MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_030

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017151	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017151	AG	3	6	1803	1808	50 %	0 %	50 %	0 %	384120460
3	NC_017151	CG	3	6	2006	2011	0 %	0 %	50 %	50 %	384120461
4	NC_017151	GC	3	6	2946	2951	0 %	0 %	50 %	50 %	384120462
5	NC_017151	CA	3	6	3024	3029	50 %	0 %	0 %	50 %	384120462
6	NC_017151	TC	3	6	3229	3234	0 %	50 %	0 %	50 %	384120463
7	NC_017151	GA	3	6	4103	4108	50 %	0 %	50 %	0 %	384120465
8	NC_017151	AC	3	6	4767	4772	50 %	0 %	0 %	50 %	384120465
9	NC_017151	GA	3	6	5357	5362	50 %	0 %	50 %	0 %	384120465
10	NC_017151	GA	3	6	5758	5763	50 %	0 %	50 %	0 %	384120465
11	NC_017151	GT	4	8	6265	6272	0 %	50 %	50 %	0 %	384120465
12	NC_017151	CT	4	8	6673	6680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017151	GC	3	6	6849	6854	0 %	0 %	50 %	50 %	384120467
14	NC_017151	CG	3	6	8875	8880	0 %	0 %	50 %	50 %	384120471
15	NC_017151	GC	4	8	10077	10084	0 %	0 %	50 %	50 %	384120473
16	NC_017151	TG	3	6	10309	10314	0 %	50 %	50 %	0 %	384120473
17	NC_017151	CT	3	6	12065	12070	0 %	50 %	0 %	50 %	384120475
18	NC_017151	CG	3	6	12126	12131	0 %	0 %	50 %	50 %	384120475
19	NC_017151	GC	3	6	12458	12463	0 %	0 %	50 %	50 %	384120475
20	NC_017151	GC	3	6	12846	12851	0 %	0 %	50 %	50 %	384120476
21	NC_017151	GC	3	6	12890	12895	0 %	0 %	50 %	50 %	384120476
22	NC_017151	CG	3	6	12928	12933	0 %	0 %	50 %	50 %	384120476
23	NC_017151	GC	3	6	13267	13272	0 %	0 %	50 %	50 %	384120476
24	NC_017151	AG	3	6	13421	13426	50 %	0 %	50 %	0 %	384120476
25	NC_017151	AC	4	8	13849	13856	50 %	0 %	0 %	50 %	384120477
26	NC_017151	AT	3	6	14218	14223	50 %	50 %	0 %	0 %	384120478
27	NC_017151	AC	3	6	15748	15753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017151	TC	3	6	15976	15981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017151	GT	3	6	16185	16190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017151	GC	3	6	16693	16698	0 %	0 %	50 %	50 %	384120480
31	NC_017151	GC	3	6	17198	17203	0 %	0 %	50 %	50 %	384120481
32	NC_017151	CG	3	6	19770	19775	0 %	0 %	50 %	50 %	384120489
33	NC_017151	CA	3	6	20368	20373	50 %	0 %	0 %	50 %	384120490
34	NC_017151	GC	3	6	20434	20439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017151	CG	3	6	20566	20571	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
36	NC_017151	GC	3	6	20663	20668	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
37	NC_017151	CG	3	6	20768	20773	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
38	NC_017151	CG	3	6	21180	21185	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
39	NC_017151	CG	4	8	21398	21405	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
40	NC_017151	CG	3	6	22202	22207	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
41	NC_017151	CG	3	6	22725	22730	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
42	NC_017151	TC	3	6	22985	22990	0 %	50 %	0 %	50 %	384120491
43	NC_017151	GC	3	6	23293	23298	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
44	NC_017151	CG	3	6	23552	23557	0 %	0 %	50 %	50 %	384120491
45	NC_017151	CG	3	6	25180	25185	0 %	0 %	50 %	50 %	384120495
46	NC_017151	GC	3	6	25593	25598	0 %	0 %	50 %	50 %	384120495
47	NC_017151	TG	3	6	27015	27020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017151	GT	3	6	27328	27333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017151	GT	3	6	27780	27785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017151	TG	3	6	27808	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017151	AG	3	6	27821	27826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017151	CT	3	6	27877	27882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017151	GA	3	6	29168	29173	50 %	0 %	50 %	0 %	384120500
54	NC_017151	GC	3	6	29562	29567	0 %	0 %	50 %	50 %	384120501
55	NC_017151	CG	3	6	31092	31097	0 %	0 %	50 %	50 %	384120503
56	NC_017151	CT	3	6	32616	32621	0 %	50 %	0 %	50 %	384120505
57	NC_017151	GC	3	6	32637	32642	0 %	0 %	50 %	50 %	384120505
58	NC_017151	AG	3	6	35002	35007	50 %	0 %	50 %	0 %	384120506
59	NC_017151	AT	3	6	35024	35029	50 %	50 %	0 %	0 %	384120506
60	NC_017151	AT	3	6	35307	35312	50 %	50 %	0 %	0 %	384120506
61	NC_017151	TC	3	6	35372	35377	0 %	50 %	0 %	50 %	384120506
62	NC_017151	CG	3	6	36090	36095	0 %	0 %	50 %	50 %	384120506
63	NC_017151	GC	3	6	36776	36781	0 %	0 %	50 %	50 %	384120506
64	NC_017151	CG	3	6	37479	37484	0 %	0 %	50 %	50 %	384120507
65	NC_017151	TC	3	6	39088	39093	0 %	50 %	0 %	50 %	384120508
66	NC_017151	TG	3	6	39300	39305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017151	CG	3	6	39690	39695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017151	GC	5	10	40742	40751	0 %	0 %	50 %	50 %	384120511
69	NC_017151	CG	3	6	41429	41434	0 %	0 %	50 %	50 %	384120512
70	NC_017151	CG	3	6	42250	42255	0 %	0 %	50 %	50 %	384120513
71	NC_017151	GA	3	6	43885	43890	50 %	0 %	50 %	0 %	384120515
72	NC_017151	AC	3	6	44549	44554	50 %	0 %	0 %	50 %	384120515
73	NC_017151	GA	3	6	45139	45144	50 %	0 %	50 %	0 %	384120515
74	NC_017151	CT	4	8	46020	46027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017151	GC	3	6	46435	46440	0 %	0 %	50 %	50 %	384120516
76	NC_017151	GA	3	6	48413	48418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017151	CT	3	6	48470	48475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017151	CA	3	6	48483	48488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017151	AC	3	6	48511	48516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017151	AC	3	6	48963	48968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017151	AC	3	6	49275	49280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.