MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pCD1

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017153	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	384120526
2	NC_017153	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	384120527
3	NC_017153	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	384120527
4	NC_017153	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	384120527
5	NC_017153	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	384120529
6	NC_017153	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	384120529
7	NC_017153	TC	3	6	4395	4400	0 %	50 %	0 %	50 %	384120530
8	NC_017153	GA	4	8	4622	4629	50 %	0 %	50 %	0 %	384120530
9	NC_017153	AC	3	6	7479	7484	50 %	0 %	0 %	50 %	384120532
10	NC_017153	AT	3	6	7594	7599	50 %	50 %	0 %	0 %	384120532
11	NC_017153	CA	3	6	7606	7611	50 %	0 %	0 %	50 %	384120532
12	NC_017153	TG	3	6	8503	8508	0 %	50 %	50 %	0 %	384120534
13	NC_017153	AG	3	6	9742	9747	50 %	0 %	50 %	0 %	384120535
14	NC_017153	GA	3	6	10956	10961	50 %	0 %	50 %	0 %	384120536
15	NC_017153	TC	3	6	11400	11405	0 %	50 %	0 %	50 %	384120536
16	NC_017153	TA	3	6	12105	12110	50 %	50 %	0 %	0 %	384120538
17	NC_017153	TA	4	8	12321	12328	50 %	50 %	0 %	0 %	384120538
18	NC_017153	CT	3	6	14494	14499	0 %	50 %	0 %	50 %	384120540
19	NC_017153	CT	3	6	15323	15328	0 %	50 %	0 %	50 %	384120540
20	NC_017153	CT	3	6	17677	17682	0 %	50 %	0 %	50 %	384120542
21	NC_017153	CA	3	6	19772	19777	50 %	0 %	0 %	50 %	384120544
22	NC_017153	AG	3	6	19839	19844	50 %	0 %	50 %	0 %	384120544
23	NC_017153	GA	3	6	21425	21430	50 %	0 %	50 %	0 %	384120546
24	NC_017153	AT	3	6	22026	22031	50 %	50 %	0 %	0 %	384120547
25	NC_017153	AT	3	6	22082	22087	50 %	50 %	0 %	0 %	384120547
26	NC_017153	GA	3	6	22362	22367	50 %	0 %	50 %	0 %	384120547
27	NC_017153	AT	3	6	23205	23210	50 %	50 %	0 %	0 %	384120547
28	NC_017153	CG	3	6	23308	23313	0 %	0 %	50 %	50 %	384120547
29	NC_017153	AG	3	6	23396	23401	50 %	0 %	50 %	0 %	384120547
30	NC_017153	GC	3	6	24084	24089	0 %	0 %	50 %	50 %	384120548
31	NC_017153	CT	3	6	27152	27157	0 %	50 %	0 %	50 %	384120552
32	NC_017153	AG	3	6	28381	28386	50 %	0 %	50 %	0 %	384120554
33	NC_017153	CG	3	6	28941	28946	0 %	0 %	50 %	50 %	384120554
34	NC_017153	GC	3	6	29026	29031	0 %	0 %	50 %	50 %	384120554
35	NC_017153	CA	3	6	30124	30129	50 %	0 %	0 %	50 %	384120555
36	NC_017153	CT	3	6	31635	31640	0 %	50 %	0 %	50 %	384120557
37	NC_017153	GC	3	6	32042	32047	0 %	0 %	50 %	50 %	384120558
38	NC_017153	AT	3	6	32620	32625	50 %	50 %	0 %	0 %	384120558
39	NC_017153	CA	3	6	33752	33757	50 %	0 %	0 %	50 %	384120559
40	NC_017153	CT	3	6	33904	33909	0 %	50 %	0 %	50 %	384120559
41	NC_017153	TA	3	6	34229	34234	50 %	50 %	0 %	0 %	384120560
42	NC_017153	TC	3	6	34614	34619	0 %	50 %	0 %	50 %	384120560
43	NC_017153	GT	3	6	37581	37586	0 %	50 %	50 %	0 %	384120563
44	NC_017153	CG	3	6	37845	37850	0 %	0 %	50 %	50 %	384120564
45	NC_017153	AC	3	6	40372	40377	50 %	0 %	0 %	50 %	384120568
46	NC_017153	AG	3	6	41676	41681	50 %	0 %	50 %	0 %	384120570
47	NC_017153	TC	3	6	41903	41908	0 %	50 %	0 %	50 %	384120571
48	NC_017153	GC	3	6	41933	41938	0 %	0 %	50 %	50 %	384120571
49	NC_017153	GC	4	8	45987	45994	0 %	0 %	50 %	50 %	384120574
50	NC_017153	GT	3	6	46065	46070	0 %	50 %	50 %	0 %	384120574
51	NC_017153	CT	3	6	46421	46426	0 %	50 %	0 %	50 %	384120574
52	NC_017153	CT	3	6	46512	46517	0 %	50 %	0 %	50 %	384120574
53	NC_017153	TC	4	8	48557	48564	0 %	50 %	0 %	50 %	384120576
54	NC_017153	AT	3	6	49002	49007	50 %	50 %	0 %	0 %	384120576
55	NC_017153	TC	3	6	49579	49584	0 %	50 %	0 %	50 %	384120577
56	NC_017153	GC	3	6	50020	50025	0 %	0 %	50 %	50 %	384120577
57	NC_017153	GT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	50 %	0 %	384120577
58	NC_017153	GT	3	6	51038	51043	0 %	50 %	50 %	0 %	384120577
59	NC_017153	GT	3	6	51461	51466	0 %	50 %	50 %	0 %	384120577
60	NC_017153	AG	3	6	51536	51541	50 %	0 %	50 %	0 %	384120577
61	NC_017153	GC	3	6	51973	51978	0 %	0 %	50 %	50 %	384120578
62	NC_017153	CA	3	6	52080	52085	50 %	0 %	0 %	50 %	384120578
63	NC_017153	CA	3	6	52168	52173	50 %	0 %	0 %	50 %	384120578
64	NC_017153	GC	3	6	54517	54522	0 %	0 %	50 %	50 %	384120579
65	NC_017153	CG	3	6	55022	55027	0 %	0 %	50 %	50 %	384120579
66	NC_017153	TG	3	6	55166	55171	0 %	50 %	50 %	0 %	384120579
67	NC_017153	AT	3	6	56633	56638	50 %	50 %	0 %	0 %	384120580
68	NC_017153	CA	3	6	56645	56650	50 %	0 %	0 %	50 %	384120580
69	NC_017153	CG	3	6	57876	57881	0 %	0 %	50 %	50 %	384120582
70	NC_017153	TC	3	6	59255	59260	0 %	50 %	0 %	50 %	384120583
71	NC_017153	TG	3	6	60739	60744	0 %	50 %	50 %	0 %	384120584
72	NC_017153	TC	3	6	61217	61222	0 %	50 %	0 %	50 %	384120585
73	NC_017153	CG	3	6	63384	63389	0 %	0 %	50 %	50 %	384120586
74	NC_017153	GT	3	6	63626	63631	0 %	50 %	50 %	0 %	384120586
75	NC_017153	GA	3	6	63753	63758	50 %	0 %	50 %	0 %	384120586
76	NC_017153	TA	3	6	64157	64162	50 %	50 %	0 %	0 %	384120587
77	NC_017153	GA	3	6	65441	65446	50 %	0 %	50 %	0 %	384120589

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.