MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	384124223
2	NC_017155	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	384124223
3	NC_017155	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	384124223
4	NC_017155	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017155	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	384124225
6	NC_017155	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	384124225
7	NC_017155	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017155	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	384124226
9	NC_017155	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	384124226
10	NC_017155	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	384124226
11	NC_017155	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	384124226
12	NC_017155	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	384124226
13	NC_017155	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	384124226
14	NC_017155	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	384124227
15	NC_017155	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	384124228
16	NC_017155	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	384124228
17	NC_017155	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	384124228
18	NC_017155	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	384124228
19	NC_017155	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	384124228
20	NC_017155	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	384124228
21	NC_017155	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	384124228
22	NC_017155	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	384124230
23	NC_017155	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	384124231
24	NC_017155	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	384124232
25	NC_017155	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
26	NC_017155	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
27	NC_017155	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
28	NC_017155	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	384124233
29	NC_017155	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017155	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	384124235
31	NC_017155	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	384124235
32	NC_017155	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017155	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	384124237
34	NC_017155	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124242
35	NC_017155	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	384124244
36	NC_017155	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	384124244
37	NC_017155	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	384124244
38	NC_017155	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	384124244
39	NC_017155	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	384124245
40	NC_017155	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	384124245
41	NC_017155	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	384124245
42	NC_017155	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	384124245
43	NC_017155	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	384124246
44	NC_017155	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017155	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017155	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017155	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	384124251
48	NC_017155	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	384124251
49	NC_017155	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124252
50	NC_017155	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	384124253
51	NC_017155	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	384124253
52	NC_017155	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017155	GC	3	6	36193	36198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017155	TG	3	6	36425	36430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017155	CT	3	6	36840	36845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017155	CA	3	6	38367	38372	50 %	0 %	0 %	50 %	384124256
57	NC_017155	AG	3	6	40302	40307	50 %	0 %	50 %	0 %	384124259
58	NC_017155	TG	3	6	40522	40527	0 %	50 %	50 %	0 %	384124259
59	NC_017155	GT	3	6	41620	41625	0 %	50 %	50 %	0 %	384124259
60	NC_017155	AG	3	6	42964	42969	50 %	0 %	50 %	0 %	384124260
61	NC_017155	AC	3	6	43916	43921	50 %	0 %	0 %	50 %	384124261
62	NC_017155	TC	4	8	44881	44888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017155	AG	3	6	45864	45869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017155	AG	3	6	45973	45978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017155	CT	3	6	46009	46014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017155	AT	3	6	46112	46117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017155	CA	3	6	46152	46157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017155	AG	3	6	46335	46340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017155	AG	3	6	46377	46382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017155	AG	3	6	47565	47570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017155	CT	3	6	47767	47772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017155	CT	3	6	47972	47977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017155	CG	4	8	48079	48086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017155	TG	3	6	48610	48615	0 %	50 %	50 %	0 %	384124264
