MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pCD1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017153	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017153	GGACC	2	10	7059	7068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017153	TGTAG	2	10	7102	7111	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017153	ATTAA	2	10	8294	8303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017153	AACAT	2	10	10416	10425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017153	TTTTA	2	10	17151	17160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017153	TAAAA	2	10	17290	17299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017153	TTCAC	2	10	30965	30974	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017153	TAAAT	2	10	33488	33497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017153	CTATA	2	10	46597	46606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017153	CGGGG	2	10	53775	53784	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017153	AAAAG	2	10	54018	54027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017153	TCGCC	2	10	55327	55336	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017153	ATTAA	2	10	57333	57342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017153	AATCG	2	10	60116	60125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017153	CCTCA	2	10	60198	60207	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017153	CTGTA	2	10	60393	60402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017153	ACCTT	2	10	67902	67911	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.