MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_030

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017151	ATGG	2	8	217	224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017151	TAAT	2	8	446	453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017151	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	384120458
4	NC_017151	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	384120458
5	NC_017151	CCAT	2	8	1089	1096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017151	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	384120459
7	NC_017151	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	384120460
8	NC_017151	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	384120460
9	NC_017151	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	384120460
10	NC_017151	GGCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017151	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	384120462
12	NC_017151	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	384120462
13	NC_017151	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	384120463
14	NC_017151	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	384120463
15	NC_017151	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	384120465
16	NC_017151	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	384120465
17	NC_017151	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	384120465
18	NC_017151	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	384120465
19	NC_017151	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384120465
20	NC_017151	CAAT	2	8	6727	6734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017151	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	384120467
22	NC_017151	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	384120469
23	NC_017151	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	384120470
24	NC_017151	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	384120470
25	NC_017151	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	384120471
26	NC_017151	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	384120471
27	NC_017151	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	384120472
28	NC_017151	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	384120473
29	NC_017151	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	384120474
30	NC_017151	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	384120474
31	NC_017151	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	384120474
32	NC_017151	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	384120474
33	NC_017151	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	384120474
34	NC_017151	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	384120474
35	NC_017151	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	384120475
36	NC_017151	TGCC	2	8	12770	12777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017151	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	384120476
38	NC_017151	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	384120479
39	NC_017151	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	384120479
40	NC_017151	AGAT	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017151	CGTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017151	GCTG	2	8	16574	16581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017151	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	384120481
44	NC_017151	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	384120483
45	NC_017151	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	384120484
46	NC_017151	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	384120487
47	NC_017151	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	384120487
48	NC_017151	GTGC	2	8	19975	19982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017151	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	384120490
50	NC_017151	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	384120490
51	NC_017151	AATC	2	8	20402	20409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017151	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
53	NC_017151	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	384120491
54	NC_017151	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	384120491
55	NC_017151	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
56	NC_017151	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	384120491
57	NC_017151	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	384120491
58	NC_017151	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	384120491
59	NC_017151	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
60	NC_017151	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	384120491
61	NC_017151	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	384120491
62	NC_017151	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	384120493
63	NC_017151	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	384120493
64	NC_017151	CTGT	2	8	24671	24678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017151	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	384120495
66	NC_017151	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	384120495
67	NC_017151	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	384120495
68	NC_017151	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	384120495
69	NC_017151	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	384120496
70	NC_017151	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	384120496
71	NC_017151	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	384120496
72	NC_017151	GAAC	2	8	27226	27233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017151	TAAG	2	8	27255	27262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017151	AGAA	2	8	27480	27487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017151	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	384120499
76	NC_017151	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	384120500
77	NC_017151	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	384120501
78	NC_017151	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	384120501
79	NC_017151	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	384120502
80	NC_017151	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	384120502
81	NC_017151	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	384120503
82	NC_017151	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	384120503
83	NC_017151	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	384120505
84	NC_017151	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	384120505
85	NC_017151	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	384120505
86	NC_017151	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	384120505
87	NC_017151	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	384120505
88	NC_017151	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	384120506
89	NC_017151	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	384120506
90	NC_017151	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	384120506
91	NC_017151	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	384120506
92	NC_017151	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	384120506
93	NC_017151	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	384120506
94	NC_017151	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	384120506
95	NC_017151	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	384120507
96	NC_017151	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	384120507
97	NC_017151	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	384120507
98	NC_017151	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	384120507
99	NC_017151	TCAG	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017151	GTTT	2	8	39389	39396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017151	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	384120509
102	NC_017151	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	384120510
103	NC_017151	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	384120510
104	NC_017151	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	384120511
105	NC_017151	GGCA	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017151	CTGT	2	8	41741	41748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017151	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	384120513
108	NC_017151	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	384120513
109	NC_017151	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	384120513
110	NC_017151	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	384120513
111	NC_017151	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	384120513
112	NC_017151	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	384120513
113	NC_017151	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	384120514
114	NC_017151	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	384120515
115	NC_017151	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	384120515
116	NC_017151	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	384120515
117	NC_017151	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	384120515
118	NC_017151	CAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017151	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	384120516
120	NC_017151	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	384120517
121	NC_017151	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	384120517
122	NC_017151	TTTC	2	8	48808	48815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017151	CTTA	2	8	49034	49041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017151	GTTC	2	8	49063	49070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.