MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017155	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017155	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017155	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017155	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017155	GCGA	2	8	18463	18470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017155	CGCA	2	8	18496	18503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017155	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017155	TAGG	2	8	26542	26549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017155	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017155	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017155	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017155	ATAA	3	12	35266	35277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017155	AAAG	2	8	36885	36892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017155	GGTG	2	8	37534	37541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017155	ACCT	2	8	38731	38738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017155	TAAG	2	8	43418	43425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017155	TCGT	2	8	44961	44968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017155	GTTT	2	8	46140	46147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017155	ACCA	2	8	46365	46372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017155	AATG	2	8	47689	47696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017155	TGAA	2	8	47954	47961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017155	TGGT	2	8	48109	48116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017155	TTAT	2	8	49185	49192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017155	TGAG	2	8	51001	51008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017155	AGTA	2	8	51217	51224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017155	CGAG	2	8	54720	54727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017155	TACT	2	8	54744	54751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017155	GAAA	2	8	55242	55249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017155	GAAG	2	8	55268	55275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017155	TCGT	2	8	61738	61745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017155	AGTA	2	8	61780	61787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017155	TAGG	2	8	64274	64281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017155	TGTT	2	8	64342	64349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017155	CCAT	2	8	64435	64442	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017155	GAAA	2	8	64674	64681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017155	GAAA	2	8	66527	66534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017155	AGGG	2	8	66544	66551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017155	TTTA	2	8	71043	71050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017155	CTTG	2	8	71087	71094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017155	AGCC	2	8	72280	72287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017155	GCTG	2	8	72362	72369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017155	AACC	2	8	72398	72405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017155	GTCT	2	8	75937	75944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017155	GATA	2	8	76216	76223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017155	GCAA	2	8	76317	76324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017155	CAGG	2	8	76368	76375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017155	GCTG	2	8	76429	76436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017155	CATA	2	8	79926	79933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017155	AGCG	2	8	80603	80610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017155	CCTG	2	8	82495	82502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017155	TTTG	2	8	85546	85553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017155	AGGC	2	8	85660	85667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017155	AATG	2	8	87269	87276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017155	CCAG	2	8	87996	88003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017155	TGGA	2	8	90187	90194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017155	TCGC	2	8	90534	90541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017155	CTGC	2	8	91246	91253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017155	AAGA	2	8	92129	92136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.