MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	384124223
2	NC_017155	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	384124224
3	NC_017155	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	384124227
4	NC_017155	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	384124227
5	NC_017155	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	384124228
6	NC_017155	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	384124229
7	NC_017155	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	384124235
8	NC_017155	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	384124241
9	NC_017155	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	384124244
10	NC_017155	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	384124244
11	NC_017155	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	384124249
12	NC_017155	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	384124250
13	NC_017155	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	384124251
14	NC_017155	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	384124253
15	NC_017155	A	6	6	35336	35341	100 %	0 %	0 %	0 %	384124254
16	NC_017155	A	6	6	35780	35785	100 %	0 %	0 %	0 %	384124254
17	NC_017155	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	384124257
18	NC_017155	T	7	7	41754	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	384124259
19	NC_017155	G	7	7	43836	43842	0 %	0 %	100 %	0 %	384124261
20	NC_017155	A	6	6	43887	43892	100 %	0 %	0 %	0 %	384124261
21	NC_017155	A	6	6	44610	44615	100 %	0 %	0 %	0 %	384124261
22	NC_017155	T	6	6	49630	49635	0 %	100 %	0 %	0 %	384124265
23	NC_017155	T	6	6	49640	49645	0 %	100 %	0 %	0 %	384124266
24	NC_017155	T	6	6	55175	55180	0 %	100 %	0 %	0 %	384124271
25	NC_017155	A	6	6	56307	56312	100 %	0 %	0 %	0 %	384124272
26	NC_017155	T	7	7	62044	62050	0 %	100 %	0 %	0 %	384124276
27	NC_017155	A	6	6	65063	65068	100 %	0 %	0 %	0 %	384124277
28	NC_017155	T	7	7	67512	67518	0 %	100 %	0 %	0 %	384124279
29	NC_017155	T	6	6	67655	67660	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
30	NC_017155	T	6	6	67728	67733	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
31	NC_017155	T	6	6	68114	68119	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
32	NC_017155	T	6	6	68462	68467	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
33	NC_017155	A	7	7	68529	68535	100 %	0 %	0 %	0 %	384124280
34	NC_017155	T	6	6	68587	68592	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
35	NC_017155	T	8	8	68838	68845	0 %	100 %	0 %	0 %	384124280
36	NC_017155	C	6	6	69055	69060	0 %	0 %	0 %	100 %	384124280
37	NC_017155	C	6	6	69177	69182	0 %	0 %	0 %	100 %	384124280
38	NC_017155	C	6	6	70341	70346	0 %	0 %	0 %	100 %	384124281
39	NC_017155	T	6	6	71473	71478	0 %	100 %	0 %	0 %	384124282
40	NC_017155	T	6	6	71876	71881	0 %	100 %	0 %	0 %	384124282
41	NC_017155	A	6	6	73139	73144	100 %	0 %	0 %	0 %	384124283
42	NC_017155	A	7	7	73604	73610	100 %	0 %	0 %	0 %	384124283
43	NC_017155	T	9	9	77921	77929	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
44	NC_017155	T	6	6	77979	77984	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
45	NC_017155	T	6	6	78080	78085	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
46	NC_017155	T	7	7	78278	78284	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
47	NC_017155	T	6	6	78580	78585	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
48	NC_017155	T	7	7	78742	78748	0 %	100 %	0 %	0 %	384124287
49	NC_017155	G	6	6	78934	78939	0 %	0 %	100 %	0 %	384124287
50	NC_017155	T	6	6	82193	82198	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
51	NC_017155	T	6	6	82254	82259	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
52	NC_017155	A	6	6	88307	88312	100 %	0 %	0 %	0 %	384124294
53	NC_017155	A	6	6	89441	89446	100 %	0 %	0 %	0 %	384124295
54	NC_017155	A	6	6	92236	92241	100 %	0 %	0 %	0 %	384124298
55	NC_017155	A	7	7	92251	92257	100 %	0 %	0 %	0 %	384124298

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.