
2	NC_017157	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
3	NC_017157	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
4	NC_017157	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
5	NC_017157	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124321
6	NC_017157	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
7	NC_017157	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124322
8	NC_017157	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124322
9	NC_017157	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124322
10	NC_017157	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124322
11	NC_017157	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124322
12	NC_017157	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124322
13	NC_017157	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124323
14	NC_017157	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
15	NC_017157	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
16	NC_017157	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124323
17	NC_017157	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
18	NC_017157	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
19	NC_017157	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
20	NC_017157	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124323
21	NC_017157	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
22	NC_017157	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124324
23	NC_017157	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
24	NC_017157	TTC	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
25	NC_017157	TTC	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
26	NC_017157	GTA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124325
27	NC_017157	ATT	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124325
28	NC_017157	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
29	NC_017157	TCG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
30	NC_017157	TCA	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
31	NC_017157	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
32	NC_017157	ACG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124325
33	NC_017157	TAA	2	6	4938	4943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
34	NC_017157	TGC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
35	NC_017157	CCG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124325
36	NC_017157	CAT	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
37	NC_017157	TCA	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
38	NC_017157	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
39	NC_017157	AAC	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
40	NC_017157	CCG	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124326
41	NC_017157	CAG	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
42	NC_017157	CAT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
43	NC_017157	AGC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
44	NC_017157	TAA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
45	NC_017157	AAG	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124326
46	NC_017157	AGC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
47	NC_017157	ATC	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
48	NC_017157	ATA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
49	NC_017157	CAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
50	NC_017157	TCT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124326
51	NC_017157	CAC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124326
52	NC_017157	AAC	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
53	NC_017157	CAG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
54	NC_017157	AGC	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
55	NC_017157	TAT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124326
56	NC_017157	CCA	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124327
57	NC_017157	CAC	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124327
58	NC_017157	CAG	2	6	7782	7787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124327
59	NC_017157	CTG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124327
60	NC_017157	GCT	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124327
61	NC_017157	GGC	2	6	7910	7915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124327
62	NC_017157	TCA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124328
63	NC_017157	CTT	3	9	8108	8116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124328
64	NC_017157	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124329
65	NC_017157	GAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124329
66	NC_017157	GCC	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124329
67	NC_017157	GTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124329
68	NC_017157	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124329
69	NC_017157	GCC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124329
70	NC_017157	GCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124329
71	NC_017157	TCT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124329
72	NC_017157	ATA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
73	NC_017157	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124330
74	NC_017157	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124330
75	NC_017157	ATA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
76	NC_017157	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124330
77	NC_017157	TCA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124330
78	NC_017157	ATT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124330
79	NC_017157	ATA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
80	NC_017157	AGT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124330
81	NC_017157	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124330
82	NC_017157	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124330
83	NC_017157	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124331
84	NC_017157	CCA	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124331
85	NC_017157	GCA	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124331
86	NC_017157	TTC	2	6	11022	11027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124331
87	NC_017157	ATA	2	6	11033	11038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124331
88	NC_017157	CGA	2	6	11540	11545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124332
89	NC_017157	ACC	2	6	11673	11678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124332
90	NC_017157	TCG	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124332
91	NC_017157	GCT	2	6	11915	11920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124332
92	NC_017157	CAT	2	6	12086	12091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124332
93	NC_017157	AGA	2	6	12182	12187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124332
94	NC_017157	GGC	2	6	12188	12193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124332
95	NC_017157	GAC	2	6	12228	12233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124332
96	NC_017157	TTC	2	6	12288	12293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124332
97	NC_017157	GAC	2	6	12399	12404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124332
98	NC_017157	GTT	2	6	12417	12422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124332
99	NC_017157	TAT	2	6	12497	12502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124332
100	NC_017157	ACG	2	6	12641	12646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124333
101	NC_017157	ATT	2	6	12667	12672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124333
102	NC_017157	GCG	2	6	12755	12760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124333
103	NC_017157	GTG	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124333
104	NC_017157	TTC	2	6	12788	12793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124333
105	NC_017157	AGG	2	6	12933	12938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124333
106	NC_017157	ATC	2	6	13076	13081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124334
107	NC_017157	GTT	2	6	13095	13100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124334
108	NC_017157	CAA	2	6	13204	13209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124334
109	NC_017157	TGA	2	6	13263	13268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124334
110	NC_017157	ATT	2	6	13329	13334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124334
111	NC_017157	AAT	2	6	13397	13402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124335
112	NC_017157	AAG	2	6	13467	13472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124335
113	NC_017157	ATT	2	6	13478	13483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124335
114	NC_017157	AAT	2	6	13526	13531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124335
115	NC_017157	TAT	2	6	13532	13537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124335
116	NC_017157	TTA	2	6	13540	13545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124335
117	NC_017157	TAA	2	6	13594	13599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124335
118	NC_017157	CCA	2	6	13602	13607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124335
119	NC_017157	TCC	2	6	13625	13630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124335
120	NC_017157	ATT	2	6	14067	14072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124336
121	NC_017157	GCA	2	6	14074	14079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124336
122	NC_017157	CCG	2	6	14083	14088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124336
123	NC_017157	TTA	2	6	14107	14112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124336
124	NC_017157	TAT	3	9	14131	14139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124336
125	NC_017157	GAT	2	6	14241	14246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124336
126	NC_017157	GCT	2	6	14364	14369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124336
127	NC_017157	TCT	2	6	14449	14454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124336
128	NC_017157	TAC	2	6	15699	15704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124337
129	NC_017157	CAT	2	6	15712	15717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124337
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