MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	384124322
2	NC_017157	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017157	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017157	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017157	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017157	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017157	A	8	8	3449	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017157	A	7	7	3802	3808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017157	T	7	7	4367	4373	0 %	100 %	0 %	0 %	384124325
10	NC_017157	A	6	6	6408	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017157	A	6	6	6700	6705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017157	G	7	7	7195	7201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017157	G	6	6	8898	8903	0 %	0 %	100 %	0 %	384124329
14	NC_017157	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	384124329
15	NC_017157	T	7	7	9019	9025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017157	T	6	6	9533	9538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017157	T	7	7	9715	9721	0 %	100 %	0 %	0 %	384124330
18	NC_017157	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	384124330
19	NC_017157	A	6	6	10479	10484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017157	A	7	7	12446	12452	100 %	0 %	0 %	0 %	384124332
21	NC_017157	A	7	7	12713	12719	100 %	0 %	0 %	0 %	384124333
22	NC_017157	A	6	6	13720	13725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017157	A	6	6	13831	13836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017157	C	8	8	14034	14041	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_017157	A	6	6	14331	14336	100 %	0 %	0 %	0 %	384124336
26	NC_017157	A	7	7	14491	14497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017157	A	6	6	14499	14504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017157	A	6	6	14566	14571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017157	T	6	6	14574	14579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017157	G	7	7	14981	14987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017157	T	6	6	15185	15190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017157	A	6	6	15380	15385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017157	A	6	6	16063	16068	100 %	0 %	0 %	0 %	384124337
34	NC_017157	T	6	6	16304	16309	0 %	100 %	0 %	0 %	384124337
35	NC_017157	T	6	6	16430	16435	0 %	100 %	0 %	0 %	384124337
36	NC_017157	A	6	6	16893	16898	100 %	0 %	0 %	0 %	384124337
37	NC_017157	A	6	6	17497	17502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017157	A	6	6	18054	18059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017157	C	7	7	18257	18263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_017157	T	6	6	18312	18317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017157	T	7	7	19477	19483	0 %	100 %	0 %	0 %	384124339
42	NC_017157	G	6	6	20719	20724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017157	T	6	6	21419	21424	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
44	NC_017157	T	7	7	21584	21590	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
45	NC_017157	T	6	6	23311	23316	0 %	100 %	0 %	0 %	384124344
46	NC_017157	G	8	8	25051	25058	0 %	0 %	100 %	0 %	384124344
47	NC_017157	G	6	6	25834	25839	0 %	0 %	100 %	0 %	384124346
48	NC_017157	A	7	7	26507	26513	100 %	0 %	0 %	0 %	384124348
49	NC_017157	T	6	6	27494	27499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017157	G	6	6	27899	27904	0 %	0 %	100 %	0 %	384124349
51	NC_017157	G	9	9	28064	28072	0 %	0 %	100 %	0 %	384124349
52	NC_017157	A	6	6	29043	29048	100 %	0 %	0 %	0 %	384124350
53	NC_017157	A	6	6	29505	29510	100 %	0 %	0 %	0 %	384124351
54	NC_017157	A	6	6	29957	29962	100 %	0 %	0 %	0 %	384124351
55	NC_017157	C	7	7	31761	31767	0 %	0 %	0 %	100 %	384124353
56	NC_017157	T	7	7	31962	31968	0 %	100 %	0 %	0 %	384124353
57	NC_017157	T	7	7	33564	33570	0 %	100 %	0 %	0 %	384124355
58	NC_017157	A	7	7	33675	33681	100 %	0 %	0 %	0 %	384124355
59	NC_017157	T	8	8	34667	34674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017157	T	7	7	34752	34758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017157	C	7	7	35010	35016	0 %	0 %	0 %	100 %	384124356
62	NC_017157	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
63	NC_017157	T	6	6	35722	35727	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
64	NC_017157	T	8	8	36304	36311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017157	T	7	7	36577	36583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017157	A	6	6	36709	36714	100 %	0 %	0 %	0 %	384124358
67	NC_017157	T	6	6	37134	37139	0 %	100 %	0 %	0 %	384124359
68	NC_017157	A	6	6	37643	37648	100 %	0 %	0 %	0 %	384124359
69	NC_017157	T	6	6	39194	39199	0 %	100 %	0 %	0 %	384124360
70	NC_017157	T	6	6	39341	39346	0 %	100 %	0 %	0 %	384124361
71	NC_017157	A	6	6	39465	39470	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
72	NC_017157	A	6	6	39712	39717	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
73	NC_017157	G	6	6	39978	39983	0 %	0 %	100 %	0 %	384124361
74	NC_017157	A	6	6	40274	40279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017157	G	7	7	41836	41842	0 %	0 %	100 %	0 %	384124364
76	NC_017157	T	6	6	43931	43936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017157	A	7	7	43965	43971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017157	G	6	6	44108	44113	0 %	0 %	100 %	0 %	384124368
79	NC_017157	G	6	6	44725	44730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017157	C	6	6	44879	44884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_017157	A	7	7	45200	45206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017157	A	6	6	46177	46182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017157	T	6	6	46867	46872	0 %	100 %	0 %	0 %	384124370
84	NC_017157	A	6	6	47935	47940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017157	T	6	6	47943	47948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017157	T	6	6	48034	48039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017157	T	6	6	48079	48084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017157	A	6	6	48085	48090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017157	T	6	6	49069	49074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017157	T	6	6	49331	49336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017157	T	8	8	49691	49698	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
92	NC_017157	T	6	6	49753	49758	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
93	NC_017157	T	7	7	49897	49903	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
94	NC_017157	T	6	6	50180	50185	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
95	NC_017157	T	6	6	50734	50739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017157	C	6	6	51574	51579	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
97	NC_017157	C	8	8	51632	51639	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
98	NC_017157	A	7	7	53273	53279	100 %	0 %	0 %	0 %	384124374
99	NC_017157	T	6	6	54467	54472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017157	T	7	7	55164	55170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017157	A	6	6	55422	55427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017157	T	7	7	56430	56436	0 %	100 %	0 %	0 %	384124375
103	NC_017157	T	6	6	56973	56978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017157	C	6	6	57298	57303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017157	A	6	6	59836	59841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017157	T	6	6	60339	60344	0 %	100 %	0 %	0 %	384124379
107	NC_017157	T	6	6	60399	60404	0 %	100 %	0 %	0 %	384124379
108	NC_017157	T	8	8	60989	60996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017157	A	6	6	61368	61373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017157	A	9	9	61510	61518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017157	A	7	7	61587	61593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017157	T	7	7	61646	61652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017157	A	6	6	61674	61679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017157	A	7	7	61683	61689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017157	A	7	7	61804	61810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017157	G	6	6	62867	62872	0 %	0 %	100 %	0 %	384124381
117	NC_017157	T	6	6	63930	63935	0 %	100 %	0 %	0 %	384124381
118	NC_017157	T	6	6	64636	64641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017157	A	7	7	65185	65191	100 %	0 %	0 %	0 %	384124382
120	NC_017157	T	6	6	65872	65877	0 %	100 %	0 %	0 %	384124384
121	NC_017157	A	6	6	66546	66551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017157	T	7	7	67999	68005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017157	A	8	8	68184	68191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017157	T	6	6	68649	68654	0 %	100 %	0 %	0 %	384124387

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.