MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017155	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017155	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017155	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017155	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017155	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017155	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017155	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017155	GC	3	6	36193	36198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017155	TG	3	6	36425	36430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017155	CT	3	6	36840	36845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017155	TC	4	8	44881	44888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017155	AG	3	6	45864	45869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017155	AG	3	6	45973	45978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017155	CT	3	6	46009	46014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017155	AT	3	6	46112	46117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017155	CA	3	6	46152	46157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017155	AG	3	6	46335	46340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017155	AG	3	6	46377	46382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017155	AG	3	6	47565	47570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017155	CT	3	6	47767	47772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017155	CT	3	6	47972	47977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017155	CG	4	8	48079	48086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017155	TA	3	6	48863	48868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017155	TA	3	6	51227	51232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017155	AG	3	6	60454	60459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017155	TA	3	6	61757	61762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017155	AT	3	6	61764	61769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017155	TG	3	6	64218	64223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017155	CT	3	6	66800	66805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017155	AG	3	6	67564	67569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017155	CA	3	6	70076	70081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017155	CA	3	6	71057	71062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017155	GT	3	6	74026	74031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017155	CG	3	6	75305	75310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017155	TC	3	6	75368	75373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017155	TA	3	6	79990	79995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017155	GT	3	6	83240	83245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017155	TA	3	6	87291	87296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017155	GC	3	6	87717	87722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017155	TG	3	6	88856	88861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017155	CG	3	6	91223	91228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017155	CG	3	6	91659	91664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017155	TG	3	6	94230	94235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.