75	NC_017155	TA	3	6	48863	48868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017155	GT	3	6	49371	49376	0 %	50 %	50 %	0 %	384124265
77	NC_017155	TA	3	6	51227	51232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017155	CG	4	8	51785	51792	0 %	0 %	50 %	50 %	384124268
79	NC_017155	AG	3	6	51897	51902	50 %	0 %	50 %	0 %	384124268
80	NC_017155	CG	3	6	53031	53036	0 %	0 %	50 %	50 %	384124269
81	NC_017155	GA	3	6	53204	53209	50 %	0 %	50 %	0 %	384124269
82	NC_017155	GT	4	8	53820	53827	0 %	50 %	50 %	0 %	384124270
83	NC_017155	CA	3	6	54390	54395	50 %	0 %	0 %	50 %	384124270
84	NC_017155	GA	3	6	54857	54862	50 %	0 %	50 %	0 %	384124271
85	NC_017155	TA	3	6	55223	55228	50 %	50 %	0 %	0 %	384124271
86	NC_017155	CT	3	6	55769	55774	0 %	50 %	0 %	50 %	384124272
87	NC_017155	CA	3	6	56177	56182	50 %	0 %	0 %	50 %	384124272
88	NC_017155	CG	3	6	58025	58030	0 %	0 %	50 %	50 %	384124274
89	NC_017155	CT	3	6	58539	58544	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
90	NC_017155	GT	3	6	59314	59319	0 %	50 %	50 %	0 %	384124274
91	NC_017155	TC	3	6	60050	60055	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
92	NC_017155	TC	3	6	60219	60224	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
93	NC_017155	AG	3	6	60454	60459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017155	AC	3	6	60958	60963	50 %	0 %	0 %	50 %	384124275
95	NC_017155	GT	3	6	61306	61311	0 %	50 %	50 %	0 %	384124275
96	NC_017155	GA	3	6	61516	61521	50 %	0 %	50 %	0 %	384124275
97	NC_017155	TA	3	6	61757	61762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017155	AT	3	6	61764	61769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017155	TG	3	6	63786	63791	0 %	50 %	50 %	0 %	384124276
100	NC_017155	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	384124276
101	NC_017155	TG	3	6	64218	64223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017155	TC	3	6	64894	64899	0 %	50 %	0 %	50 %	384124277
103	NC_017155	CG	3	6	65808	65813	0 %	0 %	50 %	50 %	384124278
104	NC_017155	CT	3	6	66800	66805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017155	GA	3	6	67161	67166	50 %	0 %	50 %	0 %	384124279
106	NC_017155	AT	3	6	67520	67525	50 %	50 %	0 %	0 %	384124279
107	NC_017155	AG	3	6	67564	67569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017155	TC	3	6	67699	67704	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
109	NC_017155	TC	3	6	67988	67993	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
110	NC_017155	AC	3	6	68333	68338	50 %	0 %	0 %	50 %	384124280
111	NC_017155	GT	3	6	69104	69109	0 %	50 %	50 %	0 %	384124280
112	NC_017155	CT	3	6	69991	69996	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
113	NC_017155	CA	3	6	70076	70081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017155	AT	3	6	70508	70513	50 %	50 %	0 %	0 %	384124281
115	NC_017155	CT	3	6	70558	70563	0 %	50 %	0 %	50 %	384124281
116	NC_017155	CA	3	6	71057	71062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017155	AT	3	6	71267	71272	50 %	50 %	0 %	0 %	384124282
118	NC_017155	AT	3	6	71390	71395	50 %	50 %	0 %	0 %	384124282
119	NC_017155	AG	3	6	71633	71638	50 %	0 %	50 %	0 %	384124282
120	NC_017155	CA	3	6	72785	72790	50 %	0 %	0 %	50 %	384124283
121	NC_017155	GT	3	6	74026	74031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017155	CG	3	6	75305	75310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017155	TC	3	6	75368	75373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017155	TC	3	6	76773	76778	0 %	50 %	0 %	50 %	384124286
125	NC_017155	TG	3	6	78458	78463	0 %	50 %	50 %	0 %	384124287
126	NC_017155	TA	3	6	78953	78958	50 %	50 %	0 %	0 %	384124287
127	NC_017155	GA	3	6	79506	79511	50 %	0 %	50 %	0 %	384124288
128	NC_017155	TA	3	6	79990	79995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017155	AG	3	6	80951	80956	50 %	0 %	50 %	0 %	384124289
130	NC_017155	GT	3	6	83240	83245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017155	AT	3	6	83275	83280	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
132	NC_017155	AT	4	8	83583	83590	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
133	NC_017155	AT	3	6	84490	84495	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
134	NC_017155	CG	3	6	84719	84724	0 %	0 %	50 %	50 %	384124292
135	NC_017155	TC	4	8	85023	85030	0 %	50 %	0 %	50 %	384124292
136	NC_017155	GA	3	6	85323	85328	50 %	0 %	50 %	0 %	384124292
137	NC_017155	CA	3	6	86065	86070	50 %	0 %	0 %	50 %	384124293
138	NC_017155	TA	3	6	87291	87296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017155	GC	3	6	87717	87722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017155	CA	3	6	88600	88605	50 %	0 %	0 %	50 %	384124294
141	NC_017155	GC	3	6	88747	88752	0 %	0 %	50 %	50 %	384124294
142	NC_017155	TG	3	6	88856	88861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017155	GC	3	6	89545	89550	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
144	NC_017155	GC	3	6	89917	89922	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
145	NC_017155	CG	3	6	89945	89950	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
146	NC_017155	CG	3	6	91223	91228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017155	CG	3	6	91659	91664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017155	GC	3	6	92604	92609	0 %	0 %	50 %	50 %	384124298
149	NC_017155	TG	3	6	94230	94235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.