MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	384124321
2	NC_017157	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
3	NC_017157	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
4	NC_017157	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
5	NC_017157	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	384124324
6	NC_017157	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	384124324
7	NC_017157	TC	3	6	4395	4400	0 %	50 %	0 %	50 %	384124325
8	NC_017157	GA	4	8	4622	4629	50 %	0 %	50 %	0 %	384124325
9	NC_017157	AC	3	6	7479	7484	50 %	0 %	0 %	50 %	384124327
10	NC_017157	AT	3	6	7594	7599	50 %	50 %	0 %	0 %	384124327
11	NC_017157	CA	3	6	7606	7611	50 %	0 %	0 %	50 %	384124327
12	NC_017157	TG	3	6	8504	8509	0 %	50 %	50 %	0 %	384124329
13	NC_017157	AG	3	6	9743	9748	50 %	0 %	50 %	0 %	384124330
14	NC_017157	GA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	50 %	0 %	384124331
15	NC_017157	CA	3	6	11627	11632	50 %	0 %	0 %	50 %	384124332
16	NC_017157	TC	3	6	12724	12729	0 %	50 %	0 %	50 %	384124333
17	NC_017157	TA	3	6	13429	13434	50 %	50 %	0 %	0 %	384124335
18	NC_017157	TA	4	8	13645	13652	50 %	50 %	0 %	0 %	384124335
19	NC_017157	CT	3	6	15818	15823	0 %	50 %	0 %	50 %	384124337
20	NC_017157	CT	3	6	16647	16652	0 %	50 %	0 %	50 %	384124337
21	NC_017157	CT	3	6	19001	19006	0 %	50 %	0 %	50 %	384124339
22	NC_017157	CA	3	6	21096	21101	50 %	0 %	0 %	50 %	384124341
23	NC_017157	AG	3	6	21163	21168	50 %	0 %	50 %	0 %	384124341
24	NC_017157	GA	3	6	22749	22754	50 %	0 %	50 %	0 %	384124343
25	NC_017157	AT	3	6	23350	23355	50 %	50 %	0 %	0 %	384124344
26	NC_017157	AT	3	6	23406	23411	50 %	50 %	0 %	0 %	384124344
27	NC_017157	GA	3	6	23686	23691	50 %	0 %	50 %	0 %	384124344
28	NC_017157	AT	3	6	24529	24534	50 %	50 %	0 %	0 %	384124344
29	NC_017157	CG	3	6	24632	24637	0 %	0 %	50 %	50 %	384124344
30	NC_017157	AG	3	6	24720	24725	50 %	0 %	50 %	0 %	384124344
31	NC_017157	GC	3	6	25408	25413	0 %	0 %	50 %	50 %	384124345
32	NC_017157	CT	3	6	28476	28481	0 %	50 %	0 %	50 %	384124349
33	NC_017157	AG	3	6	29705	29710	50 %	0 %	50 %	0 %	384124351
34	NC_017157	CG	3	6	30265	30270	0 %	0 %	50 %	50 %	384124351
35	NC_017157	GC	3	6	30350	30355	0 %	0 %	50 %	50 %	384124351
36	NC_017157	CA	3	6	31448	31453	50 %	0 %	0 %	50 %	384124352
37	NC_017157	CT	3	6	32959	32964	0 %	50 %	0 %	50 %	384124354
38	NC_017157	GC	3	6	33366	33371	0 %	0 %	50 %	50 %	384124355
39	NC_017157	AT	3	6	33944	33949	50 %	50 %	0 %	0 %	384124355
40	NC_017157	CA	3	6	35076	35081	50 %	0 %	0 %	50 %	384124356
41	NC_017157	CT	3	6	35228	35233	0 %	50 %	0 %	50 %	384124356
42	NC_017157	TA	3	6	35553	35558	50 %	50 %	0 %	0 %	384124357
43	NC_017157	TC	3	6	35938	35943	0 %	50 %	0 %	50 %	384124357
44	NC_017157	GT	3	6	38904	38909	0 %	50 %	50 %	0 %	384124359
45	NC_017157	CG	3	6	39168	39173	0 %	0 %	50 %	50 %	384124360
46	NC_017157	AC	3	6	41695	41700	50 %	0 %	0 %	50 %	384124364
47	NC_017157	AG	3	6	42999	43004	50 %	0 %	50 %	0 %	384124366
48	NC_017157	TC	3	6	43226	43231	0 %	50 %	0 %	50 %	384124367
49	NC_017157	GC	3	6	43256	43261	0 %	0 %	50 %	50 %	384124367
50	NC_017157	GC	4	8	47310	47317	0 %	0 %	50 %	50 %	384124370
51	NC_017157	GT	3	6	47388	47393	0 %	50 %	50 %	0 %	384124370
52	NC_017157	CT	3	6	47744	47749	0 %	50 %	0 %	50 %	384124370
53	NC_017157	CT	3	6	47835	47840	0 %	50 %	0 %	50 %	384124370
54	NC_017157	TC	4	8	49880	49887	0 %	50 %	0 %	50 %	384124372
55	NC_017157	AT	3	6	50325	50330	50 %	50 %	0 %	0 %	384124372
56	NC_017157	TC	3	6	50902	50907	0 %	50 %	0 %	50 %	384124373
57	NC_017157	GC	3	6	51343	51348	0 %	0 %	50 %	50 %	384124373
58	NC_017157	GT	3	6	51375	51380	0 %	50 %	50 %	0 %	384124373
59	NC_017157	GT	3	6	52361	52366	0 %	50 %	50 %	0 %	384124373
60	NC_017157	GT	3	6	52784	52789	0 %	50 %	50 %	0 %	384124373
61	NC_017157	AG	3	6	52859	52864	50 %	0 %	50 %	0 %	384124373
62	NC_017157	GC	3	6	53296	53301	0 %	0 %	50 %	50 %	384124374
63	NC_017157	CA	3	6	53403	53408	50 %	0 %	0 %	50 %	384124374
64	NC_017157	CA	3	6	53491	53496	50 %	0 %	0 %	50 %	384124374
65	NC_017157	GC	3	6	55840	55845	0 %	0 %	50 %	50 %	384124375
66	NC_017157	CG	3	6	56345	56350	0 %	0 %	50 %	50 %	384124375
67	NC_017157	TG	3	6	56489	56494	0 %	50 %	50 %	0 %	384124375
68	NC_017157	AT	3	6	57956	57961	50 %	50 %	0 %	0 %	384124376
69	NC_017157	CA	3	6	57968	57973	50 %	0 %	0 %	50 %	384124376
70	NC_017157	CG	3	6	59199	59204	0 %	0 %	50 %	50 %	384124378
71	NC_017157	TC	3	6	60578	60583	0 %	50 %	0 %	50 %	384124379
72	NC_017157	TG	3	6	62062	62067	0 %	50 %	50 %	0 %	384124380
73	NC_017157	TC	3	6	62540	62545	0 %	50 %	0 %	50 %	384124381
74	NC_017157	CG	3	6	64707	64712	0 %	0 %	50 %	50 %	384124382
75	NC_017157	GT	3	6	64949	64954	0 %	50 %	50 %	0 %	384124382
76	NC_017157	GA	3	6	65076	65081	50 %	0 %	50 %	0 %	384124382
77	NC_017157	TA	3	6	65480	65485	50 %	50 %	0 %	0 %	384124383
78	NC_017157	GA	3	6	66764	66769	50 %	0 %	50 %	0 %	384124385

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.