MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C

Total Repeats: 1134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017150	CCTAAC	2	12	2457250	2457261	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120133
1002	NC_017150	GCTGCG	2	12	2461993	2462004	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384120139
1003	NC_017150	TGCAGG	2	12	2463188	2463199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384120141
1004	NC_017150	ATGTGC	2	12	2463578	2463589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120141
1005	NC_017150	CCGCTT	2	12	2464952	2464963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384120143
1006	NC_017150	GCAATA	2	12	2465047	2465058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384120143
1007	NC_017150	CACACC	2	12	2465832	2465843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120143
1008	NC_017150	TGGATG	2	12	2467176	2467187	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384120145
1009	NC_017150	GCCTGC	2	12	2469925	2469936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384120147
1010	NC_017150	CATCCA	2	12	2475572	2475583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120151
1011	NC_017150	GCAATA	2	12	2478253	2478264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384120153
1012	NC_017150	GCCAAC	2	12	2478725	2478736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384120153
1013	NC_017150	CCACGC	2	12	2485799	2485810	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384120159
1014	NC_017150	CCCTGC	2	12	2489099	2489110	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384120161
1015	NC_017150	CATCCA	2	12	2491505	2491516	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120163
1016	NC_017150	AGCTTC	2	12	2495625	2495636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017150	GACAGA	2	12	2500474	2500485	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384120171
1018	NC_017150	CATCCA	2	12	2501750	2501761	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120172
1019	NC_017150	GATCCT	2	12	2504179	2504190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120175
1020	NC_017150	CATCCA	2	12	2505765	2505776	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120177
1021	NC_017150	TGCAGT	2	12	2509401	2509412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120182
1022	NC_017150	TGGATG	2	12	2513387	2513398	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384120188
1023	NC_017150	ACGTCA	2	12	2514522	2514533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017150	CTCGCC	2	12	2517040	2517051	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017150	CTTCCA	2	12	2523096	2523107	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384120192
1026	NC_017150	ACATCC	2	12	2523137	2523148	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120192
1027	NC_017150	CCAACC	2	12	2525760	2525771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120196
1028	NC_017150	CTGCAT	2	12	2526482	2526493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120197
1029	NC_017150	ACATCT	2	12	2527969	2527980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120198
1030	NC_017150	CTGCCG	2	12	2529725	2529736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384120198
1031	NC_017150	TCTGCA	2	12	2530906	2530917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120200
1032	NC_017150	CATCCA	2	12	2531300	2531311	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120200
1033	NC_017150	CGGCCA	2	12	2539624	2539635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384120207
1034	NC_017150	AACCCA	2	12	2542545	2542556	50 %	0 %	0 %	50 %	384120209
1035	NC_017150	GTTCCG	2	12	2543556	2543567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120210
1036	NC_017150	CTGCTT	2	12	2544619	2544630	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384120210
1037	NC_017150	AGCTTT	2	12	2550959	2550970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384120217
1038	NC_017150	ACCTGC	2	12	2552195	2552206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_017150	GATGCC	2	12	2556775	2556786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384120220
1040	NC_017150	CACCAA	2	12	2558079	2558090	50 %	0 %	0 %	50 %	384120222
1041	NC_017150	CAAGCC	2	12	2559276	2559287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384120222
1042	NC_017150	AGCATC	2	12	2559511	2559522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120222
1043	NC_017150	CTGGAT	2	12	2564348	2564359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120226
1044	NC_017150	CTGCTT	2	12	2568398	2568409	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384120228
1045	NC_017150	GGCCTT	2	12	2568981	2568992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120229
1046	NC_017150	CACATC	2	12	2572148	2572159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120231
1047	NC_017150	GCTTCT	2	12	2577239	2577250	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384120235
1048	NC_017150	CACCCA	2	12	2579769	2579780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120240
1049	NC_017150	GCCAAT	2	12	2581013	2581024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120241
1050	NC_017150	ACTTTC	2	12	2584274	2584285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384120244
1051	NC_017150	CCGGAT	2	12	2585381	2585392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017150	CCCTCT	2	12	2592034	2592045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120250
1053	NC_017150	TGGATA	2	12	2597924	2597935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120256
1054	NC_017150	ATGGCG	2	12	2608166	2608177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384120267
1055	NC_017150	TCGCTG	2	12	2608810	2608821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017150	GCTTGC	2	12	2608956	2608967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017150	CCAGAA	2	12	2614810	2614821	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384120273
1058	NC_017150	GAACGC	2	12	2617554	2617565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120277
1059	NC_017150	GTTTTC	2	12	2617777	2617788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384120277
1060	NC_017150	GCGGAC	2	12	2618550	2618561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384120277
1061	NC_017150	ACGCAG	2	12	2619064	2619075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120277
1062	NC_017150	CGGCTT	2	12	2619318	2619329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120277
1063	NC_017150	TCTTCC	2	12	2619347	2619358	0 %	50 %	0 %	50 %	384120277
1064	NC_017150	CTGATC	2	12	2619694	2619705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120277
1065	NC_017150	CAACTT	2	12	2625191	2625202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120283
1066	NC_017150	ATGCCA	2	12	2632687	2632698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120288
1067	NC_017150	TCCCAC	2	12	2636056	2636067	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384120292
