MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	384124322
2	NC_017157	T	7	7	4367	4373	0 %	100 %	0 %	0 %	384124325
3	NC_017157	G	6	6	8898	8903	0 %	0 %	100 %	0 %	384124329
4	NC_017157	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	384124329
5	NC_017157	T	7	7	9715	9721	0 %	100 %	0 %	0 %	384124330
6	NC_017157	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	384124330
7	NC_017157	A	7	7	12446	12452	100 %	0 %	0 %	0 %	384124332
8	NC_017157	A	7	7	12713	12719	100 %	0 %	0 %	0 %	384124333
9	NC_017157	A	6	6	14331	14336	100 %	0 %	0 %	0 %	384124336
10	NC_017157	A	6	6	16063	16068	100 %	0 %	0 %	0 %	384124337
11	NC_017157	T	6	6	16304	16309	0 %	100 %	0 %	0 %	384124337
12	NC_017157	T	6	6	16430	16435	0 %	100 %	0 %	0 %	384124337
13	NC_017157	A	6	6	16893	16898	100 %	0 %	0 %	0 %	384124337
14	NC_017157	T	7	7	19477	19483	0 %	100 %	0 %	0 %	384124339
15	NC_017157	T	6	6	21419	21424	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
16	NC_017157	T	7	7	21584	21590	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
17	NC_017157	T	6	6	23311	23316	0 %	100 %	0 %	0 %	384124344
18	NC_017157	G	8	8	25051	25058	0 %	0 %	100 %	0 %	384124344
19	NC_017157	G	6	6	25834	25839	0 %	0 %	100 %	0 %	384124346
20	NC_017157	A	7	7	26507	26513	100 %	0 %	0 %	0 %	384124348
21	NC_017157	G	6	6	27899	27904	0 %	0 %	100 %	0 %	384124349
22	NC_017157	G	9	9	28064	28072	0 %	0 %	100 %	0 %	384124349
23	NC_017157	A	6	6	29043	29048	100 %	0 %	0 %	0 %	384124350
24	NC_017157	A	6	6	29505	29510	100 %	0 %	0 %	0 %	384124351
25	NC_017157	A	6	6	29957	29962	100 %	0 %	0 %	0 %	384124351
26	NC_017157	C	7	7	31761	31767	0 %	0 %	0 %	100 %	384124353
27	NC_017157	T	7	7	31962	31968	0 %	100 %	0 %	0 %	384124353
28	NC_017157	T	7	7	33564	33570	0 %	100 %	0 %	0 %	384124355
29	NC_017157	A	7	7	33675	33681	100 %	0 %	0 %	0 %	384124355
30	NC_017157	C	7	7	35010	35016	0 %	0 %	0 %	100 %	384124356
31	NC_017157	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
32	NC_017157	T	6	6	35722	35727	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
33	NC_017157	A	6	6	36709	36714	100 %	0 %	0 %	0 %	384124358
34	NC_017157	T	6	6	37134	37139	0 %	100 %	0 %	0 %	384124359
35	NC_017157	A	6	6	37643	37648	100 %	0 %	0 %	0 %	384124359
36	NC_017157	T	6	6	39194	39199	0 %	100 %	0 %	0 %	384124360
37	NC_017157	T	6	6	39341	39346	0 %	100 %	0 %	0 %	384124361
38	NC_017157	A	6	6	39465	39470	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
39	NC_017157	A	6	6	39712	39717	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
40	NC_017157	G	6	6	39978	39983	0 %	0 %	100 %	0 %	384124361
41	NC_017157	G	7	7	41836	41842	0 %	0 %	100 %	0 %	384124364
42	NC_017157	G	6	6	44108	44113	0 %	0 %	100 %	0 %	384124368
43	NC_017157	T	6	6	46867	46872	0 %	100 %	0 %	0 %	384124370
44	NC_017157	T	8	8	49691	49698	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
45	NC_017157	T	6	6	49753	49758	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
46	NC_017157	T	7	7	49897	49903	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
47	NC_017157	T	6	6	50180	50185	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
48	NC_017157	C	6	6	51574	51579	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
49	NC_017157	C	8	8	51632	51639	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
50	NC_017157	A	7	7	53273	53279	100 %	0 %	0 %	0 %	384124374
51	NC_017157	T	7	7	56430	56436	0 %	100 %	0 %	0 %	384124375
52	NC_017157	T	6	6	60339	60344	0 %	100 %	0 %	0 %	384124379
53	NC_017157	T	6	6	60399	60404	0 %	100 %	0 %	0 %	384124379
54	NC_017157	G	6	6	62867	62872	0 %	0 %	100 %	0 %	384124381
55	NC_017157	T	6	6	63930	63935	0 %	100 %	0 %	0 %	384124381
56	NC_017157	A	7	7	65185	65191	100 %	0 %	0 %	0 %	384124382
57	NC_017157	T	6	6	65872	65877	0 %	100 %	0 %	0 %	384124384
58	NC_017157	T	6	6	68649	68654	0 %	100 %	0 %	0 %	384124387

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.