MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pPCY1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017156	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017156	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	384124300
3	NC_017156	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	384124300
4	NC_017156	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	384124300
5	NC_017156	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	384124301
6	NC_017156	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	384124301
7	NC_017156	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	384124301
8	NC_017156	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017156	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017156	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017156	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017156	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017156	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017156	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	384124303
15	NC_017156	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	384124303
16	NC_017156	TCTT	2	8	5507	5514	0 %	75 %	0 %	25 %	384124304
17	NC_017156	ATGA	2	8	6987	6994	50 %	25 %	25 %	0 %	384124306
18	NC_017156	AATC	2	8	6996	7003	50 %	25 %	0 %	25 %	384124306
19	NC_017156	TACA	2	8	7460	7467	50 %	25 %	0 %	25 %	384124306
20	NC_017156	TCCT	2	8	7811	7818	0 %	50 %	0 %	50 %	384124307
21	NC_017156	ACAG	2	8	8570	8577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017156	ACGA	2	8	8667	8674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017156	TGCC	2	8	8677	8684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017156	CTGT	2	8	8950	8957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017156	ACAA	2	8	9207	9214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017156	TAAT	2	8	9264	9271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.