MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384124223
2	NC_017155	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124226
3	NC_017155	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384124226
4	NC_017155	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384124226
5	NC_017155	CGAGTT	2	12	11312	11323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124229
6	NC_017155	AGTGAT	2	12	19589	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124235
7	NC_017155	GTTACG	2	12	22695	22706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124241
8	NC_017155	AACGGT	2	12	24271	24282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384124243
9	NC_017155	GGCTGC	2	12	27020	27031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384124245
10	NC_017155	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124247
11	NC_017155	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384124251
12	NC_017155	CGCGCC	2	12	40713	40724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124259
13	NC_017155	TGTGGT	2	12	42686	42697	0 %	50 %	50 %	0 %	384124260
14	NC_017155	TGGATA	2	12	46762	46773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124263
15	NC_017155	AGGGTT	2	12	49685	49696	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384124266
16	NC_017155	GCCAGT	2	12	52317	52328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384124268
17	NC_017155	TCAGCA	2	12	52611	52622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384124269
18	NC_017155	TGCTTG	2	12	53083	53094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384124269
19	NC_017155	TCGCCA	2	12	53149	53160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384124269
20	NC_017155	CGCCAG	2	12	56625	56636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124273
21	NC_017155	ACACGC	2	12	57485	57496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384124274
22	NC_017155	CGCCAG	2	12	61025	61036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124275
23	NC_017155	CGTCCA	2	12	61567	61578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384124275
24	NC_017155	TACGGT	2	12	67021	67032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124279
25	NC_017155	TAATTG	2	12	67365	67376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384124279
26	NC_017155	AATTCA	2	12	68237	68248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384124280
27	NC_017155	TTCTTT	2	12	70668	70679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384124281
28	NC_017155	CATGTT	2	12	78401	78412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124287
29	NC_017155	CGCTTT	2	12	81790	81801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384124290
30	NC_017155	ACCCCT	2	12	84125	84136	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384124291
31	NC_017155	GTTATT	2	12	86353	86364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384124293
32	NC_017155	CCAGGA	2	12	90851	90862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124297
33	NC_017155	TCGGCT	2	12	92693	92704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124298

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.