1068	NC_017150	CCGGCA	2	12	2638560	2638571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384120295
1069	NC_017150	CTCATC	2	12	2641047	2641058	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384120297
1070	NC_017150	AAGCGC	2	12	2655229	2655240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120310
1071	NC_017150	GAAACC	2	12	2655765	2655776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384120311
1072	NC_017150	TTCGGA	2	12	2659288	2659299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120314
1073	NC_017150	TCTGCC	2	12	2662279	2662290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384120316
1074	NC_017150	TGGATG	2	12	2668620	2668631	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384120322
1075	NC_017150	ATTGCC	2	12	2670946	2670957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120324
1076	NC_017150	CTCGCC	2	12	2673500	2673511	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017150	CCGCAG	2	12	2680655	2680666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384120327
1078	NC_017150	GCACAT	2	12	2680697	2680708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120327
1079	NC_017150	CACCCA	2	12	2685839	2685850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120332
1080	NC_017150	CCAATG	2	12	2688329	2688340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120334
1081	NC_017150	CGAAGG	2	12	2692784	2692795	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384120340
1082	NC_017150	TCTTAC	2	12	2694399	2694410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017150	TGAAGA	2	12	2694569	2694580	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384120342
1084	NC_017150	ACATCA	2	12	2695938	2695949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384120343
1085	NC_017150	GGGAAA	2	12	2696069	2696080	50 %	0 %	50 %	0 %	384120343
1086	NC_017150	ATTTTA	2	12	2696513	2696524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017150	CCCTTC	2	12	2697455	2697466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120345
1088	NC_017150	TGGATG	2	12	2699250	2699261	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384120347
1089	NC_017150	TTTCCT	2	12	2700360	2700371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120348
1090	NC_017150	ACCGCC	2	12	2705109	2705120	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384120352
1091	NC_017150	GCCATA	2	12	2705289	2705300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120352
1092	NC_017150	CTTTTT	2	12	2713503	2713514	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1093	NC_017150	TGAGCA	2	12	2714115	2714126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384120359
1094	NC_017150	TTTGAC	2	12	2714237	2714248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384120360
1095	NC_017150	CTTTGG	2	12	2717838	2717849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384120362
1096	NC_017150	ACGATG	2	12	2718684	2718695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384120362
1097	NC_017150	GATACA	2	12	2719141	2719152	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384120363
1098	NC_017150	ACATCT	2	12	2720281	2720292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120364
1099	NC_017150	AGCCCC	2	12	2724695	2724706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384120369
1100	NC_017150	CATCCA	2	12	2724964	2724975	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120369
1101	NC_017150	CAACAG	2	12	2727770	2727781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384120372
1102	NC_017150	CAGCCT	2	12	2734705	2734716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384120376
1103	NC_017150	AAATAA	2	12	2734783	2734794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384120376
1104	NC_017150	GCAGAA	2	12	2735292	2735303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384120376
1105	NC_017150	ACCTTC	2	12	2737624	2737635	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384120377
1106	NC_017150	TCTTCC	2	12	2742929	2742940	0 %	50 %	0 %	50 %	384120382
1107	NC_017150	AAACGC	2	12	2745532	2745543	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384120383
1108	NC_017150	TTGCCA	2	12	2746879	2746890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120384
1109	NC_017150	CTGCAC	2	12	2748006	2748017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384120386
1110	NC_017150	GCTTCT	2	12	2751544	2751555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017150	CAACCT	2	12	2751682	2751693	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384120390
1112	NC_017150	ATCAGC	2	12	2754015	2754026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120393
1113	NC_017150	TACGGT	2	12	2754616	2754627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120394
1114	NC_017150	CCCGGT	2	12	2755137	2755148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384120395
1115	NC_017150	GCCTGC	2	12	2755482	2755493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384120395
1116	NC_017150	CCGAAG	2	12	2758426	2758437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120396
1117	NC_017150	CCAAAT	2	12	2759094	2759105	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384120397
1118	NC_017150	TGGCTA	2	12	2759853	2759864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120397
1119	NC_017150	CCATTA	2	12	2764810	2764821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120402
1120	NC_017150	GCATCA	2	12	2766773	2766784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120405
1121	NC_017150	GTGTGC	2	12	2773694	2773705	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384120412
1122	NC_017150	CTGTGA	2	12	2774619	2774630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120412
1123	NC_017150	TAATCA	2	12	2775056	2775067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384120413
1124	NC_017150	CATTAC	2	12	2775852	2775863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120413
1125	NC_017150	AGCACC	2	12	2775919	2775930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384120413
1126	NC_017150	TCCTTT	2	12	2776340	2776351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017150	ACCAAT	2	12	2779156	2779167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384120414
1128	NC_017150	GCCTAT	2	12	2779300	2779311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384120414
1129	NC_017150	TGAACC	2	12	2790969	2790980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120427
1130	NC_017150	TTTCCG	2	12	2796741	2796752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384120432
1131	NC_017150	CCCCAG	2	12	2797332	2797343	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384120433
1132	NC_017150	CCCCAT	2	12	2797404	2797415	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384120433
1133	NC_017150	TTTTAT	2	12	2798942	2798953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384120435
1134	NC_017150	CAAAAT	2	12	2804148	2804159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384120441

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.