MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	384124223
2	NC_017155	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	384124224
3	NC_017155	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017155	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	384124227
5	NC_017155	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	384124227
6	NC_017155	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	384124228
7	NC_017155	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	384124229
8	NC_017155	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	384124235
9	NC_017155	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	384124241
10	NC_017155	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	384124244
11	NC_017155	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	384124244
12	NC_017155	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	384124249
13	NC_017155	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	384124250
14	NC_017155	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	384124251
15	NC_017155	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	384124253
16	NC_017155	T	8	8	35182	35189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017155	A	6	6	35200	35205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017155	A	6	6	35336	35341	100 %	0 %	0 %	0 %	384124254
19	NC_017155	A	6	6	35780	35785	100 %	0 %	0 %	0 %	384124254
20	NC_017155	T	6	6	36031	36036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017155	T	6	6	36303	36308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017155	T	6	6	36351	36356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017155	A	6	6	36456	36461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017155	A	6	6	37953	37958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017155	A	6	6	38687	38692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017155	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	384124257
27	NC_017155	T	7	7	41754	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	384124259
28	NC_017155	T	7	7	43672	43678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017155	G	7	7	43836	43842	0 %	0 %	100 %	0 %	384124261
30	NC_017155	A	6	6	43887	43892	100 %	0 %	0 %	0 %	384124261
31	NC_017155	A	6	6	44610	44615	100 %	0 %	0 %	0 %	384124261
32	NC_017155	T	6	6	48297	48302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017155	T	6	6	49630	49635	0 %	100 %	0 %	0 %	384124265
34	NC_017155	T	6	6	49640	49645	0 %	100 %	0 %	0 %	384124266
35	NC_017155	A	6	6	50105	50110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017155	T	6	6	55175	55180	0 %	100 %	0 %	0 %	384124271
37	NC_017155	A	6	6	55663	55668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017155	A	6	6	56307	56312	100 %	0 %	0 %	0 %	384124272
39	NC_017155	T	7	7	62044	62050	0 %	100 %	0 %	0 %	384124276
40	NC_017155	A	6	6	65063	65068	100 %	0 %	0 %	0 %	384124277
41	NC_017155	A	7	7	66433	66439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017155	A	6	6	66582	66587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017155	A	7	7	66708	66714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017155	T	7	7	67512	67518	0 %	100 %	0 %	0 %	384124279
45	NC_017155	T	6	6	67655	67660	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
46	NC_017155	T	6	6	67728	67733	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
47	NC_017155	T	6	6	68114	68119	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
48	NC_017155	T	6	6	68462	68467	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
49	NC_017155	A	7	7	68529	68535	100 %	0 %	0 %	0 %	384124280
50	NC_017155	T	6	6	68587	68592	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
51	NC_017155	T	8	8	68838	68845	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
52	NC_017155	C	6	6	69055	69060	0 %	0 %	0 %	100 %	384124280
53	NC_017155	C	6	6	69177	69182	0 %	0 %	0 %	100 %	384124280
54	NC_017155	C	6	6	70341	70346	0 %	0 %	0 %	100 %	384124281
55	NC_017155	T	6	6	71473	71478	0 %	100 %	0 %	0 %	384124282
56	NC_017155	T	6	6	71876	71881	0 %	100 %	0 %	0 %	384124282
57	NC_017155	A	6	6	72242	72247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017155	A	6	6	73139	73144	100 %	0 %	0 %	0 %	384124283
59	NC_017155	A	7	7	73604	73610	100 %	0 %	0 %	0 %	384124283
60	NC_017155	T	6	6	73732	73737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017155	T	7	7	73808	73814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017155	A	7	7	73833	73839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017155	A	6	6	73909	73914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017155	A	6	6	74064	74069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017155	T	9	9	77921	77929	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
66	NC_017155	T	6	6	77979	77984	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
67	NC_017155	T	6	6	78080	78085	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
68	NC_017155	T	7	7	78278	78284	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
69	NC_017155	T	6	6	78580	78585	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
70	NC_017155	T	7	7	78742	78748	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
71	NC_017155	G	6	6	78934	78939	0 %	0 %	100 %	0 %	384124287
72	NC_017155	A	8	8	79634	79641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017155	A	6	6	79857	79862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017155	T	6	6	79878	79883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017155	A	6	6	80070	80075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017155	T	7	7	80092	80098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017155	T	6	6	82193	82198	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
78	NC_017155	T	6	6	82254	82259	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
79	NC_017155	T	8	8	82973	82980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017155	T	6	6	83234	83239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017155	T	6	6	85508	85513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017155	A	6	6	88307	88312	100 %	0 %	0 %	0 %	384124294
83	NC_017155	A	6	6	89441	89446	100 %	0 %	0 %	0 %	384124295
84	NC_017155	T	6	6	90675	90680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017155	A	6	6	92236	92241	100 %	0 %	0 %	0 %	384124298
86	NC_017155	A	7	7	92251	92257	100 %	0 %	0 %	0 %	384124298

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.